Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 1700108F19Rik-208ENSMUST00000191447 660 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Gm37068-201ENSMUST00000195168 640 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Mark1-ps1-201ENSMUST00000198516 717 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 AL929555.1-201ENSMUST00000215283 509 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 AC153821.1-201ENSMUST00000217893 581 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Gm9231-201ENSMUST00000220817 1009 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Skint10-202ENSMUST00000068851 493 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Olfr532-201ENSMUST00000073226 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Nms-201ENSMUST00000088029 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Gm11590-201ENSMUST00000118999 1455 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Svil-210ENSMUST00000140448 7423 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Gm4806-201ENSMUST00000222704 1690 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Olfr119-202ENSMUST00000213732 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Prdx6b-201ENSMUST00000057072 2885 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Tcf7l2-209ENSMUST00000111656 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Meis2-205ENSMUST00000110907 3718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Zbtb18-212ENSMUST00000195612 3790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Gm10773-201ENSMUST00000218071 3935 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Zkscan2-201ENSMUST00000042470 7831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Ptprb-203ENSMUST00000218553 7016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Gm43876-201ENSMUST00000203831 3229 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Scn2a-202ENSMUST00000100067 8690 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Olfr538-202ENSMUST00000210973 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Hook3-201ENSMUST00000037182 12836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Nostrin-201ENSMUST00000041865 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Ncor1-204ENSMUST00000101066 8852 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Pde1a-203ENSMUST00000102652 1646 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Gm37289-201ENSMUST00000195409 1402 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Gm7961-201ENSMUST00000201338 1436 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Rpl23a-ps2-201ENSMUST00000119375 474 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Gm23225-201ENSMUST00000158121 114 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Gm22655-201ENSMUST00000174949 96 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 AF067063-201ENSMUST00000179455 590 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Gm37135-201ENSMUST00000192652 534 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Gm44091-201ENSMUST00000205212 649 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Olfr587-ps1-202ENSMUST00000209201 477 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Gm34623-201ENSMUST00000210900 977 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 AC113031.1-201ENSMUST00000227400 432 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Olfr1378-201ENSMUST00000052285 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Vmn1r37-201ENSMUST00000077482 909 ntAPPRIS P2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 BC061195-201ENSMUST00000088133 577 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 1700003E24Rik-201ENSMUST00000088134 577 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Zfp850-201ENSMUST00000099111 941 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Gm9226-201ENSMUST00000188352 3489 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Bbx-205ENSMUST00000114488 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Vmn2r52-201ENSMUST00000164918 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm10855-201ENSMUST00000100426 2541 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Ank3-202ENSMUST00000054167 5769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Ank3-247ENSMUST00000218680 5500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm42636-201ENSMUST00000197174 2239 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 AC126549.1-201ENSMUST00000225044 3687 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 P2ry12-204ENSMUST00000199609 2157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Zbtb18-201ENSMUST00000077225 4944 ntAPPRIS P3 BASIC6.09□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm38811-201ENSMUST00000203781 3478 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm15097-201ENSMUST00000101180 2029 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm15107-201ENSMUST00000112796 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm15080-201ENSMUST00000112804 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Ott-201ENSMUST00000177554 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Ott-202ENSMUST00000177606 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm15085-201ENSMUST00000178169 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Ott-203ENSMUST00000179348 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Ankrd6-201ENSMUST00000035719 4683 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm26981-201ENSMUST00000182453 3169 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 U2surp-209ENSMUST00000217176 3111 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Olfr66-202ENSMUST00000216303 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Medag-202ENSMUST00000201083 2669 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Zfp78-202ENSMUST00000108559 1539 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 CT025566.1-202ENSMUST00000224800 2511 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Trim66-203ENSMUST00000106741 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 1700014D04Rik-203ENSMUST00000180139 3231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 4933430H16Rik-201ENSMUST00000209078 1319 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm25346-201ENSMUST00000104509 128 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm11799-201ENSMUST00000116110 460 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm15502-201ENSMUST00000121449 208 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm2800-201ENSMUST00000122988 641 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm15217-202ENSMUST00000141358 347 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Olfr1155-203ENSMUST00000215903 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Mylf-ps-201ENSMUST00000222174 421 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 AC154558.1-201ENSMUST00000222278 415 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Olfr1224-ps1-202ENSMUST00000099793 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Sorbs2-215ENSMUST00000135336 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Ddx6-201ENSMUST00000170489 6065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Ctnnd1-212ENSMUST00000111686 6061 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 AC121286.2-201ENSMUST00000218069 2470 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Ccdc191-203ENSMUST00000132859 3779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Apobec3-203ENSMUST00000165537 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Hsd3b2-202ENSMUST00000107022 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Cmtr2-201ENSMUST00000056972 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm37937-201ENSMUST00000194130 2168 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 D6Ertd474e-201ENSMUST00000100817 2149 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Ago3-201ENSMUST00000069097 15595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm14418-201ENSMUST00000108955 1415 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm43557-201ENSMUST00000197100 2370 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm42523-201ENSMUST00000199378 2872 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm37423-201ENSMUST00000194246 3342 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Amelx-202ENSMUST00000112118 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Snord88a-201ENSMUST00000116723 90 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm13400-201ENSMUST00000117436 380 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm15006-201ENSMUST00000121419 1122 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.3 ms