Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm23031-201ENSMUST00000157998 119 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm2976-201ENSMUST00000160362 513 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm21392-201ENSMUST00000182950 972 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm28119-201ENSMUST00000185538 298 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Rd3l-204ENSMUST00000190536 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm8182-201ENSMUST00000197863 769 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm43929-201ENSMUST00000203025 409 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm9357-201ENSMUST00000207138 805 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm20136-201ENSMUST00000207501 891 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 AC124184.1-201ENSMUST00000218167 283 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 AC155709.1-201ENSMUST00000218794 162 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm2139-201ENSMUST00000222569 1075 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Olfr691-201ENSMUST00000057528 969 ntAPPRIS P1 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm20749-201ENSMUST00000186319 3492 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm43019-201ENSMUST00000196948 2863 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Tmem100-201ENSMUST00000092788 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 AC152922.2-201ENSMUST00000213353 3879 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Ccdc191-203ENSMUST00000132859 3779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Catsperg1-201ENSMUST00000047846 3566 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Tnfsf4-201ENSMUST00000028024 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm9871-203ENSMUST00000204837 1560 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Adsl-201ENSMUST00000023043 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Zfp263-207ENSMUST00000162207 2452 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm36930-201ENSMUST00000195431 2376 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 AC129308.2-203ENSMUST00000224109 2385 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm4847-201ENSMUST00000046662 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Il15ra-210ENSMUST00000128156 1624 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Rab1a-206ENSMUST00000163483 2657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Map7d2-201ENSMUST00000043151 3087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Trappc8-206ENSMUST00000225661 5191 ntAPPRIS ALT2 BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Dcp2-201ENSMUST00000025350 8616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Olfr972-203ENSMUST00000216167 1522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Cyp2j11-201ENSMUST00000015368 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Crispld1-202ENSMUST00000159958 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gdap1-201ENSMUST00000026879 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Sp100-212ENSMUST00000153574 1653 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Apoa2-202ENSMUST00000111319 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm15501-202ENSMUST00000140687 625 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Vmn1r190-ps-201ENSMUST00000155950 903 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm25722-201ENSMUST00000157498 279 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm20491-201ENSMUST00000173765 1241 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Fam47e-207ENSMUST00000176621 746 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 1700120O09Rik-201ENSMUST00000177127 977 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm6489-201ENSMUST00000178167 696 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps78-201ENSMUST00000178185 924 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps76-201ENSMUST00000179492 924 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm29048-201ENSMUST00000185342 615 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm29403-201ENSMUST00000185491 615 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm28234-201ENSMUST00000185657 615 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm28248-201ENSMUST00000186093 615 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm29633-202ENSMUST00000186217 615 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm28829-201ENSMUST00000186231 615 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm28261-201ENSMUST00000186417 615 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm28815-201ENSMUST00000186751 615 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm28608-201ENSMUST00000186860 615 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm28122-201ENSMUST00000187088 615 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm28420-201ENSMUST00000187340 615 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm28106-201ENSMUST00000187640 615 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm28698-201ENSMUST00000187734 615 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm29224-201ENSMUST00000187965 615 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm29189-201ENSMUST00000188018 615 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm29476-201ENSMUST00000188397 615 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm29505-201ENSMUST00000188424 615 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm28125-201ENSMUST00000188470 615 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm29391-201ENSMUST00000188545 615 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm29280-201ENSMUST00000188571 615 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm28349-201ENSMUST00000188590 615 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm29652-201ENSMUST00000188622 615 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm28819-206ENSMUST00000188816 615 ntBASIC8□□□□□ -1.13
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Ccdc47Q9D024 Gm29377-205ENSMUST00000189603 615 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm28327-201ENSMUST00000189638 615 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm28790-201ENSMUST00000189642 615 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm28907-201ENSMUST00000189700 615 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm29586-207ENSMUST00000189745 615 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm29115-201ENSMUST00000189870 615 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm28366-201ENSMUST00000190147 615 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm21292-202ENSMUST00000190329 1225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm29212-201ENSMUST00000190384 615 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm29533-201ENSMUST00000190403 615 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm28162-201ENSMUST00000190545 615 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm29030-201ENSMUST00000190848 615 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm28742-201ENSMUST00000191001 615 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm28899-201ENSMUST00000191161 615 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm29567-201ENSMUST00000191188 615 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm28222-201ENSMUST00000191210 615 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm28776-201ENSMUST00000191282 615 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm29306-201ENSMUST00000191366 615 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm29618-201ENSMUST00000191423 615 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm28136-210ENSMUST00000191432 615 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm29251-201ENSMUST00000191480 615 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm28658-201ENSMUST00000191532 615 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm32180-201ENSMUST00000192415 615 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm30598-201ENSMUST00000192620 615 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 1110002O04Rik-201ENSMUST00000194261 566 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm37627-201ENSMUST00000194585 615 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm34274-201ENSMUST00000195825 615 ntBASIC8□□□□□ -1.13
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