Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Ddb1-201ENSMUST00000025649 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Zfp239-207ENSMUST00000172088 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Smarca2-242ENSMUST00000208751 1846 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Zfp449-201ENSMUST00000101560 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm26876-201ENSMUST00000180875 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprkP35822 AI427809-203ENSMUST00000123127 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Stard13-202ENSMUST00000110483 5662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Mpp7-201ENSMUST00000115869 4975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprkP35822 A330032B11Rik-201ENSMUST00000180609 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Ank1-213ENSMUST00000141784 6566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm38155-201ENSMUST00000192285 2763 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Prokr2-204ENSMUST00000142766 3932 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprkP35822 5330413P13Rik-203ENSMUST00000150466 2173 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Pcdh11x-201ENSMUST00000050239 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Olfr50-201ENSMUST00000112950 1157 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm15967-201ENSMUST00000120027 1116 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm11731-201ENSMUST00000139704 670 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm6401-202ENSMUST00000164232 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm17079-201ENSMUST00000167231 666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm21241-201ENSMUST00000179551 934 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprkP35822 1700010L04Rik-203ENSMUST00000179662 1015 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm27024-201ENSMUST00000182561 755 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm27355-201ENSMUST00000185045 128 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm29582-201ENSMUST00000185667 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprkP35822 6030442E23Rik-201ENSMUST00000186618 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm20838-202ENSMUST00000187712 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprkP35822 1700040F15Rik-201ENSMUST00000188244 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm21996-201ENSMUST00000188269 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm21256-202ENSMUST00000188881 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm28891-202ENSMUST00000189333 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm21094-202ENSMUST00000189577 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm20792-201ENSMUST00000189765 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm28919-201ENSMUST00000190026 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm21861-202ENSMUST00000190806 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Rpap3-ps1-201ENSMUST00000190928 454 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm20819-201ENSMUST00000191091 925 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm20871-201ENSMUST00000191322 931 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm21865-202ENSMUST00000191443 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm30737-201ENSMUST00000192683 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm37380-201ENSMUST00000193752 397 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm35134-201ENSMUST00000194086 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm5990-201ENSMUST00000203126 746 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm44982-201ENSMUST00000208795 471 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprkP35822 H60c-203ENSMUST00000216211 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprkP35822 AC154248.1-201ENSMUST00000222072 495 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Eif4g2-213ENSMUST00000162415 7995 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Zbtb18-212ENSMUST00000195612 3790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Rtel1-203ENSMUST00000098971 4307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm7982-202ENSMUST00000136313 1536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm17751-201ENSMUST00000189132 2004 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm21846-201ENSMUST00000179257 3073 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Serpina3c-201ENSMUST00000085050 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprkP35822 5430419D17Rik-203ENSMUST00000208921 7948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm28928-201ENSMUST00000187286 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Blm-202ENSMUST00000170315 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Lipn-201ENSMUST00000025682 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm44704-201ENSMUST00000208963 1990 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm24789-201ENSMUST00000104282 131 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm14529-201ENSMUST00000117894 406 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm14950-201ENSMUST00000149500 1155 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Igkv4-53-201ENSMUST00000166380 292 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Olfr760-ps1-201ENSMUST00000172563 748 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprkP35822 S100a2-201ENSMUST00000179550 315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm28985-201ENSMUST00000189261 356 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Olfr565-ps1-201ENSMUST00000209824 944 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm9231-201ENSMUST00000220817 1009 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprkP35822 AC164618.3-201ENSMUST00000224863 681 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprkP35822 AC139197.1-201ENSMUST00000228332 813 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Xlr5b-201ENSMUST00000097221 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Itk-201ENSMUST00000020664 4272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm12021-201ENSMUST00000121061 1746 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm15509-201ENSMUST00000162615 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Umodl1-202ENSMUST00000066981 4662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Zfp473-202ENSMUST00000118162 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm28993-201ENSMUST00000186236 1499 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm37870-201ENSMUST00000192349 1499 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm37467-202ENSMUST00000192785 1499 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm37252-201ENSMUST00000195063 1499 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm38013-202ENSMUST00000195453 1499 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm37286-201ENSMUST00000195885 1499 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Olfr77-202ENSMUST00000217347 5980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Vmn2r16-201ENSMUST00000165180 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Slc16a14-201ENSMUST00000027422 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Elmod2-201ENSMUST00000053902 4319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Slc6a18-203ENSMUST00000109680 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Galnt15-202ENSMUST00000164208 3563 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Olfr338-203ENSMUST00000217511 5724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm5177-202ENSMUST00000183337 3785 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprkP35822 4921528I07Rik-202ENSMUST00000213446 3798 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Prdm15-203ENSMUST00000121584 6194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Myo6-205ENSMUST00000127779 4067 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Olfr780-202ENSMUST00000215503 2910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Slc15a1-201ENSMUST00000088386 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm37255-201ENSMUST00000193302 3060 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm15149-201ENSMUST00000119370 360 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm14038-201ENSMUST00000121500 807 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm11820-201ENSMUST00000139614 664 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm14640-201ENSMUST00000145800 437 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm24179-201ENSMUST00000158925 127 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.7 ms