Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 6720475M21Rik-201ENSMUST00000201755 2753 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Iqch-201ENSMUST00000042322 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Vmn1r86-204ENSMUST00000227700 5487 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 4930432O09Rik-201ENSMUST00000219710 1986 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Gm37372-201ENSMUST00000193577 3311 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Rnf180-202ENSMUST00000224011 3785 ntAPPRIS P2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Cldn12-202ENSMUST00000115445 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Gm27179-201ENSMUST00000184652 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Map7d2-201ENSMUST00000043151 3087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Slc15a2-208ENSMUST00000165531 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Kmo-201ENSMUST00000040250 2695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Gm6451-201ENSMUST00000121488 717 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Tnfsf10-202ENSMUST00000174840 989 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Gm20620-201ENSMUST00000177528 168 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Gm44226-201ENSMUST00000205203 1195 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Olfr1289-202ENSMUST00000207494 1014 ntAPPRIS P2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 AC164881.1-201ENSMUST00000215648 664 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
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PtprbB2RU80 AC154324.1-201ENSMUST00000226711 814 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Sec24a-201ENSMUST00000038210 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Cetn1-201ENSMUST00000062769 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
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PtprbB2RU80 Vmn1r51-213ENSMUST00000228880 4353 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Srrm4os-201ENSMUST00000126959 3360 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Cd59a-203ENSMUST00000168176 1806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Vmn1r89-207ENSMUST00000227390 1348 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Olfr1048-202ENSMUST00000215607 2981 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Pik3r4-201ENSMUST00000065778 4711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Dsc3-201ENSMUST00000115848 5333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Prom1-201ENSMUST00000030973 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Pira2-202ENSMUST00000119469 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Gm29824-201ENSMUST00000213183 3285 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Bmi1-202ENSMUST00000051929 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 4922502D21Rik-201ENSMUST00000051283 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Galnt5-201ENSMUST00000112616 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 E330035G20Rik-202ENSMUST00000223323 3578 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Zfp871-202ENSMUST00000159086 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Olfr1232-202ENSMUST00000213860 2413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
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PtprbB2RU80 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
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PtprbB2RU80 Phc3-204ENSMUST00000108255 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Mapk1ip1l-202ENSMUST00000166743 4542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Vma21-203ENSMUST00000114577 4652 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Med23-201ENSMUST00000020159 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Atp2b4-201ENSMUST00000048953 8292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Zfp488-201ENSMUST00000166737 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Nt5c1b-205ENSMUST00000217944 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Zkscan1-203ENSMUST00000110962 4843 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Olfr678-202ENSMUST00000213622 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Myh10-202ENSMUST00000092984 7759 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Fam60a-211ENSMUST00000204435 2785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
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PtprbB2RU80 Pogz-205ENSMUST00000107270 6399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Gm11256-201ENSMUST00000118109 829 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Gm9005-201ENSMUST00000119908 607 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Gm12438-201ENSMUST00000122034 336 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Gm12531-201ENSMUST00000126099 487 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 BC035044-202ENSMUST00000178918 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Gm18700-201ENSMUST00000185791 553 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 1700006H21Rik-201ENSMUST00000188490 627 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
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