Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Defb46-201ENSMUST00000095436 174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Gm19667-201ENSMUST00000188984 3334 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Alpk1-206ENSMUST00000198955 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Gm28819-202ENSMUST00000187416 1335 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Daw1-203ENSMUST00000113436 1351 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Prkg2-204ENSMUST00000162147 1389 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 5830432E09Rik-201ENSMUST00000180693 3569 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 9830132P13Rik-201ENSMUST00000198240 4187 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Alg11-202ENSMUST00000110737 4833 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Rab30-203ENSMUST00000107180 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Gm6710-201ENSMUST00000109011 1445 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Hsf2-201ENSMUST00000079833 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 AC156163.1-201ENSMUST00000215598 3369 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 P2ry12-204ENSMUST00000199609 2157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Gm37653-201ENSMUST00000195401 3578 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Gm45406-201ENSMUST00000210161 1637 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Gm35206-201ENSMUST00000217945 1642 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Exoc2-201ENSMUST00000021785 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Gm28818-201ENSMUST00000187553 2989 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 AC129308.1-201ENSMUST00000223800 2309 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 4931403G20Rik-201ENSMUST00000180861 1699 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 4930553P18Rik-201ENSMUST00000201164 1659 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Gm16325-201ENSMUST00000141199 3174 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Gm42874-201ENSMUST00000198888 1774 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Olfr1386-202ENSMUST00000204518 2553 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Ampd3-201ENSMUST00000005829 4094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Triml1-201ENSMUST00000059692 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Kat6a-201ENSMUST00000044331 9113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Gen1-201ENSMUST00000166117 5268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Bglap3-202ENSMUST00000107542 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Gm9144-201ENSMUST00000101625 1008 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Igkv3-5-201ENSMUST00000103400 382 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Gm25093-201ENSMUST00000103993 132 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Gm26144-201ENSMUST00000104475 132 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 BC080695-201ENSMUST00000105765 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Rps12-ps7-201ENSMUST00000117169 385 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Olfr602-ps1-201ENSMUST00000118403 948 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Gm11903-201ENSMUST00000118958 727 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Rpl23a-ps2-201ENSMUST00000119375 474 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 4930448K20Rik-201ENSMUST00000120570 998 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Rps19-ps14-201ENSMUST00000121832 269 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Gm14990-201ENSMUST00000122354 445 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Gm35202-201ENSMUST00000130083 712 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Gm2735-201ENSMUST00000136133 277 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Gm23740-201ENSMUST00000157385 100 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Clasp1-203ENSMUST00000165223 7207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Gm4202-201ENSMUST00000169025 733 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Gm26801-201ENSMUST00000180591 1219 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Mir7082-201ENSMUST00000183526 92 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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Cldn23Q9D7D7 Scgb1b16-ps-201ENSMUST00000186029 275 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Ly6c2-203ENSMUST00000188214 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Scgb1b14-ps-201ENSMUST00000188286 275 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Gm7019-201ENSMUST00000194122 369 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Gm42708-201ENSMUST00000196332 905 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Gm43400-201ENSMUST00000197294 1254 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 1700094M23Rik-202ENSMUST00000198047 675 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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Cldn23Q9D7D7 Olfr587-ps1-202ENSMUST00000209201 477 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Gm2754-201ENSMUST00000223383 589 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 AV026068-218ENSMUST00000223980 575 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 CT009711.4-201ENSMUST00000225685 198 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Tcl1b2-201ENSMUST00000081379 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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Cldn23Q9D7D7 A930038B10Rik-201ENSMUST00000180412 4084 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Wars2-201ENSMUST00000004343 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Cldn12-202ENSMUST00000115445 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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Cldn23Q9D7D7 Dzank1-204ENSMUST00000163701 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Itpr2-201ENSMUST00000053273 8331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Gm10184-201ENSMUST00000086423 1939 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Gm42577-201ENSMUST00000201367 3211 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
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Cldn23Q9D7D7 Kif6-207ENSMUST00000162854 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 5430421F17Rik-202ENSMUST00000210268 2295 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Plekhh2-201ENSMUST00000047206 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Sema6a-202ENSMUST00000076043 4123 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Rab1a-206ENSMUST00000163483 2657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Olfr90-206ENSMUST00000217397 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Slc12a8-205ENSMUST00000122314 2819 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Mir680-1-201ENSMUST00000102257 109 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Tpmt-202ENSMUST00000110118 881 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Gm13878-201ENSMUST00000117986 577 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Rps12-ps5-201ENSMUST00000118272 389 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Gm8722-201ENSMUST00000121466 769 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Gm2709-201ENSMUST00000142979 350 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 9530046B11Rik-201ENSMUST00000149413 1157 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Gm17059-201ENSMUST00000168284 519 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Gm20685-201ENSMUST00000176654 489 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Gm5261-201ENSMUST00000185860 713 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 1700104B16Rik-202ENSMUST00000187948 722 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Gm37189-201ENSMUST00000192131 298 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Gm43063-201ENSMUST00000198198 1081 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Gm42673-201ENSMUST00000202676 337 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Gm44896-201ENSMUST00000206190 772 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Olfr65-202ENSMUST00000209528 1106 ntAPPRIS P2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Gm18907-201ENSMUST00000209719 932 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Gm39271-201ENSMUST00000212881 434 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Gm45739-201ENSMUST00000213094 388 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.5 ms