Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Gm28880-201ENSMUST00000190161 2160 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 AC123705.1-201ENSMUST00000222512 2058 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Hsd11b1-201ENSMUST00000016338 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 1700007E05Rik-201ENSMUST00000186196 1513 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Gm28394-201ENSMUST00000186805 1495 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Gm28570-201ENSMUST00000188300 1495 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 6720489N17Rik-203ENSMUST00000223338 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Gm13106-201ENSMUST00000119045 1443 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Olfr726-207ENSMUST00000217319 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Gm15422-201ENSMUST00000117453 541 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Gm13414-201ENSMUST00000117516 727 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Gm15176-201ENSMUST00000117734 135 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Gm13501-201ENSMUST00000118477 979 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Gm11926-201ENSMUST00000118520 430 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Gm8916-201ENSMUST00000119732 949 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Gm11404-201ENSMUST00000120872 494 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Pla2g2a-203ENSMUST00000135748 788 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Gm23207-201ENSMUST00000158665 102 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Gm15740-201ENSMUST00000159703 1292 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Gm21756-201ENSMUST00000178380 930 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Gm21405-201ENSMUST00000179024 930 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Gm26959-201ENSMUST00000182376 978 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Gm20897-201ENSMUST00000185240 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Gm20883-201ENSMUST00000185245 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Gm20916-202ENSMUST00000185338 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Gm28897-201ENSMUST00000185340 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Gm20736-202ENSMUST00000185550 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Gm20835-201ENSMUST00000185565 923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Gm29564-201ENSMUST00000185575 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Gm29299-201ENSMUST00000185609 923 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Gm21317-201ENSMUST00000185636 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Gm21858-202ENSMUST00000185713 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Gm28553-201ENSMUST00000185924 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Gm20908-201ENSMUST00000186004 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Gm21409-201ENSMUST00000186110 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Gm28998-201ENSMUST00000186194 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Gm21191-201ENSMUST00000186484 930 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Gm20906-201ENSMUST00000186493 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Gm4412-201ENSMUST00000186660 433 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Gm20824-201ENSMUST00000186739 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Gm28881-201ENSMUST00000187710 470 ntTSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Gm28576-201ENSMUST00000189007 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Gm21497-201ENSMUST00000189455 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Gm28919-201ENSMUST00000190026 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Gm28961-201ENSMUST00000190573 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Gm29503-201ENSMUST00000191044 930 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Gm21865-202ENSMUST00000191443 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Gm7341-201ENSMUST00000192183 926 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Gm30737-201ENSMUST00000192683 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Gm37294-201ENSMUST00000193461 494 ntTSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Gm35134-201ENSMUST00000194086 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Lamtor3-203ENSMUST00000197064 733 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 2010309G21Rik-201ENSMUST00000198927 458 ntTSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Gm44234-201ENSMUST00000204246 900 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Olfr97-202ENSMUST00000207414 933 ntAPPRIS P1 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 AC153937.2-201ENSMUST00000218485 632 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 1810014B01Rik-204ENSMUST00000218536 204 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 AC164116.1-201ENSMUST00000225810 622 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 AC154738.2-201ENSMUST00000227403 1110 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Tmed11-201ENSMUST00000004943 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Ino80c-201ENSMUST00000055012 909 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Olfr820-201ENSMUST00000059244 1061 ntAPPRIS P1 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Olfr1262-201ENSMUST00000061701 1024 ntAPPRIS P1 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Olfr420-201ENSMUST00000068403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Olfr743-201ENSMUST00000071294 936 ntAPPRIS P1 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Prl3d3-201ENSMUST00000073601 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Nedd1P33215 Vmn1r80-201ENSMUST00000075053 927 ntAPPRIS P1 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.5 ms