Protein–RNA interactions for Protein: Q3USL1

Klhdc9, Kelch domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc9Q3USL1 1700129C05Rik-202ENSMUST00000159858 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Klhdc9Q3USL1 Gm9064-201ENSMUST00000163579 566 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Klhdc9Q3USL1 Gm28455-201ENSMUST00000189105 1290 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Klhdc9Q3USL1 1700031M16Rik-205ENSMUST00000189907 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Klhdc9Q3USL1 Gm37689-201ENSMUST00000193139 275 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Klhdc9Q3USL1 Cfhr2-202ENSMUST00000194186 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Klhdc9Q3USL1 Gm44265-201ENSMUST00000203631 465 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Klhdc9Q3USL1 1600020E01Rik-208ENSMUST00000205028 329 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Klhdc9Q3USL1 Gm44226-201ENSMUST00000205203 1195 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Klhdc9Q3USL1 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Klhdc9Q3USL1 Gm33838-201ENSMUST00000214038 786 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Klhdc9Q3USL1 Tgm4-206ENSMUST00000215247 951 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Klhdc9Q3USL1 AC163621.3-201ENSMUST00000221738 1033 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Klhdc9Q3USL1 Elk3-205ENSMUST00000223340 750 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Klhdc9Q3USL1 Gm3510-201ENSMUST00000180447 1455 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Klhdc9Q3USL1 Gm13040-201ENSMUST00000094521 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Klhdc9Q3USL1 Gm14762-201ENSMUST00000105109 1771 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Klhdc9Q3USL1 Dcn-202ENSMUST00000163448 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Klhdc9Q3USL1 Gm45017-201ENSMUST00000206842 1777 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Klhdc9Q3USL1 5330413P13Rik-203ENSMUST00000150466 2173 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Klhdc9Q3USL1 Gm28667-201ENSMUST00000189873 2171 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Klhdc9Q3USL1 Gm14471-201ENSMUST00000141035 2358 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Klhdc9Q3USL1 Gm37525-201ENSMUST00000193499 2871 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Klhdc9Q3USL1 Vmn1r22-201ENSMUST00000227342 3057 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Klhdc9Q3USL1 Vmn1r22-204ENSMUST00000228257 3079 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Klhdc9Q3USL1 Olfr982-201ENSMUST00000054051 5576 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Klhdc9Q3USL1 Kcnc2-202ENSMUST00000218445 4033 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Klhdc9Q3USL1 Tgtp1-201ENSMUST00000068063 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Klhdc9Q3USL1 Gm18409-201ENSMUST00000218988 2506 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Klhdc9Q3USL1 Gja6-201ENSMUST00000069417 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Klhdc9Q3USL1 Rpp40-201ENSMUST00000171686 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Klhdc9Q3USL1 Gm37289-201ENSMUST00000195409 1402 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Klhdc9Q3USL1 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Klhdc9Q3USL1 Trdc-201ENSMUST00000196323 3865 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Klhdc9Q3USL1 Synj2-204ENSMUST00000115785 3778 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
Klhdc9Q3USL1 Rbbp6-202ENSMUST00000071590 5728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.16
Klhdc9Q3USL1 Slc4a4-202ENSMUST00000113218 3269 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
Klhdc9Q3USL1 Bbx-208ENSMUST00000138166 8743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
Klhdc9Q3USL1 A830010M20Rik-203ENSMUST00000100951 4545 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.16
Klhdc9Q3USL1 Zfp397-201ENSMUST00000060762 5472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Klhdc9Q3USL1 Mms19-217ENSMUST00000171561 6607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Klhdc9Q3USL1 9330199G10Rik-201ENSMUST00000221601 2072 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Klhdc9Q3USL1 A630072L19Rik-201ENSMUST00000180617 3405 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Klhdc9Q3USL1 Gm43876-201ENSMUST00000203831 3229 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Klhdc9Q3USL1 Slc26a2-201ENSMUST00000037603 2802 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Klhdc9Q3USL1 AC158988.1-201ENSMUST00000226731 2624 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Klhdc9Q3USL1 Bbx-205ENSMUST00000114488 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Klhdc9Q3USL1 Sfmbt2-205ENSMUST00000116594 7821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Klhdc9Q3USL1 Gm37772-201ENSMUST00000191635 1394 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Klhdc9Q3USL1 Traj18-201ENSMUST00000103723 66 