Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Cwc22-201ENSMUST00000065889 3471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Otud7b-203ENSMUST00000098849 8046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Ccdc7b-203ENSMUST00000108745 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 4933406K04Rik-202ENSMUST00000124363 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Gm22552-201ENSMUST00000157796 337 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Gm8582-201ENSMUST00000164061 789 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Gm9597-201ENSMUST00000171913 602 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Olfr760-ps1-201ENSMUST00000172563 748 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Gm28616-201ENSMUST00000187344 441 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 4930480K02Rik-201ENSMUST00000203679 1054 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Vmn1r52-203ENSMUST00000227100 2307 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Gm7361-201ENSMUST00000074148 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Depdc5-202ENSMUST00000087897 8216 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Lpar2-201ENSMUST00000034325 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Ccdc80-202ENSMUST00000099498 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Olfr1351-202ENSMUST00000216030 2489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Utrn-206ENSMUST00000219003 5751 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 C730027H18Rik-202ENSMUST00000219822 3268 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Gm15000-201ENSMUST00000118275 1243 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Gm14870-201ENSMUST00000118414 156 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Gm11198-201ENSMUST00000119771 974 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Gm15879-202ENSMUST00000150906 565 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Gm8860-201ENSMUST00000193160 445 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Gm42886-201ENSMUST00000199214 466 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Gm44020-201ENSMUST00000204618 664 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Gm7706-201ENSMUST00000209946 388 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Gm35453-201ENSMUST00000210304 331 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 CT485607.3-201ENSMUST00000213361 672 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Stard13-202ENSMUST00000110483 5662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Gm38299-201ENSMUST00000193214 3789 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Gm43176-201ENSMUST00000199653 2989 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Gm5600-202ENSMUST00000211589 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Osbpl3-202ENSMUST00000090019 4039 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Atp8b5-202ENSMUST00000102953 2609 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Gm12043-201ENSMUST00000131570 2788 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Gm9521-201ENSMUST00000206656 1516 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Slco1c1-201ENSMUST00000032362 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Frmd4b-204ENSMUST00000113359 4311 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Serpina3c-201ENSMUST00000085050 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Cobl-210ENSMUST00000174874 5451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Zfp661-201ENSMUST00000077422 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Vmn1r44-213ENSMUST00000228700 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Ank3-202ENSMUST00000054167 5769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Vwde-202ENSMUST00000203074 5626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Pknox1-201ENSMUST00000097352 4172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Zbtb18-206ENSMUST00000193480 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Olfr1500-207ENSMUST00000219674 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Gm11624-201ENSMUST00000118579 1041 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Gm8061-201ENSMUST00000122380 350 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Gm27960-201ENSMUST00000183445 184 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Mir7008-201ENSMUST00000184398 63 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Gm31925-202ENSMUST00000194266 537 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Asb17os-202ENSMUST00000200329 497 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 E330011O21Rik-208ENSMUST00000211650 1225 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 1190001M18Rik-201ENSMUST00000215937 1270 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 AL669819.1-201ENSMUST00000225143 330 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Map2-207ENSMUST00000114018 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Gm4952-201ENSMUST00000092931 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Gm31805-201ENSMUST00000211921 4031 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Gm26876-201ENSMUST00000180875 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Brox-202ENSMUST00000163528 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Vmn1r51-203ENSMUST00000226542 4164 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Slc16a14-201ENSMUST00000027422 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 D030045P18Rik-203ENSMUST00000214947 1938 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Klrb1-201ENSMUST00000112110 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Gm15956-201ENSMUST00000153352 502 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Gm24719-201ENSMUST00000157520 110 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Gm9529-201ENSMUST00000177598 579 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Gm27024-201ENSMUST00000182561 755 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Gm9110-201ENSMUST00000219035 617 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Olfr1362-201ENSMUST00000051874 3045 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Tas1r3-201ENSMUST00000030949 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 St6galnac3-204ENSMUST00000200397 8169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Dgkb-201ENSMUST00000040500 6373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Atp13a4-202ENSMUST00000057018 4054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Fshr-201ENSMUST00000035701 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Hmgn5-201ENSMUST00000033597 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Lipn-201ENSMUST00000025682 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Gm12229-201ENSMUST00000120487 468 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Tgm4-206ENSMUST00000215247 951 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Vmn1r188-201ENSMUST00000091739 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 1700034E13Rik-201ENSMUST00000091904 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 AC153955.4-201ENSMUST00000217069 2752 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 AC138284.1-201ENSMUST00000214258 3236 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 AC164978.1-201ENSMUST00000228608 4011 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Gm8276-201ENSMUST00000192231 1812 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 9330111N05Rik-201ENSMUST00000180409 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Mmp20-201ENSMUST00000034487 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 C530043A13Rik-202ENSMUST00000188155 1512 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Gm42827-201ENSMUST00000197058 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Dmtf1-202ENSMUST00000095017 3498 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 U2surp-201ENSMUST00000078374 3520 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Igkv6-23-201ENSMUST00000103386 369 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Gm12596-201ENSMUST00000124589 673 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Gm13029-201ENSMUST00000137283 594 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Gm22820-201ENSMUST00000157205 329 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Gm25459-201ENSMUST00000157953 114 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Gm20506-201ENSMUST00000172952 589 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Gm5692-201ENSMUST00000187254 1057 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.6 ms