Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Olfr312-202ENSMUST00000216407 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Tek-203ENSMUST00000102798 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm15228-201ENSMUST00000142044 3440 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Oxgr1-201ENSMUST00000058213 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Tcf7-201ENSMUST00000086844 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm37106-201ENSMUST00000193760 1532 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Osbpl9-216ENSMUST00000161363 2356 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm43557-201ENSMUST00000197100 2370 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Vmn1r220-204ENSMUST00000227950 6238 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Epgn-201ENSMUST00000041516 1760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Spic-201ENSMUST00000004473 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm28311-201ENSMUST00000185236 1497 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm28549-202ENSMUST00000191354 1497 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Frem2-201ENSMUST00000091137 12348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Prr14l-201ENSMUST00000120129 9959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm37078-201ENSMUST00000193314 2009 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Ccl20-201ENSMUST00000027351 1417 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Mbnl2-202ENSMUST00000167459 4534 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Olfr55-204ENSMUST00000216633 4758 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 4930553P18Rik-201ENSMUST00000201164 1659 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Eif2s3x-201ENSMUST00000050328 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Abcd2-201ENSMUST00000069511 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm18830-201ENSMUST00000199036 1396 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 A2ml1-201ENSMUST00000060574 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Vmn1r203-203ENSMUST00000228889 8213 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Nlrc4-201ENSMUST00000052124 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm40518-202ENSMUST00000214538 4080 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm42513-201ENSMUST00000197831 2119 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Obox6-201ENSMUST00000108513 1344 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm3752-201ENSMUST00000164366 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Ap4e1-201ENSMUST00000002063 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Txndc16-207ENSMUST00000147853 2816 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm1587-201ENSMUST00000100372 372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Igkv4-80-201ENSMUST00000103341 348 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Ighv9-1-201ENSMUST00000103471 294 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Ighv9-2-201ENSMUST00000103472 351 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm25614-201ENSMUST00000104013 133 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm24986-201ENSMUST00000104452 132 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Swi5-204ENSMUST00000113400 522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm15203-201ENSMUST00000117668 455 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm11320-201ENSMUST00000119434 463 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm11383-201ENSMUST00000121346 807 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm12297-201ENSMUST00000121380 979 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Atp5l-ps2-201ENSMUST00000121382 314 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm15644-201ENSMUST00000121764 387 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm12094-201ENSMUST00000121781 472 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Rapgef4os1-201ENSMUST00000126462 638 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm15787-207ENSMUST00000152014 885 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm25962-201ENSMUST00000157173 168 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm7991-201ENSMUST00000168668 591 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm6536-201ENSMUST00000171180 615 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Zfp106-211ENSMUST00000171215 6391 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Mir1231-201ENSMUST00000175639 81 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Pantr1-203ENSMUST00000176154 514 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Prh1-203ENSMUST00000177523 993 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm20738-201ENSMUST00000177666 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 4930526L06Rik-201ENSMUST00000181137 1022 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm5787-201ENSMUST00000183049 1038 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm5181-201ENSMUST00000183140 971 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm29049-201ENSMUST00000185705 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm29529-201ENSMUST00000187154 714 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm20816-202ENSMUST00000187846 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm20809-202ENSMUST00000187943 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm17847-201ENSMUST00000188261 1127 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm21728-201ENSMUST00000188442 695 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm21889-201ENSMUST00000188487 695 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm20932-201ENSMUST00000189115 694 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm21721-202ENSMUST00000189253 1225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm21920-201ENSMUST00000190042 695 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm28171-201ENSMUST00000190100 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Sytl2-206ENSMUST00000190731 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm20867-202ENSMUST00000190987 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm44760-201ENSMUST00000206375 1173 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 1810049I09Rik-202ENSMUST00000206760 556 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 A330076H08Rik-203ENSMUST00000208822 1164 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm7394-201ENSMUST00000209138 1032 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Olfr674-ps1-201ENSMUST00000209383 946 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm45732-201ENSMUST00000212460 586 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm34424-201ENSMUST00000213400 782 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 AC079680.1-202ENSMUST00000219835 654 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 RMST_1.1-213ENSMUST00000220288 792 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Tpbpb-203ENSMUST00000223978 991 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 AV026068-229ENSMUST00000225516 595 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 H2-M11-201ENSMUST00000041964 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Olfr672-201ENSMUST00000050599 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Olfr683-201ENSMUST00000061284 960 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm22504-201ENSMUST00000082963 139 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Pbrm1-202ENSMUST00000022474 4843 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Ifi204-201ENSMUST00000111214 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Olfr1426-205ENSMUST00000219155 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Dnajc15-202ENSMUST00000226459 6193 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 AC161595.1-201ENSMUST00000216389 1993 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Lipt1-201ENSMUST00000041621 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm9048-201ENSMUST00000177744 2409 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm9040-201ENSMUST00000177762 2409 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms