Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Pbrm1-205ENSMUST00000112092 5009 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Enpp6-201ENSMUST00000039840 4970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Lpar2-201ENSMUST00000034325 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Eif2ak4-202ENSMUST00000102527 4906 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm7205-201ENSMUST00000196032 1323 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Cacna1c-222ENSMUST00000190285 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Mnd1-ps-202ENSMUST00000224435 2574 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Sulf1-205ENSMUST00000186051 4563 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Zfp638-202ENSMUST00000113835 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm24888-201ENSMUST00000104387 130 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Zfp971-201ENSMUST00000108925 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Eaf2-203ENSMUST00000114825 668 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Smim24-202ENSMUST00000118206 949 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm14335-201ENSMUST00000119165 810 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm13245-201ENSMUST00000119646 260 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm13537-201ENSMUST00000120467 267 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Fundc1-203ENSMUST00000142638 597 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprmP28828 A330102I10Rik-203ENSMUST00000145801 737 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm14233-201ENSMUST00000149576 439 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm17217-201ENSMUST00000166613 469 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm27409-201ENSMUST00000184727 80 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprmP28828 4930519F24Rik-201ENSMUST00000185764 579 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Ms4a5-202ENSMUST00000186937 816 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprmP28828 4933433N18Rik-201ENSMUST00000222134 1220 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Vmn1r233-201ENSMUST00000056339 960 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Ms4a5-201ENSMUST00000067673 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprmP28828 n-R5s173-201ENSMUST00000082620 119 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Zfp970-201ENSMUST00000099002 794 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm14391-201ENSMUST00000099028 473 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Mcf2l-205ENSMUST00000110871 3401 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm45645-201ENSMUST00000211470 1963 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Npy2r-201ENSMUST00000029633 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprmP28828 4930444G20Rik-201ENSMUST00000092672 1773 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Cntnap4-202ENSMUST00000118171 4860 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Tmed5-201ENSMUST00000002837 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Crispld1-202ENSMUST00000159958 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm17841-201ENSMUST00000210711 2425 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprmP28828 9930111J21Rik2-201ENSMUST00000093152 2403 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprmP28828 9930111J21Rik1-201ENSMUST00000093153 2403 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Sema6a-210ENSMUST00000156422 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprmP28828 5430403N17Rik-201ENSMUST00000210717 2553 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Osbpl9-216ENSMUST00000161363 2356 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm37274-201ENSMUST00000192167 1682 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Kif24-201ENSMUST00000030148 4333 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Msantd4-202ENSMUST00000212075 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Atp1a4-201ENSMUST00000111243 3470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Lrrtm4-205ENSMUST00000133918 2255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Lhx4-201ENSMUST00000027740 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm45182-201ENSMUST00000207579 2404 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprmP28828 U2surp-201ENSMUST00000078374 3520 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprmP28828 AC122828.2-201ENSMUST00000222511 2880 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm7146-201ENSMUST00000116079 739 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm13533-201ENSMUST00000121104 177 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm11804-201ENSMUST00000121663 468 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Tbata-207ENSMUST00000140456 953 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Tbata-208ENSMUST00000143207 982 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm44184-201ENSMUST00000204290 132 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm45782-201ENSMUST00000212670 366 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Olfr809-203ENSMUST00000218237 1100 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprmP28828 AC165092.4-201ENSMUST00000225025 679 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprmP28828 CT009711.4-201ENSMUST00000225685 198 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Ssxb2-201ENSMUST00000023931 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Ctag2-201ENSMUST00000033524 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Olfr809-201ENSMUST00000059891 1100 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm15732-201ENSMUST00000079794 480 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Enah-211ENSMUST00000193703 11229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Tcp10c-201ENSMUST00000097403 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Patj-203ENSMUST00000102792 3755 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Myo7a-202ENSMUST00000107122 6867 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprmP28828 AC130219.1-201ENSMUST00000228406 3433 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm37897-201ENSMUST00000192613 3561 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Clca3a2-201ENSMUST00000029929 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Ptpn3-201ENSMUST00000075637 6369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Zfp882-201ENSMUST00000110002 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Rnf222-201ENSMUST00000065213 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Ptk2b-208ENSMUST00000178730 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm15011-201ENSMUST00000117724 1480 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Tgm3-201ENSMUST00000110299 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Mbnl2-202ENSMUST00000167459 4534 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Magi2-207ENSMUST00000197553 3264 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm19840-201ENSMUST00000169624 882 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm25065-201ENSMUST00000177914 132 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprmP28828 D13Ertd608e-201ENSMUST00000179131 417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm25891-201ENSMUST00000180050 132 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm28943-201ENSMUST00000186187 615 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm28736-201ENSMUST00000186257 615 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm29401-201ENSMUST00000186690 615 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm29178-204ENSMUST00000186784 615 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm28589-201ENSMUST00000186991 615 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm28936-201ENSMUST00000187153 615 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm29121-201ENSMUST00000187611 615 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm28243-201ENSMUST00000187801 615 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm28844-202ENSMUST00000187977 615 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm29058-201ENSMUST00000189510 615 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm29624-201ENSMUST00000190018 615 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm28780-201ENSMUST00000190223 615 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
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