Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 CT010505.3-201ENSMUST00000227835 1651 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
VdrP48281 Usp40-201ENSMUST00000040783 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
VdrP48281 Armc8-203ENSMUST00000186049 2761 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
VdrP48281 Trappc1-202ENSMUST00000102601 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm2348-201ENSMUST00000108782 300 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
VdrP48281 Paqr5-202ENSMUST00000113990 1073 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm15209-201ENSMUST00000117703 400 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
VdrP48281 Rpl38-ps1-201ENSMUST00000117723 215 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm12817-201ENSMUST00000119622 610 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm14939-201ENSMUST00000120347 680 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm15116-201ENSMUST00000122248 663 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm11739-201ENSMUST00000125269 723 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm11364-201ENSMUST00000137593 297 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
VdrP48281 Banf2os-202ENSMUST00000145504 386 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm13595-201ENSMUST00000145994 494 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
VdrP48281 1700071M16Rik-202ENSMUST00000167672 767 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
VdrP48281 H2-Aa-204ENSMUST00000174751 826 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
VdrP48281 1190005I06Rik-203ENSMUST00000180677 533 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm26641-201ENSMUST00000181499 954 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm26933-201ENSMUST00000182320 827 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm29290-201ENSMUST00000185385 597 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
VdrP48281 Ly6e-208ENSMUST00000188042 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm28535-201ENSMUST00000188069 885 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm38281-201ENSMUST00000192301 315 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm38122-201ENSMUST00000192679 885 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm8869-201ENSMUST00000195222 947 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm30613-201ENSMUST00000197277 512 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm44451-201ENSMUST00000203767 483 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm43950-201ENSMUST00000204767 996 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm44857-201ENSMUST00000208331 196 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
VdrP48281 Bc1-ps1-201ENSMUST00000208471 318 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
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VdrP48281 Pvrig-201ENSMUST00000211088 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
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VdrP48281 AC137902.2-201ENSMUST00000227989 576 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
VdrP48281 4930553J12Rik-201ENSMUST00000023648 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gsta2-201ENSMUST00000034902 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
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VdrP48281 Pnliprp1-201ENSMUST00000048644 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
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VdrP48281 Mei1-204ENSMUST00000189540 3718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
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VdrP48281 Erp44-201ENSMUST00000030028 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
VdrP48281 Mbd5-201ENSMUST00000047413 8543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
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VdrP48281 Fndc3b-204ENSMUST00000195008 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
VdrP48281 Snx10-207ENSMUST00000179365 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
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VdrP48281 2610028E06Rik-205ENSMUST00000156350 3623 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
VdrP48281 Serpinb8-201ENSMUST00000000514 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
VdrP48281 Kif2a-201ENSMUST00000022204 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
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VdrP48281 Trappc2-201ENSMUST00000112192 1294 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
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VdrP48281 Gm13617-201ENSMUST00000155350 675 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
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VdrP48281 Gm10267-202ENSMUST00000181652 341 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm8614-201ENSMUST00000182528 978 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
VdrP48281 Klk1b7-ps-202ENSMUST00000183762 619 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gtpbp4-ps2-201ENSMUST00000184058 256 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
VdrP48281 Mocs2-212ENSMUST00000184214 551 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
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