Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

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Length 1,947 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Ddx6-201ENSMUST00000170489 6065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Sema6a-202ENSMUST00000076043 4123 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Tsix-201ENSMUST00000152916 4306 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Ago3-201ENSMUST00000069097 15595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Zfp488-201ENSMUST00000166737 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Gm11879-201ENSMUST00000121885 702 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Gm12867-201ENSMUST00000151216 457 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Mir1960-201ENSMUST00000157488 78 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Gm25675-201ENSMUST00000174979 118 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 1700120O09Rik-201ENSMUST00000177127 977 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Gm26509-201ENSMUST00000180947 948 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Gm28918-201ENSMUST00000188822 699 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Gm18838-201ENSMUST00000204855 886 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Gm44787-202ENSMUST00000208339 1069 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Mylf-ps-201ENSMUST00000222174 421 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 AC170086.2-201ENSMUST00000224733 803 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Vmn1r219-201ENSMUST00000076180 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Gm28112-201ENSMUST00000190898 1875 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Pde10a-207ENSMUST00000115722 3673 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Olfr1189-202ENSMUST00000213679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Lrrc6-201ENSMUST00000023006 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Serbp1-201ENSMUST00000042990 15474 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Krt222-202ENSMUST00000103132 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Rabep1-202ENSMUST00000081362 2469 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Gm18409-201ENSMUST00000218988 2506 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 AC154612.1-202ENSMUST00000224806 1725 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Gm36283-203ENSMUST00000220211 3732 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Zfp592-201ENSMUST00000107353 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Apobec1-202ENSMUST00000112586 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Gm14772-201ENSMUST00000116562 514 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Gm13265-201ENSMUST00000118090 421 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Gm11920-201ENSMUST00000118491 563 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Vmn1r-ps111-201ENSMUST00000121014 997 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Gm12438-201ENSMUST00000122034 336 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Gm12152-201ENSMUST00000122465 684 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 D830026I12Rik-201ENSMUST00000124434 935 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Vmn1r208-201ENSMUST00000124841 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Gm26037-201ENSMUST00000158150 311 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Snrpe-204ENSMUST00000166915 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Gm17201-201ENSMUST00000167226 390 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Raet1e-202ENSMUST00000178026 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Ighv1-14-201ENSMUST00000194015 402 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Gm45486-201ENSMUST00000211767 1109 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 AC160138.1-201ENSMUST00000217965 588 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 1700084J12Rik-201ENSMUST00000079057 734 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Gm22053-201ENSMUST00000083394 200 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Raet1d-201ENSMUST00000095795 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Mlip-215ENSMUST00000185144 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Hrasls-201ENSMUST00000089824 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Mroh4-201ENSMUST00000023271 3583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Inpp5d-208ENSMUST00000167032 4125 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Sap30bp-203ENSMUST00000140991 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Mnd1-ps-202ENSMUST00000224435 2574 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Kif24-201ENSMUST00000030148 4333 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Cfap44-202ENSMUST00000120049 6199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Zdhhc11-201ENSMUST00000091493 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Scn2b-201ENSMUST00000093855 3958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Ncoa4-202ENSMUST00000163336 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Vwa5a-202ENSMUST00000118144 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Phactr4-202ENSMUST00000084249 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Klra1-201ENSMUST00000032288 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Frem1-208ENSMUST00000170248 9527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Olfr1299-202ENSMUST00000213511 1783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Olfr727-202ENSMUST00000215317 2616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Slc26a2-201ENSMUST00000037603 2802 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Atp2b4-201ENSMUST00000048953 8292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Glrx2-204ENSMUST00000129653 3515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Olfr744-202ENSMUST00000213668 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Wdr72-205ENSMUST00000215440 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Etv1-210ENSMUST00000161980 1939 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Pira2-202ENSMUST00000119469 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Gm14000-201ENSMUST00000118670 233 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Gm22342-201ENSMUST00000122647 298 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Gm16196-201ENSMUST00000137730 464 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Gm14640-201ENSMUST00000145800 437 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Sox5os2-201ENSMUST00000156443 627 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Gm25904-201ENSMUST00000158491 143 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Gm16226-203ENSMUST00000161197 395 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Gm17140-201ENSMUST00000169163 627 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Gm4152-201ENSMUST00000172675 259 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Gm29353-201ENSMUST00000185801 620 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Gm28455-201ENSMUST00000189105 1290 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Gm43233-201ENSMUST00000200491 616 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 1700013A02Rik-201ENSMUST00000202969 645 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Gm45044-201ENSMUST00000208078 396 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Gm45448-201ENSMUST00000211739 209 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Gm33838-201ENSMUST00000214038 786 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 AC113031.1-201ENSMUST00000227400 432 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 AC105324.1-201ENSMUST00000227844 386 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Gm19210-201ENSMUST00000199562 1350 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Dnajb7-201ENSMUST00000057236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Olfr374-202ENSMUST00000210435 8718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Stra6l-203ENSMUST00000107783 3669 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Rp1-203ENSMUST00000208660 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Usp7-207ENSMUST00000160405 4745 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Adgre1-202ENSMUST00000086763 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
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