Protein–RNA interactions for Protein: L7MTU6

Ifnab, Interferon alpha B, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnabL7MTU6 Dnase1-202ENSMUST00000120009 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Gm11581-201ENSMUST00000122024 763 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 1700026D11Rik-203ENSMUST00000144501 535 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Gm7546-201ENSMUST00000146119 966 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Gm13179-202ENSMUST00000151994 978 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Gm24286-201ENSMUST00000157632 128 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Atxn3-205ENSMUST00000161011 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Pde1c-208ENSMUST00000170774 2132 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Obox3-ps3-201ENSMUST00000177242 1004 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Gm29197-201ENSMUST00000185922 702 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Scgb2b8-ps-201ENSMUST00000188661 327 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Scgb2b13-ps-201ENSMUST00000190420 328 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Ighv1-38-201ENSMUST00000192755 349 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Tsg101-ps-201ENSMUST00000201023 1170 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Gm30694-201ENSMUST00000209278 1230 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Gm18860-201ENSMUST00000212029 764 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Gm45756-201ENSMUST00000212491 407 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Gm45764-201ENSMUST00000213047 571 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Olfr976-202ENSMUST00000213171 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Vmn1r176-204ENSMUST00000227129 2955 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Vmn1r176-207ENSMUST00000228793 2959 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 1700011L22Rik-201ENSMUST00000034109 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Prl3d1-201ENSMUST00000082079 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Snora9-201ENSMUST00000082579 133 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Olfr201-201ENSMUST00000099656 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Slamf1-201ENSMUST00000015460 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Gm43421-201ENSMUST00000200044 2905 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Gm37216-201ENSMUST00000193817 3478 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 C920009B18Rik-202ENSMUST00000181223 4535 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Gm10033-204ENSMUST00000213012 7778 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Zfp719-201ENSMUST00000058104 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Cntn4-201ENSMUST00000079416 2844 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Kcnj6-203ENSMUST00000165538 3637 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Ms4a1-201ENSMUST00000169159 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 AC122769.1-201ENSMUST00000226930 1714 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Mfsd4b4-201ENSMUST00000178045 3508 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 1810018F18Rik-202ENSMUST00000189546 1447 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Gm18878-201ENSMUST00000223071 1443 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Gm4221-202ENSMUST00000181765 2988 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Grik2-202ENSMUST00000105484 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Gm42676-201ENSMUST00000197609 2686 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 AC117608.1-201ENSMUST00000225500 3418 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 P2ry14-203ENSMUST00000196081 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 AC107742.1-201ENSMUST00000227769 1390 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Dlgap5-208ENSMUST00000180299 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Gm26899-201ENSMUST00000181963 3328 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Vmn1r201-203ENSMUST00000226965 4741 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Olfr1362-201ENSMUST00000051874 3045 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Mapk9-204ENSMUST00000109178 1302 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 5033425B01Rik-201ENSMUST00000213948 1303 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Dapp1-203ENSMUST00000136613 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Mtrr-201ENSMUST00000045827 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Zfp78-202ENSMUST00000108559 1539 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Gabrg1-201ENSMUST00000031119 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 CT009480.2-201ENSMUST00000225152 3369 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Olfr419-202ENSMUST00000214725 2685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Vcan-203ENSMUST00000109546 12427 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Olfr446-201ENSMUST00000101461 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Gm24986-201ENSMUST00000104452 132 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Gm6746-201ENSMUST00000108774 483 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Wfdc15b-202ENSMUST00000109376 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Gm11833-201ENSMUST00000118393 853 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Gm15129-201ENSMUST00000119673 279 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Gm15842-201ENSMUST00000120513 618 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Gm13024-201ENSMUST00000121756 718 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Gm11626-201ENSMUST00000142107 333 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 4930412L05Rik-202ENSMUST00000146501 1241 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Gm20738-201ENSMUST00000177666 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Gm26738-201ENSMUST00000181312 601 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Gm9167-201ENSMUST00000182469 962 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Wfdc15b-201ENSMUST00000018355 510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Mir6930-201ENSMUST00000183859 68 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Gm29049-201ENSMUST00000185705 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Gm20816-202ENSMUST00000187846 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Gm20809-202ENSMUST00000187943 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Gm21728-201ENSMUST00000188442 695 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Gm21889-201ENSMUST00000188487 695 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Gm20932-201ENSMUST00000189115 694 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Gm21721-202ENSMUST00000189253 1225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Gm21920-201ENSMUST00000190042 695 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Gm28171-201ENSMUST00000190100 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Gm20867-202ENSMUST00000190987 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Gm36448-201ENSMUST00000199916 438 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Gm43964-201ENSMUST00000203570 301 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Gm44258-201ENSMUST00000204925 301 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 1700040L08Rik-201ENSMUST00000205011 541 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Gm44722-201ENSMUST00000206473 436 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Gm36843-201ENSMUST00000209303 627 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Gm7419-201ENSMUST00000209962 925 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Gm45335-201ENSMUST00000210618 401 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 Gm34047-201ENSMUST00000223547 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 AL844586.1-201ENSMUST00000224297 1042 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
IfnabL7MTU6 AC163667.1-201ENSMUST00000225201 1289 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.6 ms