Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Gm38200-201ENSMUST00000192083 2111 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
P20040 Zfp619-201ENSMUST00000108015 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
P20040 Dapp1-203ENSMUST00000136613 2950 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
P20040 Kidins220-201ENSMUST00000066652 7409 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
P20040 Gm45175-201ENSMUST00000208295 1375 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
P20040 C030015A19Rik-201ENSMUST00000203368 2551 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
P20040 Gm43876-201ENSMUST00000203831 3229 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P20040 Tor1aip2-202ENSMUST00000065648 2529 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P20040 Cntnap5a-201ENSMUST00000043725 10945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P20040 Gm20075-201ENSMUST00000220449 2161 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P20040 C530050E15Rik-201ENSMUST00000181373 3837 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P20040 Tmcc3-203ENSMUST00000117929 3317 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P20040 Gm42989-201ENSMUST00000200646 2306 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P20040 Pum1-202ENSMUST00000097862 3991 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P20040 Sv2b-204ENSMUST00000206344 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P20040 Synb-201ENSMUST00000059362 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P20040 Zcchc18-201ENSMUST00000033804 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P20040 Gm38381-201ENSMUST00000193594 2275 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P20040 Gdap10-201ENSMUST00000180613 5003 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P20040 Mpv17l-203ENSMUST00000128757 3089 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P20040 Dcdc5-202ENSMUST00000122388 4957 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P20040 Gm22707-201ENSMUST00000103834 110 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P20040 Gm25311-201ENSMUST00000104136 132 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P20040 Wfdc15b-202ENSMUST00000109376 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P20040 Gm13930-201ENSMUST00000118569 368 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P20040 Dnajc5b-202ENSMUST00000118735 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P20040 Rbpsuh-ps1-201ENSMUST00000119456 1006 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P20040 Gm9439-201ENSMUST00000119554 973 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P20040 Gm12104-201ENSMUST00000120359 979 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P20040 Rpl15-ps1-201ENSMUST00000120694 564 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P20040 A330102I10Rik-201ENSMUST00000130109 501 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P20040 Gm14457-201ENSMUST00000148069 1161 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P20040 1700073E17Rik-203ENSMUST00000148424 741 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P20040 Gm24057-201ENSMUST00000158616 302 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P20040 Arpp19-204ENSMUST00000167885 540 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P20040 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P20040 Gm8357-201ENSMUST00000181115 1011 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P20040 Sbp-202ENSMUST00000181985 920 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P20040 Wfdc15b-201ENSMUST00000018355 510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P20040 Gm27782-201ENSMUST00000185059 199 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P20040 C730036E19Rik-201ENSMUST00000188305 1102 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P20040 Ptma-204ENSMUST00000188533 593 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P20040 Gm29349-201ENSMUST00000188692 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P20040 Gm7412-201ENSMUST00000191692 605 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P20040 Gm24826-202ENSMUST00000197298 216 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P20040 Gm43495-201ENSMUST00000200060 205 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P20040 Gm9652-201ENSMUST00000209345 163 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P20040 Gm19007-201ENSMUST00000217746 874 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P20040 AC131117.2-202ENSMUST00000224539 547 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P20040 AC106830.2-201ENSMUST00000226624 943 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P20040 AC133958.1-201ENSMUST00000227085 961 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P20040 Olfr1448-201ENSMUST00000054737 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P20040 Gm42772-201ENSMUST00000199945 3041 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P20040 Slc4a4-203ENSMUST00000130041 3335 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P20040 Ppp1r3b-201ENSMUST00000070481 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P20040 Akr1e1-202ENSMUST00000110691 3288 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P20040 Olfr1555-ps1-202ENSMUST00000219261 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P20040 Gm8180-201ENSMUST00000163599 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P20040 Gm3327-201ENSMUST00000168906 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P20040 Gm28965-201ENSMUST00000186015 1500 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P20040 Gm3752-201ENSMUST00000164366 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P20040 Nmd3-201ENSMUST00000029358 9135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P20040 Cyp4a10-201ENSMUST00000058785 2109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P20040 Gm10619-201ENSMUST00000098372 2695 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
P20040 Sh2d1b2-202ENSMUST00000162752 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
P20040 Kcnmb2-205ENSMUST00000192429 2357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
P20040 Cyp4a10-202ENSMUST00000094886 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
P20040 AC139754.2-201ENSMUST00000218037 1455 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
P20040 Prox1-202ENSMUST00000175916 7913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
P20040 1700014D04Rik-203ENSMUST00000180139 3231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
P20040 Timm17a-201ENSMUST00000081104 7280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
P20040 Kmt2c-201ENSMUST00000045291 14967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
P20040 Gm45949-201ENSMUST00000221550 1895 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
P20040 Cnpy1-205ENSMUST00000141601 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
P20040 Gm29461-201ENSMUST00000189232 4176 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
P20040 Gm37877-201ENSMUST00000191630 2709 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
P20040 Spire1-202ENSMUST00000082243 4950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
P20040 Grik2-202ENSMUST00000105484 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
P20040 Cep112-202ENSMUST00000106715 1161 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
P20040 Gm14893-201ENSMUST00000117904 282 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
P20040 Gm14869-201ENSMUST00000119007 884 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
P20040 Gm13900-201ENSMUST00000119402 498 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
P20040 4930448K20Rik-201ENSMUST00000120570 998 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
P20040 Gm6067-201ENSMUST00000121648 491 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
P20040 Gm14251-201ENSMUST00000122133 279 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
P20040 Gm26480-201ENSMUST00000122619 297 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
P20040 Gm16357-201ENSMUST00000144091 474 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
P20040 Gm8715-201ENSMUST00000162728 531 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
P20040 Gm4613-201ENSMUST00000165488 276 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
P20040 n-R5s93-201ENSMUST00000180091 119 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
P20040 Mir8120-201ENSMUST00000185035 139 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
P20040 Gm28413-201ENSMUST00000189369 291 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
P20040 Gm37871-201ENSMUST00000194973 688 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
P20040 Gm6077-201ENSMUST00000196008 499 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
P20040 Gm43357-201ENSMUST00000197132 342 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
P20040 Mark1-ps2-201ENSMUST00000197823 384 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
P20040 AL603745.1-201ENSMUST00000215473 532 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
P20040 Gm8275-201ENSMUST00000219732 424 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
P20040 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
P20040 Gm46424-201ENSMUST00000221567 168 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
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