Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 AC154816.1-201ENSMUST00000222688 634 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 AC154487.1-201ENSMUST00000224649 226 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 AC121137.1-201ENSMUST00000225272 602 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 AC139569.1-201ENSMUST00000226080 614 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 AC172989.1-201ENSMUST00000226387 513 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 AC125405.2-201ENSMUST00000227862 383 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 CT025630.2-201ENSMUST00000228293 487 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Clec2i-201ENSMUST00000032519 1014 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Cypt4-201ENSMUST00000053956 629 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Ino80c-201ENSMUST00000055012 909 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Olfr350-201ENSMUST00000055130 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Olfr429-201ENSMUST00000060693 943 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Slxl1-201ENSMUST00000088740 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Tmem267-201ENSMUST00000099147 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Olfr62-203ENSMUST00000217013 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Brox-202ENSMUST00000163528 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 B3gnt5-201ENSMUST00000079780 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Heph-203ENSMUST00000113838 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Ralgapa2-205ENSMUST00000131824 5624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm12511-201ENSMUST00000135987 1603 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm37067-201ENSMUST00000195730 1628 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm43187-201ENSMUST00000200652 2397 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm33167-201ENSMUST00000201933 2643 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Plek-201ENSMUST00000020321 3896 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r184-203ENSMUST00000227232 8472 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Ckap5-202ENSMUST00000099716 6574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Zfa-ps-201ENSMUST00000180526 2231 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Tnik-202ENSMUST00000159308 3831 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Tnik-211ENSMUST00000161964 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Fbxw19-201ENSMUST00000076617 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Mettl6-201ENSMUST00000055303 3946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1412-202ENSMUST00000190505 3663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm42763-201ENSMUST00000199595 2087 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1426-201ENSMUST00000112952 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm19024-201ENSMUST00000194681 1319 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm30931-202ENSMUST00000211698 1320 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Olfr930-202ENSMUST00000217208 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 CT030185.2-201ENSMUST00000222614 1310 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 F830045P16Rik-201ENSMUST00000050309 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Slc25a40-202ENSMUST00000170496 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Pcdh15-201ENSMUST00000064562 8830 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm26873-201ENSMUST00000181390 2368 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 1810018F18Rik-202ENSMUST00000189546 1447 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Oxr1-207ENSMUST00000179393 4498 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm36660-201ENSMUST00000218323 3871 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Zwint-202ENSMUST00000105431 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 AC107763.1-202ENSMUST00000225021 2663 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Nlrp10-201ENSMUST00000055745 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm20877-201ENSMUST00000100105 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Mir697-201ENSMUST00000102316 109 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm22470-201ENSMUST00000104117 130 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm25725-201ENSMUST00000104528 130 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gmfg-203ENSMUST00000108292 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm15739-201ENSMUST00000118049 872 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm14727-201ENSMUST00000118526 525 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm14721-201ENSMUST00000121381 525 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm12630-201ENSMUST00000121575 784 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm12752-201ENSMUST00000121657 811 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Hnf1aos1-203ENSMUST00000131845 740 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm11626-201ENSMUST00000142107 333 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm22948-201ENSMUST00000158561 243 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r-ps143-201ENSMUST00000176730 604 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Obox4-ps36-201ENSMUST00000177206 723 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Obox4-ps16-201ENSMUST00000177624 1137 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Obox4-ps17-201ENSMUST00000178341 1137 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Obox4-ps18-201ENSMUST00000179441 1137 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm20917-201ENSMUST00000179922 990 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 1700003H04Rik-206ENSMUST00000180162 1086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm28221-201ENSMUST00000185617 347 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 BE692007-201ENSMUST00000186054 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm28514-201ENSMUST00000187488 450 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 1700006H21Rik-201ENSMUST00000188490 627 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 2010103J01Rik-201ENSMUST00000192375 388 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm8826-201ENSMUST00000193161 948 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm37555-201ENSMUST00000195711 542 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm19596-201ENSMUST00000203685 739 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 A530053G22Rik-203ENSMUST00000204370 612 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm44258-201ENSMUST00000204925 301 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm44971-201ENSMUST00000206192 337 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 E230032D23Rik-202ENSMUST00000207959 451 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 E230032D23Rik-203ENSMUST00000208797 856 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm44869-201ENSMUST00000208836 357 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm7394-201ENSMUST00000209138 1032 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 1600027J07Rik-201ENSMUST00000209501 489 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm4270-201ENSMUST00000209666 406 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm31659-201ENSMUST00000211989 481 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm45764-201ENSMUST00000213047 571 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm36435-201ENSMUST00000213341 1178 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 AC153899.1-201ENSMUST00000214092 1117 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm19217-201ENSMUST00000218238 328 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 4930466K18Rik-201ENSMUST00000219458 906 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 6030440G07Rik-201ENSMUST00000221849 1090 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm9315-201ENSMUST00000222696 908 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 AC117949.1-201ENSMUST00000225547 419 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Cst11-201ENSMUST00000028934 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 1700003H04Rik-201ENSMUST00000047110 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Olfr609-201ENSMUST00000055787 965 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r47-201ENSMUST00000074881 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm5528-201ENSMUST00000076314 480 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Cbx3-202ENSMUST00000094623 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.5 ms