Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Rc3h2-201ENSMUST00000100143 8799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Meis1-208ENSMUST00000177417 5308 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 AC153501.1-201ENSMUST00000218156 1860 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Usp29-201ENSMUST00000054055 2610 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnip4-208ENSMUST00000176978 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Trpm3-202ENSMUST00000074770 6710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Atp2b4-202ENSMUST00000112264 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10601-201ENSMUST00000120436 1422 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13749-201ENSMUST00000133244 1432 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12784-202ENSMUST00000206001 3739 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Cnot2-210ENSMUST00000168036 2693 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp87-204ENSMUST00000181767 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Serpinb1c-201ENSMUST00000021834 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14827-201ENSMUST00000146644 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1340-204ENSMUST00000217334 2001 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm33167-201ENSMUST00000201933 2643 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20655-202ENSMUST00000181428 2946 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r52-208ENSMUST00000228665 3226 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm39139-202ENSMUST00000212621 5878 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Trbv14-201ENSMUST00000103272 368 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Igkv8-30-201ENSMUST00000103378 368 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17184-201ENSMUST00000111864 462 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9836-201ENSMUST00000117132 216 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12879-201ENSMUST00000120003 1182 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem216-203ENSMUST00000123788 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13839-201ENSMUST00000151639 506 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12484-201ENSMUST00000156311 581 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm22948-201ENSMUST00000158561 243 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm24735-201ENSMUST00000158859 118 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10552-202ENSMUST00000161763 717 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Crip3-206ENSMUST00000165993 735 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm3373-201ENSMUST00000169087 516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Esd-ps-201ENSMUST00000170684 847 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5656-201ENSMUST00000171020 1096 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Mir1231-201ENSMUST00000175639 81 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Hist2h2bb-201ENSMUST00000177113 381 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Obox4-ps36-201ENSMUST00000177206 723 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Obox4-ps16-201ENSMUST00000177624 1137 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20738-201ENSMUST00000177666 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Obox4-ps17-201ENSMUST00000178341 1137 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Obox4-ps18-201ENSMUST00000179441 1137 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm23139-201ENSMUST00000179454 132 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Mir7084-201ENSMUST00000183876 70 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29049-201ENSMUST00000185705 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20816-202ENSMUST00000187846 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20809-202ENSMUST00000187943 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21728-201ENSMUST00000188442 695 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21889-201ENSMUST00000188487 695 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Scgb2b8-ps-201ENSMUST00000188661 327 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20932-201ENSMUST00000189115 694 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21721-202ENSMUST00000189253 1225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21920-201ENSMUST00000190042 695 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28171-201ENSMUST00000190100 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Scgb2b13-ps-201ENSMUST00000190420 328 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20867-202ENSMUST00000190987 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Pkia-203ENSMUST00000193330 631 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm31925-202ENSMUST00000194266 537 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 1700039M15Rik-201ENSMUST00000195377 1120 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44258-201ENSMUST00000204925 301 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1509-203ENSMUST00000206100 1161 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm2767-201ENSMUST00000209582 473 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7789-201ENSMUST00000210473 701 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm31374-202ENSMUST00000214913 914 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 AC151901.1-201ENSMUST00000218274 180 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17611-202ENSMUST00000220613 814 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8616-201ENSMUST00000222175 1037 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 AC134468.2-202ENSMUST00000222820 1120 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 AC157650.2-201ENSMUST00000224666 328 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 AC164436.1-201ENSMUST00000227074 772 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 1700011L22Rik-201ENSMUST00000034109 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Larp1b-204ENSMUST00000099121 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42975-201ENSMUST00000200612 1491 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 St18-204ENSMUST00000131494 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Meg3-209ENSMUST00000146701 14548 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Ncoa7-212ENSMUST00000217644 2256 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1390-202ENSMUST00000215014 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38263-201ENSMUST00000195879 3059 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Cped1-202ENSMUST00000115383 5690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Palmd-202ENSMUST00000119557 3305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12292-201ENSMUST00000122911 2433 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43088-201ENSMUST00000197530 2347 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 F830045P16Rik-201ENSMUST00000050309 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18248-201ENSMUST00000191164 1846 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Csnk1g1-213ENSMUST00000206528 1740 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 A2ml1-201ENSMUST00000060574 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Helz-203ENSMUST00000106746 13147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7945-201ENSMUST00000164948 1428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Zbtb44-202ENSMUST00000167346 1308 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm31049-201ENSMUST00000201516 1302 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 5033425B01Rik-201ENSMUST00000213948 1303 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnj16-201ENSMUST00000106635 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr510-202ENSMUST00000213979 2898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Plk4-202ENSMUST00000167556 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 AC151530.1-203ENSMUST00000223343 2591 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.5 ms