Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 AC121997.2-202ENSMUST00000227158 939 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 AC174678.3-201ENSMUST00000227568 362 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Olfr574-201ENSMUST00000052997 1041 ntAPPRIS P2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Olfr1342-201ENSMUST00000060562 1002 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Raet1e-201ENSMUST00000065527 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Mup8-201ENSMUST00000095058 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 P2ry12-204ENSMUST00000199609 2157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 4933425L06Rik-201ENSMUST00000022232 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Olfr472-203ENSMUST00000216937 5392 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Slmap-204ENSMUST00000112330 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Csnk1g1-201ENSMUST00000034949 7208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm29017-201ENSMUST00000190598 2092 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Lrrc6-201ENSMUST00000023006 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Galntl6-207ENSMUST00000204067 1592 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Zfp773-202ENSMUST00000211240 4073 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Ptprz1-204ENSMUST00000202102 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Slamf1-201ENSMUST00000015460 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 AC107763.1-202ENSMUST00000225021 2663 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm28600-202ENSMUST00000189502 1495 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm9874-202ENSMUST00000194957 1464 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Taf1-201ENSMUST00000101341 8054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm45516-201ENSMUST00000211588 4182 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Pus3-202ENSMUST00000121246 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Nxpe4-203ENSMUST00000216998 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Tdrd7-202ENSMUST00000107777 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Olfr675-202ENSMUST00000210113 3671 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Ap1g1-201ENSMUST00000034171 3692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm45876-201ENSMUST00000212698 2709 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Nol8-203ENSMUST00000221142 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Arhgap1-201ENSMUST00000090614 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Cenpc1-201ENSMUST00000031170 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm19272-202ENSMUST00000185181 2217 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Dock10-209ENSMUST00000190983 6672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Lingo2-201ENSMUST00000065173 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Olfr571-203ENSMUST00000215773 5153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Ttc41-202ENSMUST00000075632 4366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Ccdc158-201ENSMUST00000060930 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Igkv3-5-201ENSMUST00000103400 382 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Zfp966-202ENSMUST00000109018 733 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Zfp968-202ENSMUST00000109048 733 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm8812-201ENSMUST00000118496 412 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Apc-ps1-201ENSMUST00000119356 470 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm8722-201ENSMUST00000121466 769 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm12600-201ENSMUST00000146704 708 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Nudt7-205ENSMUST00000147605 966 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Vmn1r190-ps-201ENSMUST00000155950 903 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm9672-201ENSMUST00000166437 425 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm4202-201ENSMUST00000169025 733 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Fabp12-204ENSMUST00000172126 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm18808-201ENSMUST00000173316 462 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Mir5617-201ENSMUST00000176786 57 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm23945-201ENSMUST00000179609 92 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm27186-201ENSMUST00000184223 307 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm27972-201ENSMUST00000184720 137 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Mir6989-201ENSMUST00000184812 65 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 4930403P22Rik-201ENSMUST00000192234 713 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm44342-201ENSMUST00000196874 129 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm43400-201ENSMUST00000197294 1254 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm44383-201ENSMUST00000198940 129 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm4751-201ENSMUST00000200620 1105 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm43964-201ENSMUST00000203570 301 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm44411-201ENSMUST00000204172 349 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm4042-201ENSMUST00000216946 637 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 AC116596.2-203ENSMUST00000227345 731 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 AC123917.1-201ENSMUST00000228063 1048 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm6563-201ENSMUST00000056396 869 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm14851-201ENSMUST00000077452 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Olfr539-201ENSMUST00000078967 960 ntAPPRIS P2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Platr26-201ENSMUST00000079720 641 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 1700024B05Rik-201ENSMUST00000064162 1576 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Scyl3-203ENSMUST00000161908 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Pcdh15-232ENSMUST00000177420 4878 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Tgfbr1-203ENSMUST00000107725 1713 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Olfr1254-203ENSMUST00000216587 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm5084-202ENSMUST00000224064 3609 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Trim12c-202ENSMUST00000130139 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Abcc9-201ENSMUST00000073173 7433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Trim5-201ENSMUST00000051795 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Zscan21-204ENSMUST00000110960 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm4952-201ENSMUST00000092931 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Olfr60-203ENSMUST00000211031 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Olfr60-204ENSMUST00000215023 2692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Pigc-202ENSMUST00000111594 3290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Rdh11-203ENSMUST00000161204 3262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Ankrd17-205ENSMUST00000197021 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 4930590J08Rik-203ENSMUST00000205686 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Dcdc5-201ENSMUST00000037284 3093 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Mllt10-202ENSMUST00000114669 3865 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm15509-201ENSMUST00000162615 2162 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Olfr1426-201ENSMUST00000112952 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Ripk1-203ENSMUST00000167374 6472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Fam196b-202ENSMUST00000165963 5371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Nudt12-201ENSMUST00000025065 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm12939-201ENSMUST00000117303 165 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm13141-201ENSMUST00000117417 456 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm15310-201ENSMUST00000117891 372 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm14466-201ENSMUST00000119028 451 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm7494-201ENSMUST00000121248 441 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
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