Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Rslcan18-201ENSMUST00000091526 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gja6-201ENSMUST00000069417 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
RxraP28700 Aox1-201ENSMUST00000001027 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
RxraP28700 Akap9-201ENSMUST00000044492 13123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
RxraP28700 Olfr66-202ENSMUST00000216303 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
RxraP28700 5830432E09Rik-201ENSMUST00000180693 3569 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm44231-201ENSMUST00000204106 4075 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm26981-201ENSMUST00000182453 3169 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
RxraP28700 Cd44-207ENSMUST00000111194 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
RxraP28700 Cd244-201ENSMUST00000004829 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm42668-201ENSMUST00000200747 2487 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
RxraP28700 Chl1-206ENSMUST00000205098 2464 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
RxraP28700 Rps15a-207ENSMUST00000172457 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
RxraP28700 Ms4a4c-201ENSMUST00000072729 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
RxraP28700 Obox2-201ENSMUST00000036575 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
RxraP28700 Olfr1106-202ENSMUST00000213781 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
RxraP28700 Olfr1106-203ENSMUST00000217650 2573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
RxraP28700 2610044O15Rik8-202ENSMUST00000186619 2337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
RxraP28700 Hsp90aa1-201ENSMUST00000021698 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
RxraP28700 AC117232.2-201ENSMUST00000219469 2917 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
RxraP28700 Vmn1r90-201ENSMUST00000185220 7144 ntAPPRIS P2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
RxraP28700 Plch1-206ENSMUST00000159676 6560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
RxraP28700 Olfr1457-203ENSMUST00000214561 1829 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
RxraP28700 Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 5228 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm25498-201ENSMUST00000104424 129 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
RxraP28700 Ccdc47-202ENSMUST00000106865 704 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
RxraP28700 Serpina3h-202ENSMUST00000116393 1226 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
RxraP28700 Zfp616-203ENSMUST00000116546 531 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm9506-201ENSMUST00000118516 320 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm12720-201ENSMUST00000123834 472 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm12145-201ENSMUST00000142108 217 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
RxraP28700 Tbata-208ENSMUST00000143207 982 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm12371-201ENSMUST00000144029 1091 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
RxraP28700 Stau2-209ENSMUST00000145092 564 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
RxraP28700 1700001G01Rik-204ENSMUST00000153022 928 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm16573-201ENSMUST00000160334 801 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
RxraP28700 Rpp14-202ENSMUST00000180369 477 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
RxraP28700 4930467D21Rik-202ENSMUST00000181724 570 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm27026-201ENSMUST00000183003 892 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
RxraP28700 1500004A13Rik-207ENSMUST00000184640 610 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
RxraP28700 Ighv6-2-201ENSMUST00000192430 295 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm37068-201ENSMUST00000195168 640 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm30517-201ENSMUST00000197350 772 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
RxraP28700 4930465I24Rik-201ENSMUST00000209697 426 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm45864-201ENSMUST00000211965 1019 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm18655-201ENSMUST00000214802 1090 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
RxraP28700 AC155941.3-201ENSMUST00000218476 308 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
RxraP28700 AC132384.6-201ENSMUST00000218976 1206 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
RxraP28700 Tbca-204ENSMUST00000220825 497 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
RxraP28700 AC116502.1-201ENSMUST00000220989 291 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm9472-201ENSMUST00000221625 526 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm10126-201ENSMUST00000221732 168 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
RxraP28700 AC156790.1-201ENSMUST00000226572 559 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
RxraP28700 Nemf-201ENSMUST00000021368 4732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
RxraP28700 Xpnpep3-203ENSMUST00000163754 5383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
RxraP28700 4921518K17Rik-201ENSMUST00000143949 3390 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm15348-201ENSMUST00000151188 3655 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
RxraP28700 Kcne3-203ENSMUST00000178946 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
RxraP28700 Sbf2-208ENSMUST00000166020 5481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
RxraP28700 Ctage5-209ENSMUST00000175912 2885 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm16973-202ENSMUST00000180752 1972 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
RxraP28700 Daw1-203ENSMUST00000113436 1351 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
RxraP28700 Cd200r4-202ENSMUST00000176321 2005 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
RxraP28700 Mob1b-202ENSMUST00000113229 8967 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
RxraP28700 Vmn2r-ps139-201ENSMUST00000190764 2057 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
RxraP28700 Wdr35-202ENSMUST00000111113 4312 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm3424-201ENSMUST00000164585 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm3182-201ENSMUST00000167902 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm8246-202ENSMUST00000180788 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm10555-201ENSMUST00000193178 1791 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
RxraP28700 AL607131.1-201ENSMUST00000222575 1835 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
RxraP28700 Alg11-202ENSMUST00000110737 4833 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
RxraP28700 Nckap5-204ENSMUST00000112583 7212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
RxraP28700 Olfr311-203ENSMUST00000216473 2961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
RxraP28700 4933409F18Rik-202ENSMUST00000222026 1584 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
RxraP28700 Olfr1410-203ENSMUST00000217316 7927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
RxraP28700 Vmn1r188-203ENSMUST00000228243 8473 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
RxraP28700 Olfr610-203ENSMUST00000217627 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm23485-201ENSMUST00000104181 155 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
RxraP28700 Ggact-202ENSMUST00000110679 686 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
RxraP28700 Kat6b-203ENSMUST00000112458 997 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
RxraP28700 Rpl12-ps1-201ENSMUST00000116168 498 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm13798-201ENSMUST00000118285 139 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm13702-201ENSMUST00000118542 825 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm12189-201ENSMUST00000119779 912 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm15158-201ENSMUST00000120577 570 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm23392-201ENSMUST00000157580 113 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm23276-201ENSMUST00000157913 138 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm17217-201ENSMUST00000166613 469 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
RxraP28700 Obox3-ps3-201ENSMUST00000177242 1004 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm2058-201ENSMUST00000178791 560 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm26570-201ENSMUST00000180672 342 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm17786-201ENSMUST00000182000 427 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm8245-201ENSMUST00000182434 987 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
RxraP28700 Mir6972-201ENSMUST00000184774 64 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
RxraP28700 1700006H21Rik-201ENSMUST00000188490 627 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
RxraP28700 Zfp799-203ENSMUST00000201876 632 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm42673-201ENSMUST00000202676 337 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm44036-201ENSMUST00000204551 336 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm45045-201ENSMUST00000207368 218 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
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