Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Gm28819-206ENSMUST00000188816 615 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm29079-201ENSMUST00000188875 615 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 1700011B04Rik-201ENSMUST00000189140 651 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm28213-201ENSMUST00000189183 615 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm29382-201ENSMUST00000189549 615 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm29377-205ENSMUST00000189603 615 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm28327-201ENSMUST00000189638 615 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm28790-201ENSMUST00000189642 615 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm28907-201ENSMUST00000189700 615 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm29586-207ENSMUST00000189745 615 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm29115-201ENSMUST00000189870 615 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm28366-201ENSMUST00000190147 615 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm29212-201ENSMUST00000190384 615 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm29533-201ENSMUST00000190403 615 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm28162-201ENSMUST00000190545 615 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm29030-201ENSMUST00000190848 615 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm28564-201ENSMUST00000190864 240 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm28742-201ENSMUST00000191001 615 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm28899-201ENSMUST00000191161 615 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm29567-201ENSMUST00000191188 615 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm28222-201ENSMUST00000191210 615 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm28776-201ENSMUST00000191282 615 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm29306-201ENSMUST00000191366 615 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm29618-201ENSMUST00000191423 615 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm28136-210ENSMUST00000191432 615 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm29251-201ENSMUST00000191480 615 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm28658-201ENSMUST00000191532 615 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm32180-201ENSMUST00000192415 615 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm30598-201ENSMUST00000192620 615 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Trbv9-201ENSMUST00000194494 290 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm37627-201ENSMUST00000194585 615 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm34274-201ENSMUST00000195825 615 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm34333-201ENSMUST00000200363 669 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm42883-201ENSMUST00000202594 222 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm44111-201ENSMUST00000204649 399 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm9357-201ENSMUST00000207138 805 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm4585-201ENSMUST00000207218 452 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm8168-201ENSMUST00000209631 948 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 1700011B04Rik-205ENSMUST00000220995 831 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 1700011B04Rik-207ENSMUST00000221256 800 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 1700011B04Rik-208ENSMUST00000221261 628 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 CT009742.1-201ENSMUST00000222507 702 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 1700011B04Rik-210ENSMUST00000222668 821 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm19154-201ENSMUST00000223330 940 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 AC131033.1-201ENSMUST00000228223 279 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 AC154806.5-204ENSMUST00000228900 867 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Fsip1-201ENSMUST00000028820 1025 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Mir296-201ENSMUST00000083587 79 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Olfr688-201ENSMUST00000098155 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Olfr1278-203ENSMUST00000213727 6744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm9871-203ENSMUST00000204837 1560 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Ttf1-201ENSMUST00000100237 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Helz-203ENSMUST00000106746 13147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Prelp-201ENSMUST00000048432 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm45073-201ENSMUST00000207688 4247 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Pdzd9-202ENSMUST00000127845 1327 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Olfr745-202ENSMUST00000213127 1930 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm10855-201ENSMUST00000100426 2541 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm42994-201ENSMUST00000195964 2549 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Prep-201ENSMUST00000099858 10933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Zim1-201ENSMUST00000002336 7693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Fbxw28-202ENSMUST00000112040 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Usp17lc-201ENSMUST00000079348 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Ccdc83-203ENSMUST00000107221 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 4931423N10Rik-202ENSMUST00000114505 1392 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Mef2c-214ENSMUST00000197722 3517 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Olfr472-203ENSMUST00000216937 5392 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Myh8-202ENSMUST00000108685 2306 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm43497-201ENSMUST00000201137 2316 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Cd200r4-202ENSMUST00000176321 2005 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm5524-201ENSMUST00000185409 2002 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Slc7a11-201ENSMUST00000029297 9223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Vamp4-207ENSMUST00000155003 1428 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Top2a-201ENSMUST00000068031 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm27179-201ENSMUST00000184652 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Nfib-201ENSMUST00000050872 8770 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Cnga1-202ENSMUST00000126799 2061 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 AC153132.1-201ENSMUST00000222625 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Pde1c-207ENSMUST00000168944 2126 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm28600-202ENSMUST00000189502 1495 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Rnase4-201ENSMUST00000022428 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Foxp1-206ENSMUST00000113326 7029 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Dock7-205ENSMUST00000127417 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm29123-201ENSMUST00000185808 3657 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 AC126549.1-201ENSMUST00000225044 3687 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Aox1-201ENSMUST00000001027 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm44130-201ENSMUST00000205157 3004 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Olfr62-203ENSMUST00000217013 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Brox-202ENSMUST00000163528 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Lats1-203ENSMUST00000217931 4186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Lats1-201ENSMUST00000040043 4155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm14864-201ENSMUST00000116164 1087 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm15310-201ENSMUST00000117891 372 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm13006-201ENSMUST00000118683 214 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm14631-201ENSMUST00000119067 594 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm6987-201ENSMUST00000119319 428 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm15872-201ENSMUST00000162454 1108 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Obox3-ps3-201ENSMUST00000177242 1004 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 4930568A12Rik-202ENSMUST00000188292 926 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm28801-201ENSMUST00000188761 449 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
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