Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 AC154597.1-201ENSMUST00000224095 2713 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Gm6679-201ENSMUST00000191467 1869 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Tlr4-201ENSMUST00000048096 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Nmur2-201ENSMUST00000037682 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Add3-201ENSMUST00000025999 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Lhfpl3-201ENSMUST00000196406 2589 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Vmn1r6-204ENSMUST00000227188 8185 ntAPPRIS ALT2 BASIC7□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Gm45175-201ENSMUST00000208295 1375 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Vmn1r196-205ENSMUST00000228557 5790 ntAPPRIS P2 BASIC7□□□□□ -1.29
SbdsP70122 CAAA01216754.1-201ENSMUST00000215882 1836 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Igkv2-137-201ENSMUST00000103302 501 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Gm11318-201ENSMUST00000118640 961 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Gm11498-201ENSMUST00000120660 949 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Gm12720-201ENSMUST00000123834 472 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Gm14097-201ENSMUST00000147868 470 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Gm14241-201ENSMUST00000151260 264 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Fcor-201ENSMUST00000159364 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Ly6k-202ENSMUST00000168815 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Gm26179-201ENSMUST00000177723 132 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Gm21392-201ENSMUST00000182950 972 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Gm29099-201ENSMUST00000187370 760 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Smpx-208ENSMUST00000190091 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Gm8539-201ENSMUST00000199822 501 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Gm43263-201ENSMUST00000201619 560 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Gm30708-201ENSMUST00000202183 312 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Gm44823-201ENSMUST00000204775 1107 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Gm45309-201ENSMUST00000211528 695 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Gm39271-201ENSMUST00000212881 434 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Gm2774-201ENSMUST00000213650 1165 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Akr1c13-201ENSMUST00000021634 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Mplkip-202ENSMUST00000221480 582 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
SbdsP70122 AC160114.3-201ENSMUST00000222256 560 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
SbdsP70122 AC132954.2-201ENSMUST00000222400 403 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SbdsP70122 AC140267.1-201ENSMUST00000226485 213 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Il17f-201ENSMUST00000039046 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Odf3l1-201ENSMUST00000055036 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Olfr420-201ENSMUST00000068403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Gm6054-201ENSMUST00000078052 378 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Gm25587-201ENSMUST00000082498 166 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Gm6494-201ENSMUST00000218604 2298 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Sphkap-205ENSMUST00000160953 8154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Prkd3-208ENSMUST00000168887 5884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Tnik-206ENSMUST00000160518 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Angptl1-202ENSMUST00000111720 1332 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Gnb1-208ENSMUST00000176637 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Rgs22-203ENSMUST00000172831 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Gm37283-201ENSMUST00000193111 1571 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Gm31181-201ENSMUST00000217731 2283 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Cxcr4-201ENSMUST00000052172 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SbdsP70122 4930517E11Rik-201ENSMUST00000129584 1457 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Gm44677-201ENSMUST00000209151 3739 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Zfp760-201ENSMUST00000073312 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Cntn5-201ENSMUST00000074133 3297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SbdsP70122 1810064F22Rik-203ENSMUST00000188595 2307 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SbdsP70122 C030015A19Rik-201ENSMUST00000203368 2551 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SbdsP70122 6430584L05Rik-201ENSMUST00000204412 3151 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Gm29461-201ENSMUST00000189232 4176 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Ighv1-53-201ENSMUST00000103523 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Ighv1-69-201ENSMUST00000103539 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Gm26417-201ENSMUST00000104274 135 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Eif3m-202ENSMUST00000111110 817 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Gm12903-201ENSMUST00000121015 544 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Gm12290-201ENSMUST00000145095 2112 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Gm15239-201ENSMUST00000150690 603 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Gm24130-201ENSMUST00000158536 151 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Mir1930-201ENSMUST00000158799 84 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Gm17022-201ENSMUST00000166415 922 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Gm18428-201ENSMUST00000194986 791 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Gm43040-201ENSMUST00000202399 558 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Gm45122-201ENSMUST00000206376 784 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Gm45864-201ENSMUST00000211965 1019 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SbdsP70122 AC131029.2-203ENSMUST00000228116 1244 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Scp2d1-201ENSMUST00000028918 760 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SbdsP70122 H2-M11-201ENSMUST00000041964 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Olfr101-201ENSMUST00000058046 1039 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Rpsa-ps2-201ENSMUST00000059546 880 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Cldn34b2-201ENSMUST00000076671 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Olfr220-201ENSMUST00000085861 978 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Timp1-201ENSMUST00000009530 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Bcap29-202ENSMUST00000177962 6155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Pomp-202ENSMUST00000201120 3850 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Zfp607a-202ENSMUST00000205534 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Gm45360-201ENSMUST00000210698 1405 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Abcc2-201ENSMUST00000026208 8027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Olfr1338-202ENSMUST00000214922 2947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Rbms3-206ENSMUST00000111773 7908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Fmn1-202ENSMUST00000099576 11817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Gm42763-201ENSMUST00000199595 2087 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Pdzd9-202ENSMUST00000127845 1327 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Ptprc-204ENSMUST00000182755 4611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Plek-201ENSMUST00000020321 3896 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Qsox2-202ENSMUST00000091263 4011 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Gm42940-201ENSMUST00000200361 2362 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Gm14548-201ENSMUST00000070639 2128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Gm15731-201ENSMUST00000146887 2195 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Itih4-201ENSMUST00000006703 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Itih4-202ENSMUST00000078490 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Gm23834-201ENSMUST00000104436 129 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Ccdc32-202ENSMUST00000110833 732 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SbdsP70122 Gm12447-201ENSMUST00000119110 470 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.2 ms