Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Gm20932-201ENSMUST00000189115 694 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm21721-202ENSMUST00000189253 1225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm29614-201ENSMUST00000189263 694 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm28751-201ENSMUST00000189287 696 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm29559-201ENSMUST00000189412 696 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm28272-201ENSMUST00000189512 696 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm28483-201ENSMUST00000189519 696 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Krtdap-205ENSMUST00000189673 345 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm28123-201ENSMUST00000189725 696 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm28368-201ENSMUST00000189804 696 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Krtdap-206ENSMUST00000189962 323 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm29119-201ENSMUST00000189973 696 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm21920-201ENSMUST00000190042 695 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm28171-201ENSMUST00000190100 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm28716-201ENSMUST00000190217 696 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm29239-201ENSMUST00000190304 696 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm28837-201ENSMUST00000190397 696 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm28968-201ENSMUST00000190413 696 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm28531-201ENSMUST00000190529 696 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm28165-201ENSMUST00000190669 694 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm20867-202ENSMUST00000190987 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Krtdap-209ENSMUST00000190990 403 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm29181-201ENSMUST00000191288 696 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 1700108F19Rik-208ENSMUST00000191447 660 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm38229-201ENSMUST00000191931 696 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm37679-201ENSMUST00000192868 1192 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm32347-201ENSMUST00000192944 696 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm38121-201ENSMUST00000193213 696 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm38035-201ENSMUST00000194427 696 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm38350-201ENSMUST00000194789 696 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm37990-201ENSMUST00000195821 696 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm5711-201ENSMUST00000197896 421 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm43141-201ENSMUST00000199695 274 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Fabp7-201ENSMUST00000020024 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm44112-201ENSMUST00000204787 372 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm44213-201ENSMUST00000204977 703 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm45181-201ENSMUST00000207878 449 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm20751-201ENSMUST00000210260 1270 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm46203-201ENSMUST00000218130 478 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Olfr923-204ENSMUST00000219798 1068 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 AC125064.1-201ENSMUST00000225801 295 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 AC124395.1-201ENSMUST00000225940 707 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 AC156016.2-201ENSMUST00000228200 525 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Fsip1-201ENSMUST00000028820 1025 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Olfr923-201ENSMUST00000051238 1068 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm2531-201ENSMUST00000075609 512 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Olfr1132-201ENSMUST00000090711 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm5446-201ENSMUST00000091762 784 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Krtdap-201ENSMUST00000098559 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 9230020A06Rik-201ENSMUST00000151841 2051 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm20768-201ENSMUST00000199527 2338 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm43029-201ENSMUST00000201829 1535 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Satb1-214ENSMUST00000176669 4407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Olfr716-205ENSMUST00000214819 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm3555-201ENSMUST00000160287 1395 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm45949-201ENSMUST00000221550 1895 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Slc7a11-201ENSMUST00000029297 9223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm26659-201ENSMUST00000181816 3655 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Smurf2-206ENSMUST00000167787 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Rapgef5-201ENSMUST00000109691 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Ccdc175-201ENSMUST00000021494 2622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm18451-201ENSMUST00000196759 1719 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Srgap1-201ENSMUST00000020322 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Zfp263-207ENSMUST00000162207 2452 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Vmn1r176-204ENSMUST00000227129 2955 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Vmn1r176-207ENSMUST00000228793 2959 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Tsix-201ENSMUST00000152916 4306 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm43873-201ENSMUST00000204505 3938 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm43421-201ENSMUST00000200044 2905 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Ptprd-219ENSMUST00000174531 4509 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Unc13b-216ENSMUST00000207708 6574 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Olfr3-202ENSMUST00000213988 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Atm-201ENSMUST00000118282 10006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm24048-201ENSMUST00000102411 106 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm11864-201ENSMUST00000116179 1220 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm14550-201ENSMUST00000117918 407 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Amy2-ps1-201ENSMUST00000122117 1117 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm14613-201ENSMUST00000122239 752 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm22533-201ENSMUST00000158821 274 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm24176-201ENSMUST00000158928 121 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm44-201ENSMUST00000172155 993 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm35323-201ENSMUST00000191836 499 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 1700054O19Rik-201ENSMUST00000193604 868 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 S100a6-203ENSMUST00000198128 464 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Ndufa4-204ENSMUST00000204714 452 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm9652-201ENSMUST00000209345 163 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 AC139568.1-201ENSMUST00000222878 486 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 AC132833.4-201ENSMUST00000228313 203 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Ccr1l1-201ENSMUST00000071404 1166 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Olfr342-201ENSMUST00000074192 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm14851-201ENSMUST00000077452 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm43189-201ENSMUST00000196040 3069 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm26981-201ENSMUST00000182453 3169 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Cntnap3-201ENSMUST00000091554 6344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Csnk1g1-201ENSMUST00000034949 7208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm15813-201ENSMUST00000142286 2541 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Tmcc3-203ENSMUST00000117929 3317 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm5157-201ENSMUST00000185914 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 CT030185.1-201ENSMUST00000222940 2289 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms