Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Teddm1b-201ENSMUST00000055314 2527 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 A730036I17Rik-201ENSMUST00000143346 3431 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Pecam1-203ENSMUST00000103069 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Pkib-202ENSMUST00000075992 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Zkscan7-201ENSMUST00000063980 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Defb28-201ENSMUST00000121912 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 4930480G23Rik-201ENSMUST00000125909 1013 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Smim26-201ENSMUST00000136628 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm19840-201ENSMUST00000169624 882 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Scgb2b19-201ENSMUST00000179688 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm29289-201ENSMUST00000188358 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm29587-201ENSMUST00000189898 332 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm35013-201ENSMUST00000197218 832 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm7554-201ENSMUST00000202282 574 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 4930513N20Rik-201ENSMUST00000207466 1265 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 AC134860.6-201ENSMUST00000226038 285 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Rpl37a-201ENSMUST00000059980 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Olfr1079-201ENSMUST00000099882 948 ntAPPRIS P2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 4930511E03Rik-201ENSMUST00000203778 2232 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm37120-201ENSMUST00000193350 5959 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Pcyt1a-203ENSMUST00000115137 4244 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Rfx4-203ENSMUST00000095388 3274 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Zbtb18-212ENSMUST00000195612 3790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Apod-203ENSMUST00000130560 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Vmn2r120-201ENSMUST00000165781 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Eci2-203ENSMUST00000110251 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm43292-201ENSMUST00000199580 2449 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm42503-201ENSMUST00000199080 3706 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Klf12-205ENSMUST00000228216 5890 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Map3k20-204ENSMUST00000135469 6663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Kel-201ENSMUST00000031899 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Grhl1-201ENSMUST00000020985 3070 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Vip-201ENSMUST00000019906 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Olfr804-202ENSMUST00000213331 5737 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm3892-202ENSMUST00000178043 3539 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm10593-201ENSMUST00000178906 3539 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm21719-201ENSMUST00000115940 693 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm15216-201ENSMUST00000118058 277 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm24228-201ENSMUST00000158829 129 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Stx5a-215ENSMUST00000176570 563 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm8883-201ENSMUST00000187594 454 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 1700006H21Rik-201ENSMUST00000188490 627 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm8419-201ENSMUST00000189886 412 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm37705-201ENSMUST00000195111 577 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm42886-201ENSMUST00000199214 466 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm18007-201ENSMUST00000205019 844 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm30694-201ENSMUST00000209278 1230 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Mrpl42-203ENSMUST00000218893 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 AC153821.2-201ENSMUST00000220253 468 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Wdfy4-202ENSMUST00000130509 10158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm10032-201ENSMUST00000071522 1887 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Ccdc80-202ENSMUST00000099498 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Olfr1320-202ENSMUST00000214273 1982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Olfr1368-202ENSMUST00000216039 1389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Impg1-202ENSMUST00000113250 2965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Olfr557-202ENSMUST00000215423 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Foxn3-201ENSMUST00000046859 7705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Katnal1-201ENSMUST00000047257 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Ccdc170-202ENSMUST00000138112 3350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Vwde-202ENSMUST00000203074 5626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Srcap-207ENSMUST00000187040 10654 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Zfp874a-201ENSMUST00000057241 2210 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Dusp18-201ENSMUST00000055931 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Rgs22-203ENSMUST00000172831 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Mir674-201ENSMUST00000102421 100 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gmfg-203ENSMUST00000108292 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Lage3-202ENSMUST00000114152 746 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm12842-201ENSMUST00000117298 476 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
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NipblQ6KCD5 Gm6446-201ENSMUST00000120604 818 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm37135-201ENSMUST00000192652 534 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm42443-201ENSMUST00000198084 1155 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm18325-201ENSMUST00000203228 835 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm2011-203ENSMUST00000203750 435 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 1700093K21Rik-201ENSMUST00000020527 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 CT025685.1-201ENSMUST00000213716 150 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 AC164881.1-201ENSMUST00000215648 664 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm9110-201ENSMUST00000219035 617 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 AC154595.2-201ENSMUST00000225067 310 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Mup4-201ENSMUST00000075973 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm44121-201ENSMUST00000205169 2006 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm36908-201ENSMUST00000218080 1662 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Apobec1-203ENSMUST00000112587 2072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Mmp10-201ENSMUST00000034488 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm37100-201ENSMUST00000193344 1353 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Serpinb8-201ENSMUST00000000514 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Ncam1-204ENSMUST00000193547 6050 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Abr-204ENSMUST00000108407 4811 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Tarm1-202ENSMUST00000203020 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Naalad2-201ENSMUST00000001826 2831 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Tmem161b-206ENSMUST00000225069 2414 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Arhgap1-203ENSMUST00000111330 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Mettl16-205ENSMUST00000141755 12584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 CT030159.2-201ENSMUST00000221233 1742 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Dcn-202ENSMUST00000163448 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Clec4n-203ENSMUST00000117130 1136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Dnajc5b-203ENSMUST00000118968 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm6977-201ENSMUST00000121568 512 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
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