Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm4886-201ENSMUST00000121874 1176 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 2610204G07Rik-201ENSMUST00000131215 992 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Crisp2-203ENSMUST00000131699 538 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Mpped2-201ENSMUST00000016530 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm4373-201ENSMUST00000178571 556 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm21614-201ENSMUST00000183260 1005 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm27804-201ENSMUST00000185135 119 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm28739-201ENSMUST00000185415 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm28219-201ENSMUST00000185452 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm28542-201ENSMUST00000185545 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm28303-201ENSMUST00000185642 747 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm29244-201ENSMUST00000185825 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm29437-201ENSMUST00000185865 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm29412-201ENSMUST00000185869 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm28910-201ENSMUST00000185921 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm28812-201ENSMUST00000185963 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm29468-201ENSMUST00000185978 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm28335-201ENSMUST00000186204 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm28854-201ENSMUST00000186218 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm28636-201ENSMUST00000186353 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm28452-201ENSMUST00000186623 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm29298-201ENSMUST00000186704 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm28185-201ENSMUST00000186815 694 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm28227-201ENSMUST00000186862 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm28796-201ENSMUST00000186905 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm29659-201ENSMUST00000187063 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm28473-201ENSMUST00000187325 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm28558-201ENSMUST00000187373 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm28682-201ENSMUST00000187430 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm28738-201ENSMUST00000187480 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm28949-201ENSMUST00000187805 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm28773-201ENSMUST00000187925 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm29319-201ENSMUST00000188060 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm29422-201ENSMUST00000188062 694 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm28734-201ENSMUST00000188104 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm28787-201ENSMUST00000188357 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm29312-201ENSMUST00000188724 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm29451-201ENSMUST00000188862 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm29637-201ENSMUST00000188877 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm29033-201ENSMUST00000189114 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm29614-201ENSMUST00000189263 694 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm28751-201ENSMUST00000189287 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm29559-201ENSMUST00000189412 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm28272-201ENSMUST00000189512 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm28483-201ENSMUST00000189519 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm28123-201ENSMUST00000189725 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm28368-201ENSMUST00000189804 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm29119-201ENSMUST00000189973 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm28716-201ENSMUST00000190217 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm29239-201ENSMUST00000190304 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm28837-201ENSMUST00000190397 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm28968-201ENSMUST00000190413 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm28531-201ENSMUST00000190529 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm28165-201ENSMUST00000190669 694 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm29181-201ENSMUST00000191288 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm38229-201ENSMUST00000191931 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm32347-201ENSMUST00000192944 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm38121-201ENSMUST00000193213 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm38035-201ENSMUST00000194427 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm38350-201ENSMUST00000194789 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm37990-201ENSMUST00000195821 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm7452-201ENSMUST00000200764 788 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Tespa1-202ENSMUST00000217702 1102 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 5033421B08Rik-202ENSMUST00000219595 1194 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 AC126554.3-201ENSMUST00000223131 493 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Olfr1386-201ENSMUST00000071905 1128 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Olfr376-201ENSMUST00000078952 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Mrgprb5-201ENSMUST00000094389 1037 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Olfr633-201ENSMUST00000098188 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 A430110C17Rik-201ENSMUST00000195666 4348 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 AC153729.1-201ENSMUST00000214055 2562 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Rgs22-203ENSMUST00000172831 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Parn-201ENSMUST00000058884 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Prrg1-201ENSMUST00000114024 3900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm5702-201ENSMUST00000185629 2469 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Olfr435-202ENSMUST00000215565 2491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 AC160966.1-202ENSMUST00000216860 1318 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Teddm1b-201ENSMUST00000055314 2527 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm15093-201ENSMUST00000179021 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 AC118639.1-203ENSMUST00000228425 2016 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Olfr462-203ENSMUST00000213928 5598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Chil3-201ENSMUST00000063062 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Chil4-201ENSMUST00000082219 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Eci2-203ENSMUST00000110251 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gimap9-201ENSMUST00000054050 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Uspl1-203ENSMUST00000117878 2931 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Mum1l1-201ENSMUST00000113041 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Olfr313-202ENSMUST00000217506 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gbp3-202ENSMUST00000106221 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm37653-201ENSMUST00000195401 3578 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Myh8-202ENSMUST00000108685 2306 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Impg2-204ENSMUST00000160116 3992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Pik3ca-202ENSMUST00000108242 6171 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Ighv14-4-201ENSMUST00000103475 333 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm13754-201ENSMUST00000120486 998 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm11370-201ENSMUST00000120583 260 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Rps19-ps14-201ENSMUST00000121832 269 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 BC064078-201ENSMUST00000122939 570 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 BB218582-201ENSMUST00000123623 1024 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
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