Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 A330032B11Rik-201ENSMUST00000180609 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Zfp935-204ENSMUST00000223247 1949 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Peg10-203ENSMUST00000176551 6567 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Itih3-201ENSMUST00000006697 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Snhg17-209ENSMUST00000186993 3144 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Gm44883-201ENSMUST00000206063 3258 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Usp29-201ENSMUST00000054055 2610 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Zfp638-202ENSMUST00000113835 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Slc6a3-201ENSMUST00000022100 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Olfr770-203ENSMUST00000204250 1644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Tnfrsf19-201ENSMUST00000111234 4051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Gtf3c2-210ENSMUST00000202639 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 CT025619.3-201ENSMUST00000216299 3267 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 A530076I17Rik-202ENSMUST00000228352 1524 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Gm37730-201ENSMUST00000192432 2211 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Pkd1l2-202ENSMUST00000109093 7389 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Pogz-201ENSMUST00000042402 4775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Ctnnd1-206ENSMUST00000111675 5089 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Mir466f-4-201ENSMUST00000116930 121 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 1700047F07Rik-202ENSMUST00000143064 463 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Gm23669-201ENSMUST00000157470 128 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Mlip-214ENSMUST00000185039 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Gm45335-201ENSMUST00000210618 401 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 4933404K13Rik-201ENSMUST00000214651 937 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Cryab-203ENSMUST00000214962 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Gm19189-201ENSMUST00000221689 754 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Gm19786-201ENSMUST00000222589 580 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 AC113198.1-201ENSMUST00000226353 832 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Ambra1-201ENSMUST00000045699 4690 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Olfr651-201ENSMUST00000098176 1069 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Gm26744-201ENSMUST00000181834 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Olfr957-202ENSMUST00000216177 1726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Luzp2-201ENSMUST00000082373 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Lifr-207ENSMUST00000227727 2489 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Olfr701-201ENSMUST00000075414 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Gm37139-201ENSMUST00000192134 4419 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Prdm10-201ENSMUST00000074510 3408 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Ddb1-201ENSMUST00000025649 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Cd59a-203ENSMUST00000168176 1806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 AC138284.1-201ENSMUST00000214258 3236 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Gm30329-201ENSMUST00000211572 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 AC153501.1-201ENSMUST00000218156 1860 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Tti1-202ENSMUST00000109522 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Gm16536-201ENSMUST00000162209 1589 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Rfpl4-202ENSMUST00000179971 1445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Gm42609-201ENSMUST00000196362 3306 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Gm25537-201ENSMUST00000103851 109 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Gm25345-201ENSMUST00000104505 133 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Gm21103-201ENSMUST00000112737 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Gm6181-201ENSMUST00000117187 264 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Gm14380-201ENSMUST00000122298 431 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 1700025D23Rik-201ENSMUST00000129365 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Gm3047-201ENSMUST00000164069 822 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Gm3029-201ENSMUST00000168306 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Vmn2r-ps12-201ENSMUST00000175833 623 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Gm28061-201ENSMUST00000189085 807 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Gm18849-201ENSMUST00000189861 560 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Gm6631-201ENSMUST00000193699 559 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Gm43055-201ENSMUST00000198859 879 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Gm44330-201ENSMUST00000200106 143 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Gm18007-201ENSMUST00000205019 844 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Gm45127-201ENSMUST00000205984 1015 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 1190001M18Rik-201ENSMUST00000215937 1270 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Gm6477-201ENSMUST00000217098 764 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Vmn1r41-202ENSMUST00000226337 888 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Vmn1r41-203ENSMUST00000226562 1046 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Large1-201ENSMUST00000004497 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Gm37786-201ENSMUST00000191714 3225 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Wdr37-201ENSMUST00000021572 4526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Gm43533-201ENSMUST00000202933 2936 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Nol8-209ENSMUST00000223467 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Obox7-201ENSMUST00000069740 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Nasp-201ENSMUST00000030456 2520 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 C530043A13Rik-202ENSMUST00000188155 1512 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Tacc2-203ENSMUST00000084513 9029 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Zscan21-204ENSMUST00000110960 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Vmn2r-ps159-203ENSMUST00000189559 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Gm21761-202ENSMUST00000187530 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Gm37915-201ENSMUST00000195134 3261 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Stat4-201ENSMUST00000027277 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Zfp266-201ENSMUST00000068296 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Hcfc1-202ENSMUST00000114372 8262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Fignl1-202ENSMUST00000109664 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 4930590J08Rik-203ENSMUST00000205686 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Olfr1388-202ENSMUST00000215226 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Mpdz-201ENSMUST00000102830 7512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Ighv2-7-201ENSMUST00000103456 355 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Gm15017-201ENSMUST00000141989 632 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 A630023P12Rik-204ENSMUST00000142879 524 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Rpl9-ps9-201ENSMUST00000173020 573 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Mir3095-201ENSMUST00000175552 87 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Gm28083-201ENSMUST00000186533 538 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Gm37784-201ENSMUST00000193233 189 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Gm5853-201ENSMUST00000197183 632 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 AC132474.2-201ENSMUST00000217414 573 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.4 ms