Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Gm37072-201ENSMUST00000194570 837 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Gm37883-201ENSMUST00000194970 725 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Gm38268-201ENSMUST00000195813 193 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Gm43507-201ENSMUST00000196411 675 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Gm43387-201ENSMUST00000196896 1066 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 4930580E04Rik-201ENSMUST00000197377 690 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Gm9240-201ENSMUST00000206527 742 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Gm7394-201ENSMUST00000209138 1032 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Gm45259-201ENSMUST00000209217 1006 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Olfr602-ps1-202ENSMUST00000218213 1169 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Gm5791-201ENSMUST00000220840 489 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Gm9800-201ENSMUST00000052615 336 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Tas2r144-201ENSMUST00000063489 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Gm13769-201ENSMUST00000077123 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Olfr884-201ENSMUST00000077732 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Gm16020-201ENSMUST00000084281 210 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Mir455-201ENSMUST00000093594 82 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Olfr1220-203ENSMUST00000213288 4223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Vmn1r188-203ENSMUST00000228243 8473 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Colec10-201ENSMUST00000036737 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Ppp1r9a-212ENSMUST00000177456 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 AC122024.1-201ENSMUST00000219276 4850 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Gm37138-201ENSMUST00000194564 2089 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Ubxn7-201ENSMUST00000115151 10318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Gm15093-201ENSMUST00000179021 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Gm44121-201ENSMUST00000205169 2006 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Hcrtr2-201ENSMUST00000063140 3761 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Mbd4-202ENSMUST00000122816 2415 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Cul5-202ENSMUST00000120122 5945 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Gm10601-201ENSMUST00000120436 1422 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Pramef20-201ENSMUST00000121109 1434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Olfr1140-201ENSMUST00000214723 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 4933425L06Rik-201ENSMUST00000022232 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Gm37090-201ENSMUST00000195694 4105 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 D030068K23Rik-202ENSMUST00000180524 3677 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 D6Ertd474e-201ENSMUST00000100817 2149 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Pde1c-207ENSMUST00000168944 2126 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Pus7-204ENSMUST00000131992 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Gm26807-201ENSMUST00000181132 4363 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Gm37891-201ENSMUST00000195585 1326 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Serpind1-202ENSMUST00000161034 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Zfp473-204ENSMUST00000120798 3559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Lrrc51-208ENSMUST00000106968 766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 S100a1-202ENSMUST00000107340 577 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Gm13678-201ENSMUST00000118926 340 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Gm24893-201ENSMUST00000122745 369 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Rsf1os1-201ENSMUST00000126902 324 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Cnih1-202ENSMUST00000146629 789 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Gm13727-201ENSMUST00000154480 424 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Gm22882-201ENSMUST00000157749 124 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Gm23077-201ENSMUST00000157854 116 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Gm25971-201ENSMUST00000158953 286 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Gm17059-201ENSMUST00000168284 519 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Vmn1r139-201ENSMUST00000169730 894 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Vmn1r112-201ENSMUST00000174538 894 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Gm22693-201ENSMUST00000175049 442 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Vmn1r157-201ENSMUST00000178215 894 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Gm7426-201ENSMUST00000179046 404 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 C920009B18Rik-203ENSMUST00000181643 1004 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Gm18848-201ENSMUST00000182069 792 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Gm27005-201ENSMUST00000182783 921 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Mir7212-201ENSMUST00000184098 61 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Gm27185-201ENSMUST00000184296 247 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Gm38022-201ENSMUST00000191762 403 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 4930565D16Rik-201ENSMUST00000192777 1112 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Fasl-202ENSMUST00000193648 406 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Gm34144-201ENSMUST00000197039 259 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Kitl-201ENSMUST00000020129 1260 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Gm43122-201ENSMUST00000201752 354 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Lmo3-208ENSMUST00000203435 572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Gm7972-201ENSMUST00000208434 1137 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Gm45394-201ENSMUST00000209240 1175 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Lncbate1-201ENSMUST00000211953 812 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Gm35024-201ENSMUST00000213359 972 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 CAAA01216754.4-201ENSMUST00000216416 802 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Gm18242-201ENSMUST00000218455 542 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Gm9231-201ENSMUST00000220817 1009 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Gm7986-201ENSMUST00000221336 551 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 AC160114.3-201ENSMUST00000222256 560 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 CT009711.4-201ENSMUST00000225685 198 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Vmn1r41-202ENSMUST00000226337 888 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Vmn1r41-203ENSMUST00000226562 1046 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 AC133517.2-201ENSMUST00000226820 690 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 AC158981.1-201ENSMUST00000226943 1205 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 AC102676.1-201ENSMUST00000228131 719 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 3300002A11Rik-201ENSMUST00000046994 654 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Olfr926-201ENSMUST00000078289 1051 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Vmn1r132-201ENSMUST00000098736 894 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Taf1-201ENSMUST00000101341 8054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Gm28587-201ENSMUST00000187181 3005 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Gm28818-201ENSMUST00000187553 2989 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Elmod2-201ENSMUST00000053902 4319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Ugt1a6b-201ENSMUST00000113137 2249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Prokr2-204ENSMUST00000142766 3932 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Ceacam1-208ENSMUST00000206676 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Cfap54-211ENSMUST00000212902 9516 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Phc3-204ENSMUST00000108255 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Scyl3-203ENSMUST00000161908 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 T2-201ENSMUST00000163578 1755 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp39Q3TIX9 Tdrd7-202ENSMUST00000107777 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.7 ms