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Klhdc9Q3USL1 Gm25346-201ENSMUST00000104509 128 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Klhdc9Q3USL1 Il12a-202ENSMUST00000107816 1268 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Klhdc9Q3USL1 Spin2-ps2-201ENSMUST00000116186 778 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Klhdc9Q3USL1 Gm22953-201ENSMUST00000116724 101 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Klhdc9Q3USL1 Gm15621-201ENSMUST00000119162 364 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Klhdc9Q3USL1 Gm7113-201ENSMUST00000120477 958 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Klhdc9Q3USL1 Gm8648-201ENSMUST00000122457 221 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Klhdc9Q3USL1 1700054M17Rik-201ENSMUST00000125654 445 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Klhdc9Q3USL1 Gm10658-201ENSMUST00000128125 1241 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Klhdc9Q3USL1 Gm11940-201ENSMUST00000153599 417 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Klhdc9Q3USL1 Gm13727-201ENSMUST00000154480 424 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Klhdc9Q3USL1 Gm12963-203ENSMUST00000156271 388 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Klhdc9Q3USL1 Ighv2-6-201ENSMUST00000179657 350 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Klhdc9Q3USL1 Rpl9-ps1-202ENSMUST00000182502 576 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Klhdc9Q3USL1 Kif14-203ENSMUST00000189413 8943 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Klhdc9Q3USL1 Gm36448-201ENSMUST00000199916 438 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Klhdc9Q3USL1 Olfr181-203ENSMUST00000205742 1104 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Klhdc9Q3USL1 Mobp-206ENSMUST00000214943 435 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Klhdc9Q3USL1 Olfr532-201ENSMUST00000073226 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Klhdc9Q3USL1 Sfmbt2-201ENSMUST00000041105 7874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Klhdc9Q3USL1 Usp7-207ENSMUST00000160405 4745 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Klhdc9Q3USL1 Mum1l1-203ENSMUST00000113043 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Klhdc9Q3USL1 Rabep1-202ENSMUST00000081362 2469 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Klhdc9Q3USL1 Serpind1-201ENSMUST00000023450 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Klhdc9Q3USL1 Olfr429-202ENSMUST00000216346 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Klhdc9Q3USL1 Eif4a2-203ENSMUST00000115341 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Klhdc9Q3USL1 Zfp941-202ENSMUST00000106052 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Klhdc9Q3USL1 Ganab-201ENSMUST00000096246 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Klhdc9Q3USL1 AC159195.2-201ENSMUST00000223670 3757 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Klhdc9Q3USL1 Lcp1-206ENSMUST00000131802 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Klhdc9Q3USL1 Fam227a-203ENSMUST00000109648 5187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Klhdc9Q3USL1 Olfr449-204ENSMUST00000214687 1921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Klhdc9Q3USL1 Obox2-201ENSMUST00000036575 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Klhdc9Q3USL1 Dleu2-207ENSMUST00000182756 3530 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Klhdc9Q3USL1 Gm15903-202ENSMUST00000199631 3518 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Klhdc9Q3USL1 Muc4-201ENSMUST00000096106 11277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Klhdc9Q3USL1 Ppp3cc-203ENSMUST00000228911 1836 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Klhdc9Q3USL1 Cyp2c39-201ENSMUST00000025968 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Klhdc9Q3USL1 Gm37518-201ENSMUST00000194930 2603 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Klhdc9Q3USL1 Mageb18-202ENSMUST00000113955 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Klhdc9Q3USL1 Smad5-201ENSMUST00000069557 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Klhdc9Q3USL1 Gm45297-201ENSMUST00000209893 3483 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Klhdc9Q3USL1 Olfr358-201ENSMUST00000100146 1059 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Klhdc9Q3USL1 Mir680-1-201ENSMUST00000102257 109 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Klhdc9Q3USL1 Igkv9-120-201ENSMUST00000103316 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Klhdc9Q3USL1 Gm11256-201ENSMUST00000118109 829 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Klhdc9Q3USL1 Rpl5-ps2-201ENSMUST00000119057 891 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Klhdc9Q3USL1 Gm12630-201ENSMUST00000121575 784 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Klhdc9Q3USL1 Gm15503-201ENSMUST00000141541 449 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Klhdc9Q3USL1 Gm25219-201ENSMUST00000157545 330 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms