Protein–RNA interactions for Protein: P70362

Ufd1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufd1P70362 Gm33312-201ENSMUST00000222443 332 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 AV026068-229ENSMUST00000225516 595 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 AC117949.1-201ENSMUST00000225547 419 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Tmem253-204ENSMUST00000228408 415 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Rpsa-ps2-201ENSMUST00000059546 880 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Olfr432-201ENSMUST00000062665 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Olfr703-201ENSMUST00000098142 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Hist1h2bb-201ENSMUST00000099703 508 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 AC153501.1-201ENSMUST00000218156 1860 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Fkbp15-202ENSMUST00000084528 3329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Gm5891-202ENSMUST00000186212 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Gm10662-202ENSMUST00000186928 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Fmo9-201ENSMUST00000027843 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 BC046251-201ENSMUST00000154632 3653 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 1700012E03Rik-201ENSMUST00000186237 1377 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Klf7-202ENSMUST00000114086 7662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Slamf1-201ENSMUST00000015460 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Cntn3-202ENSMUST00000203619 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Rapgef6-201ENSMUST00000094536 3372 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Gm37926-201ENSMUST00000191922 2424 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Gm38195-201ENSMUST00000194247 1499 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Gm5361-201ENSMUST00000211041 1498 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Ctsm-201ENSMUST00000099451 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Slc9a9-201ENSMUST00000033463 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Gm29438-201ENSMUST00000191298 2613 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Tial1-211ENSMUST00000165023 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 BC053393-201ENSMUST00000050937 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Gm10309-201ENSMUST00000095186 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Olfr204-202ENSMUST00000216261 5371 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 March1-208ENSMUST00000110259 3181 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Agl-201ENSMUST00000040603 9625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Gm37891-201ENSMUST00000195585 1326 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Gm42503-201ENSMUST00000199080 3706 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Ccl20-201ENSMUST00000027351 1417 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Gm30382-203ENSMUST00000199503 1858 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Macf1-202ENSMUST00000084301 23398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Hmmr-201ENSMUST00000020579 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Zfp758-202ENSMUST00000088765 2973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Mir760-201ENSMUST00000103257 119 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Vgll1-202ENSMUST00000114745 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Zfp616-203ENSMUST00000116546 531 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Gm26469-201ENSMUST00000116765 121 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Mir669e-201ENSMUST00000117003 119 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Gm13929-201ENSMUST00000117553 1125 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Gm14032-201ENSMUST00000117686 1026 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Gm11498-201ENSMUST00000120660 949 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Rpl36-ps2-201ENSMUST00000136893 311 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 AI646519-201ENSMUST00000140987 351 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Gm25962-201ENSMUST00000157173 168 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Gm16026-205ENSMUST00000162923 641 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Gm28041-201ENSMUST00000166080 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Olfr457-201ENSMUST00000170504 1039 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Scgb1b27-202ENSMUST00000173387 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Tnfsf10-202ENSMUST00000174840 989 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Scgb2b20-201ENSMUST00000179248 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Gm12424-201ENSMUST00000179673 447 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Gm26436-201ENSMUST00000180325 132 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Gm21013-201ENSMUST00000184952 1201 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Scgb2b18-201ENSMUST00000186529 523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Scgb2b11-201ENSMUST00000188293 523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Lemd1-209ENSMUST00000191418 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Gm38047-201ENSMUST00000193690 1133 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Gm5857-201ENSMUST00000198953 493 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Gm43263-201ENSMUST00000201619 560 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Gm44156-201ENSMUST00000203885 1189 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Gm32591-202ENSMUST00000204063 403 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Olfr1294-201ENSMUST00000208334 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Olfr1284-202ENSMUST00000209096 1064 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 BC024386-202ENSMUST00000209496 851 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Gm45309-201ENSMUST00000211528 695 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Gm45514-201ENSMUST00000211531 689 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 4930555F03Rik-205ENSMUST00000212179 1257 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Gm17950-201ENSMUST00000214617 646 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 CT009742.1-201ENSMUST00000222507 702 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 AC160931.1-201ENSMUST00000223298 413 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Anxa13-202ENSMUST00000227274 1201 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Ppbp-201ENSMUST00000031319 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Olfr410-201ENSMUST00000052254 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Olfr698-201ENSMUST00000074981 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Gpr15-201ENSMUST00000089318 1290 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Olfr1171-ps1-202ENSMUST00000150178 1398 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Trp53inp1-201ENSMUST00000029865 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Rfwd3-201ENSMUST00000038739 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Tcf7l2-202ENSMUST00000061496 4053 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Hlcs-209ENSMUST00000228910 4150 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Asb15-202ENSMUST00000117688 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Olfr286-201ENSMUST00000073612 3821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Gm3629-201ENSMUST00000171706 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Zfp804b-201ENSMUST00000164784 3924 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Zfp106-211ENSMUST00000171215 6391 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Gm43025-201ENSMUST00000201764 1886 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Gykl1-201ENSMUST00000066193 1990 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Zfp442-201ENSMUST00000109916 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Vmn1r22-203ENSMUST00000228076 3011 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Gm7982-201ENSMUST00000101011 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Gm6351-201ENSMUST00000101021 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Gm7682-201ENSMUST00000098289 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ufd1P70362 Zfp78-202ENSMUST00000108559 1539 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms