Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 2310081O03Rik-201ENSMUST00000128591 759 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Gm12027-201ENSMUST00000146531 949 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Gm10660-201ENSMUST00000148610 1203 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Prl2c5-204ENSMUST00000151144 623 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Gm11423-202ENSMUST00000152784 686 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Gm12031-201ENSMUST00000156150 627 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Gm16006-201ENSMUST00000160938 566 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Gm28801-201ENSMUST00000188761 449 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Gm29214-201ENSMUST00000190216 570 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Gm37072-201ENSMUST00000194570 837 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Gm9869-202ENSMUST00000214999 679 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Olfr153-201ENSMUST00000217113 1258 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
SrprbP47758 AC116589.9-201ENSMUST00000221462 908 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Cypt4-201ENSMUST00000053956 629 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Gm24451-201ENSMUST00000083353 133 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Tnfrsf22-202ENSMUST00000084396 564 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Olfr1416-201ENSMUST00000086837 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
SrprbP47758 5430421F17Rik-202ENSMUST00000210268 2295 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Zwint-202ENSMUST00000105431 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Rfc1-201ENSMUST00000172732 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Gm43398-201ENSMUST00000196584 2742 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Ide-201ENSMUST00000131070 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Phlpp2-201ENSMUST00000034175 7839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Gm12022-201ENSMUST00000143311 1340 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Ubl7-209ENSMUST00000216925 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Gm10475-201ENSMUST00000084713 1796 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Lin54-204ENSMUST00000137750 4056 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
SrprbP47758 AC165260.6-206ENSMUST00000223884 3698 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Fam135a-208ENSMUST00000187752 5194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Gm4961-201ENSMUST00000197982 2249 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Pabpc4l-201ENSMUST00000166505 5218 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Zfp638-203ENSMUST00000113836 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Prkd3-201ENSMUST00000003191 5517 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
SrprbP47758 AC154597.1-201ENSMUST00000224095 2713 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
SrprbP47758 AC158115.1-201ENSMUST00000222830 3182 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Nipa2-203ENSMUST00000119041 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Tlr11-201ENSMUST00000063570 2993 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.96□□□□□ -1.13
SrprbP47758 AC126549.1-201ENSMUST00000225044 3687 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Trappc13-206ENSMUST00000179891 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Bbx-205ENSMUST00000114488 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
SrprbP47758 Gm29660-201ENSMUST00000185631 2166 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Gm29309-201ENSMUST00000186251 2166 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Gm28317-201ENSMUST00000187200 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Gm28254-201ENSMUST00000189207 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Gm29063-201ENSMUST00000190236 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Gm29632-201ENSMUST00000190335 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Gm28538-201ENSMUST00000190919 2166 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Psd3-203ENSMUST00000093468 1739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Macrod2os2-201ENSMUST00000143227 3566 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Med12l-204ENSMUST00000164225 10264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
SrprbP47758 AC124572.1-201ENSMUST00000218155 2406 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Fam19a1-201ENSMUST00000075080 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Mir466f-2-201ENSMUST00000104805 94 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Eqtn-202ENSMUST00000107097 1164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Fxyd1-203ENSMUST00000108110 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Lage3-202ENSMUST00000114152 746 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Gm11835-201ENSMUST00000120635 663 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Gm11726-201ENSMUST00000121028 424 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Scgb2b22-ps-201ENSMUST00000121947 340 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Gm5834-201ENSMUST00000126680 1026 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Gm15743-201ENSMUST00000129645 242 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
SrprbP47758 4930412L05Rik-202ENSMUST00000146501 1241 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Gm28585-201ENSMUST00000187587 442 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Gm7891-201ENSMUST00000190284 843 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
SrprbP47758 1700020G17Rik-203ENSMUST00000191286 723 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Gm5103-201ENSMUST00000192081 1086 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Gm36966-201ENSMUST00000192217 413 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Gm35801-201ENSMUST00000193927 479 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Gm37148-201ENSMUST00000195097 716 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Gm43569-201ENSMUST00000196200 559 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Gm9710-201ENSMUST00000198053 499 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Gm2975-201ENSMUST00000209710 820 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Gm2774-201ENSMUST00000213650 1165 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Gm30676-202ENSMUST00000214464 793 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
SrprbP47758 AC134606.1-201ENSMUST00000216324 721 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
SrprbP47758 AC153528.1-201ENSMUST00000217696 434 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
SrprbP47758 AC153821.2-201ENSMUST00000220253 468 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
SrprbP47758 AC131117.1-201ENSMUST00000225154 1171 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Olfr109-201ENSMUST00000031086 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Olfr691-201ENSMUST00000057528 969 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Prelid2-201ENSMUST00000070949 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
SrprbP47758 n-R5s169-201ENSMUST00000083110 120 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Vmn1r204-201ENSMUST00000091728 909 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Olfr1306-201ENSMUST00000099607 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Olfr1277-201ENSMUST00000099619 962 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
SrprbP47758 4930432O09Rik-201ENSMUST00000219710 1986 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Olfr972-203ENSMUST00000216167 1522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Gm43876-201ENSMUST00000203831 3229 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Gm15394-201ENSMUST00000119656 1308 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Gm26645-201ENSMUST00000181076 1316 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Gm28359-201ENSMUST00000187470 1322 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Olfr417-202ENSMUST00000217962 5662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Cntn5-201ENSMUST00000074133 3297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
SrprbP47758 St18-212ENSMUST00000151281 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Bglap3-202ENSMUST00000107542 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Plch1-203ENSMUST00000084105 6245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Mrpl48-208ENSMUST00000150042 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Slmap-202ENSMUST00000090359 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
SrprbP47758 4930402F06Rik-202ENSMUST00000113010 1372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
SrprbP47758 5430401H09Rik-202ENSMUST00000218836 2620 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms