Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 D830032E09Rik-201ENSMUST00000186875 2193 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Sox5-201ENSMUST00000038815 7243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 9130023H24Rik-201ENSMUST00000078816 3574 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 AC159264.1-201ENSMUST00000224844 4257 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Hipk2-205ENSMUST00000160962 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm43062-201ENSMUST00000196302 1319 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm38300-201ENSMUST00000194245 1870 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Zc3h11a-201ENSMUST00000027736 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Stra6l-203ENSMUST00000107783 3669 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm1527-201ENSMUST00000099170 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm9866-206ENSMUST00000222838 1580 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm2065-201ENSMUST00000194697 2757 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Tcf7l2-210ENSMUST00000111657 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Primpol-206ENSMUST00000209787 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Cyhr1-202ENSMUST00000081291 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Igkv12-46-201ENSMUST00000103365 377 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm12365-201ENSMUST00000117931 568 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm13526-201ENSMUST00000117970 189 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm13552-201ENSMUST00000118837 417 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm13690-201ENSMUST00000118989 285 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm13921-201ENSMUST00000119411 463 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm11955-201ENSMUST00000119801 470 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Dmrtc1a-203ENSMUST00000120808 1061 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm13586-201ENSMUST00000121784 464 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm23111-201ENSMUST00000122652 105 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 4930555O08Rik-201ENSMUST00000122821 668 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm371-201ENSMUST00000142240 1245 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Rpl29-203ENSMUST00000150576 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm26182-201ENSMUST00000157688 116 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm25437-201ENSMUST00000158282 132 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Atxn3-204ENSMUST00000160251 998 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm4781-201ENSMUST00000167995 781 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Svs5-201ENSMUST00000017148 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Hist2h2bb-201ENSMUST00000177113 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm20797-201ENSMUST00000177894 383 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm6176-201ENSMUST00000178209 906 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm4567-201ENSMUST00000178591 906 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm10668-201ENSMUST00000179491 906 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Oosp1-203ENSMUST00000186557 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm28285-204ENSMUST00000187793 601 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 2010016I18Rik-203ENSMUST00000189683 841 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm4545-201ENSMUST00000190797 603 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm5541-201ENSMUST00000193248 1113 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm7897-201ENSMUST00000193981 554 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm42502-201ENSMUST00000198550 1089 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm43431-201ENSMUST00000198577 340 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm43840-201ENSMUST00000199444 484 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm42976-201ENSMUST00000200313 222 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm43108-201ENSMUST00000200525 293 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 4930478M09Rik-201ENSMUST00000201366 1113 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm42573-201ENSMUST00000202327 478 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm44380-201ENSMUST00000203125 293 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm38825-201ENSMUST00000204022 648 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 A530053G22Rik-203ENSMUST00000204370 612 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm44448-201ENSMUST00000205104 393 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm7239-201ENSMUST00000220981 860 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Mplkip-202ENSMUST00000221480 582 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 AC166358.6-201ENSMUST00000221834 1206 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 AC157571.1-201ENSMUST00000222014 520 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm18955-201ENSMUST00000223173 649 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 AC107453.2-201ENSMUST00000227714 655 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Rps6-ps1-201ENSMUST00000074205 750 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm37151-201ENSMUST00000194631 5007 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Cast-202ENSMUST00000220738 1653 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Dph6-202ENSMUST00000055144 2476 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Slc12a1-202ENSMUST00000110494 4740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 AC158686.1-201ENSMUST00000218068 2332 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm29571-201ENSMUST00000191547 1909 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Ddb1-201ENSMUST00000025649 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Exoc1-202ENSMUST00000087133 3371 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Dtna-202ENSMUST00000115832 6295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 1700012E03Rik-201ENSMUST00000186237 1377 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 AC166159.1-201ENSMUST00000227154 1380 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Nt5c2-201ENSMUST00000086961 3745 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 B3gnt5-207ENSMUST00000164397 4872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 7420700N18Rik-201ENSMUST00000209524 1644 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Yme1l1-201ENSMUST00000028117 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Dmd-202ENSMUST00000113992 1858 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Pclo-201ENSMUST00000030691 20084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Clca3a2-201ENSMUST00000029929 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Tnik-214ENSMUST00000162485 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Marf1-201ENSMUST00000090300 7765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Klhl13-202ENSMUST00000115313 3251 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm31408-201ENSMUST00000216695 1455 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm20560-201ENSMUST00000204577 3513 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Plp1-201ENSMUST00000033800 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Ndrg3-201ENSMUST00000069600 2612 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm26744-201ENSMUST00000181834 1731 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Olfr78-202ENSMUST00000168007 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Slc12a1-203ENSMUST00000110495 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Pecam1-201ENSMUST00000068021 2977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm14226-201ENSMUST00000130870 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Tcf12-221ENSMUST00000185117 3986 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 AC166574.1-201ENSMUST00000226916 1309 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm18491-201ENSMUST00000192492 1594 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm45512-201ENSMUST00000210432 1553 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Mlh3-201ENSMUST00000019378 5463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm14661-201ENSMUST00000152669 2051 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm43769-201ENSMUST00000201871 4323 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Arfgef1-203ENSMUST00000131556 3424 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.9 ms