Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Rfpl4-203ENSMUST00000208468 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Dynlrb2-202ENSMUST00000213007 527 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm4042-201ENSMUST00000216946 637 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm35188-201ENSMUST00000218869 535 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 AC161374.1-201ENSMUST00000224191 794 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm2840-201ENSMUST00000048361 411 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Vmn1r53-201ENSMUST00000076086 1122 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Olfr376-201ENSMUST00000078952 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Mir106b-201ENSMUST00000083580 82 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Olfr517-201ENSMUST00000084753 1055 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Scml2-205ENSMUST00000101113 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Pus3-202ENSMUST00000121246 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm43961-201ENSMUST00000203289 1872 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Eif4e-201ENSMUST00000029803 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Mapre2-202ENSMUST00000115830 2496 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm45250-201ENSMUST00000209414 3592 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm28600-202ENSMUST00000189502 1495 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Slc6a14-201ENSMUST00000033414 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Saa4-201ENSMUST00000006952 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Psd4-202ENSMUST00000102942 11265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 1700024B05Rik-201ENSMUST00000064162 1576 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm28431-201ENSMUST00000185592 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm28681-201ENSMUST00000187387 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 D030034A15Rik-201ENSMUST00000215835 3953 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Akr1c20-202ENSMUST00000080361 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Spta1-201ENSMUST00000027817 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Mep1b-201ENSMUST00000082235 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Spire1-201ENSMUST00000045105 5033 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Sema6a-202ENSMUST00000076043 4123 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Med12-203ENSMUST00000117203 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Pik3r3-201ENSMUST00000030464 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Serpinb9-201ENSMUST00000006391 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Slamf1-201ENSMUST00000015460 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 4930432O09Rik-201ENSMUST00000219710 1986 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm10840-201ENSMUST00000100326 309 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm8812-201ENSMUST00000118496 412 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm11343-201ENSMUST00000120579 599 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Rps19-ps14-201ENSMUST00000121832 269 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm4886-201ENSMUST00000121874 1176 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm14251-201ENSMUST00000122133 279 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm22275-201ENSMUST00000122470 310 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm3326-201ENSMUST00000164656 1043 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm4613-201ENSMUST00000165488 276 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm2888-202ENSMUST00000178577 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm21761-201ENSMUST00000179502 516 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm23945-201ENSMUST00000179609 92 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm28739-201ENSMUST00000185415 696 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm28219-201ENSMUST00000185452 696 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm28542-201ENSMUST00000185545 696 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm28303-201ENSMUST00000185642 747 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm29244-201ENSMUST00000185825 696 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm28958-201ENSMUST00000185864 703 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm29437-201ENSMUST00000185865 696 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm29412-201ENSMUST00000185869 696 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm28910-201ENSMUST00000185921 696 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm28812-201ENSMUST00000185963 696 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm29468-201ENSMUST00000185978 696 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm28335-201ENSMUST00000186204 696 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm28854-201ENSMUST00000186218 696 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm28636-201ENSMUST00000186353 696 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm28452-201ENSMUST00000186623 696 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm29298-201ENSMUST00000186704 696 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm28185-201ENSMUST00000186815 694 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm28227-201ENSMUST00000186862 696 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm28796-201ENSMUST00000186905 696 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm29659-201ENSMUST00000187063 696 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm28473-201ENSMUST00000187325 696 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm28558-201ENSMUST00000187373 696 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm28682-201ENSMUST00000187430 696 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm28738-201ENSMUST00000187480 696 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm28949-201ENSMUST00000187805 696 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm28773-201ENSMUST00000187925 696 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm29319-201ENSMUST00000188060 696 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm29422-201ENSMUST00000188062 694 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm28734-201ENSMUST00000188104 696 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm28787-201ENSMUST00000188357 696 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm29312-201ENSMUST00000188724 696 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm29451-201ENSMUST00000188862 696 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm29637-201ENSMUST00000188877 696 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm29033-201ENSMUST00000189114 696 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm29614-201ENSMUST00000189263 694 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm28751-201ENSMUST00000189287 696 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm29559-201ENSMUST00000189412 696 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm28272-201ENSMUST00000189512 696 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm28483-201ENSMUST00000189519 696 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm28123-201ENSMUST00000189725 696 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm28368-201ENSMUST00000189804 696 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm29119-201ENSMUST00000189973 696 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm28716-201ENSMUST00000190217 696 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm29239-201ENSMUST00000190304 696 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm28837-201ENSMUST00000190397 696 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm28968-201ENSMUST00000190413 696 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm28531-201ENSMUST00000190529 696 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm28165-201ENSMUST00000190669 694 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm29181-201ENSMUST00000191288 696 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm28425-202ENSMUST00000191542 621 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm38229-201ENSMUST00000191931 696 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm32347-201ENSMUST00000192944 696 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm38121-201ENSMUST00000193213 696 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms