Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Tdrkh-205ENSMUST00000197495 2476 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Gramd1c-204ENSMUST00000214098 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Gm38412-201ENSMUST00000199205 3895 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 C430042M11Rik-201ENSMUST00000180515 1617 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Rfx4-202ENSMUST00000060397 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Pcdh15-211ENSMUST00000126920 6866 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Zfp462-203ENSMUST00000098070 10465 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Homez-201ENSMUST00000081162 5609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Gm23527-201ENSMUST00000104570 130 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Smim8-205ENSMUST00000108134 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Olfr1396-202ENSMUST00000109201 1170 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Gm8812-201ENSMUST00000118496 412 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Gm15188-201ENSMUST00000121264 704 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Gm12526-201ENSMUST00000154462 615 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Phf11d-203ENSMUST00000161031 1130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Gm7420-201ENSMUST00000162836 842 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Sbp-202ENSMUST00000181985 920 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Gm18848-201ENSMUST00000182069 792 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Gm27026-201ENSMUST00000183003 892 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Gm27401-201ENSMUST00000184052 173 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Gm38022-201ENSMUST00000191762 403 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Gm37068-201ENSMUST00000195168 640 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Gm37017-201ENSMUST00000195266 747 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Gm43122-201ENSMUST00000201752 354 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Olfr587-ps1-202ENSMUST00000209201 477 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Gm8168-201ENSMUST00000209631 948 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Ccl7-201ENSMUST00000021011 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Gm35024-201ENSMUST00000213359 972 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 AC127224.1-201ENSMUST00000218094 453 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Gm30239-201ENSMUST00000220776 780 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 AC134869.2-201ENSMUST00000225788 421 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Klrk1-201ENSMUST00000032252 1270 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Olfr691-201ENSMUST00000057528 969 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Olfr420-201ENSMUST00000068403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 AC122024.1-201ENSMUST00000219276 4850 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Satb1-214ENSMUST00000176669 4407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Prom1-208ENSMUST00000179059 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Zfp930-204ENSMUST00000212681 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Serpina9-201ENSMUST00000058464 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Vmn2r45-201ENSMUST00000164845 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Gm18409-201ENSMUST00000218988 2506 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Foxp1-206ENSMUST00000113326 7029 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Il1a-201ENSMUST00000028882 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 AC153971.1-201ENSMUST00000215097 3811 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Oscp1-201ENSMUST00000035497 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 F830016B08Rik-201ENSMUST00000171297 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Sh3d19-201ENSMUST00000107664 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Rbms3-205ENSMUST00000111772 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Dnah5-201ENSMUST00000067048 15637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Gm37525-201ENSMUST00000193499 2871 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Gm3608-201ENSMUST00000086725 2858 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Gm17435-201ENSMUST00000181452 2994 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Gm21284-201ENSMUST00000205532 3736 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Fam135a-208ENSMUST00000187752 5194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Gm42668-201ENSMUST00000200747 2487 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Olfr43-204ENSMUST00000215550 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 C3ar1-201ENSMUST00000042081 4305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Zfp638-203ENSMUST00000113836 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Gm45601-201ENSMUST00000211483 6753 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Gnb1-208ENSMUST00000176637 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Mtrr-201ENSMUST00000045827 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Olfr1338-202ENSMUST00000214922 2947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Igkv14-126-201ENSMUST00000103310 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Gm25631-201ENSMUST00000104390 130 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Gm13930-201ENSMUST00000118569 368 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Gm13486-201ENSMUST00000119910 282 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Gm12321-201ENSMUST00000121485 804 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Gm22025-201ENSMUST00000122734 302 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Gm12720-201ENSMUST00000123834 472 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Gm2709-201ENSMUST00000142979 350 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Casp12-204ENSMUST00000151332 1065 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Gm24422-201ENSMUST00000157800 119 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Polr3g-204ENSMUST00000161920 733 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Gm7244-201ENSMUST00000164658 455 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Gm20549-201ENSMUST00000174804 429 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Gm26179-201ENSMUST00000177723 132 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Gm7426-201ENSMUST00000179046 404 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 B230104I21Rik-201ENSMUST00000181143 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Gm27684-201ENSMUST00000183778 80 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Mir6357-201ENSMUST00000184246 104 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Gm27596-201ENSMUST00000185061 83 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Gm18875-201ENSMUST00000188563 882 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Gm29369-201ENSMUST00000190674 615 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Gm28070-201ENSMUST00000191502 445 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Rps4x-ps-201ENSMUST00000199852 793 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Spin2g-202ENSMUST00000203586 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Gm18422-201ENSMUST00000203663 1032 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Gm8921-201ENSMUST00000204306 649 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Gm45766-201ENSMUST00000211900 478 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 AC134606.1-201ENSMUST00000216324 721 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 AC155941.3-201ENSMUST00000218476 308 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 D830013O20Rik-202ENSMUST00000221180 683 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Gm34215-201ENSMUST00000221599 355 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 AC163660.1-201ENSMUST00000223696 818 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Gm21762-202ENSMUST00000225881 830 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 CT025630.2-201ENSMUST00000228293 487 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Npvf-201ENSMUST00000031853 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Gkn1-201ENSMUST00000032129 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms