Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Adamts12-201ENSMUST00000061318 8579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Gm6493-201ENSMUST00000159889 1786 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Plce1-203ENSMUST00000182267 7234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Gm44101-201ENSMUST00000203951 2221 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 CT009696.4-202ENSMUST00000213560 2248 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 AC135119.1-202ENSMUST00000228435 2203 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Mtrr-201ENSMUST00000045827 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Pcsk9Q80W65 Olfr1278-205ENSMUST00000215210 6901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Gm36981-201ENSMUST00000192340 4485 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Usp14-202ENSMUST00000116669 2019 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Amy2b-201ENSMUST00000120184 1577 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Gpr119-201ENSMUST00000053970 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 AC117608.1-201ENSMUST00000225500 3418 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Prkg2-204ENSMUST00000162147 1389 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Tmem236-201ENSMUST00000077517 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Pcsk9Q80W65 Gm14893-201ENSMUST00000117904 282 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Rpl22-ps1-201ENSMUST00000118652 386 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
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Pcsk9Q80W65 Gm12175-201ENSMUST00000122081 345 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Gm13237-201ENSMUST00000122151 635 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Gm23740-201ENSMUST00000157385 100 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
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Pcsk9Q80W65 Gm26851-201ENSMUST00000181867 918 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Gm29470-201ENSMUST00000188007 696 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
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Pcsk9Q80W65 Gm43063-201ENSMUST00000198198 1081 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
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Pcsk9Q80W65 Gm44982-201ENSMUST00000208795 471 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 AC069561.1-201ENSMUST00000213750 424 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Gm33489-201ENSMUST00000223171 673 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 AC154834.1-201ENSMUST00000224697 358 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
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Pcsk9Q80W65 n-R5s95-201ENSMUST00000082684 118 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Mir135a-1-201ENSMUST00000083473 90 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Gm18508-201ENSMUST00000215790 1642 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Olfr293-203ENSMUST00000215280 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Pcsk9Q80W65 Wdr63-201ENSMUST00000160285 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Slco1a6-201ENSMUST00000111827 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Etl4-209ENSMUST00000114627 7413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Pcsk9Q80W65 Hsd3b2-202ENSMUST00000107022 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Pcsk9Q80W65 Kat6a-201ENSMUST00000044331 9113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Oxgr1-201ENSMUST00000058213 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Pcsk9Q80W65 Crtam-202ENSMUST00000180384 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Pcsk9Q80W65 Ptbp2-207ENSMUST00000197464 1742 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Pcsk9Q80W65 Fcrl5-204ENSMUST00000193229 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Dnase1l1-202ENSMUST00000075821 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Iglc2-201ENSMUST00000103749 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Pcsk9Q80W65 Gm16006-201ENSMUST00000160938 566 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Pcsk9Q80W65 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Pcsk9Q80W65 Gm20234-201ENSMUST00000214134 717 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Pcsk9Q80W65 AC154640.1-202ENSMUST00000227828 496 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Frg1-201ENSMUST00000033999 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 4930591A17Rik-201ENSMUST00000041998 737 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Olfr644-201ENSMUST00000077417 1071 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Cox11-202ENSMUST00000099960 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Vmn1r181-208ENSMUST00000228842 4491 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Olfr1440-202ENSMUST00000213657 7588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 AC162181.1-201ENSMUST00000221643 3728 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Slc22a8-201ENSMUST00000010251 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Ate1-208ENSMUST00000216011 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Tm9sf4-201ENSMUST00000089027 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Ampd1-201ENSMUST00000090715 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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