Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Klra7-202ENSMUST00000049304 1075 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Olfr491-201ENSMUST00000053179 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Mir106b-201ENSMUST00000083580 82 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Gm29486-201ENSMUST00000088648 372 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Bglap2-201ENSMUST00000098956 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Gk-206ENSMUST00000142152 4229 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Zbtb18-202ENSMUST00000094276 4204 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Adgrl3-207ENSMUST00000118078 4871 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Gal3st2c-201ENSMUST00000097632 9667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Gm37364-201ENSMUST00000192533 3920 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 9930111J21Rik2-201ENSMUST00000093152 2403 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 9930111J21Rik1-201ENSMUST00000093153 2403 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Ank3-230ENSMUST00000182795 3557 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Gm37783-201ENSMUST00000192025 1856 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Meis2-206ENSMUST00000110908 3697 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Vwa3a-201ENSMUST00000033180 4575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Pdilt-201ENSMUST00000033267 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Gm12608-201ENSMUST00000122013 1715 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Gin1-201ENSMUST00000027571 2494 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Tcf4-202ENSMUST00000078486 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Ttc21b-202ENSMUST00000125446 4061 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Gm21781-201ENSMUST00000178920 4838 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Itpr2-201ENSMUST00000053273 8331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Kcnj15-202ENSMUST00000113854 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Idh3a-201ENSMUST00000167866 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 AC125409.2-201ENSMUST00000221888 2158 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Olfr449-204ENSMUST00000214687 1921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Qsox2-202ENSMUST00000091263 4011 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Lrrc63-201ENSMUST00000022574 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Ccdc170-202ENSMUST00000138112 3350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Dnase1l3-201ENSMUST00000026315 4747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Mcm10-201ENSMUST00000027980 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Igkv3-5-201ENSMUST00000103400 382 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Ighv1-26-201ENSMUST00000103510 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Gm11501-201ENSMUST00000118039 581 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Gm14301-201ENSMUST00000120181 324 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Gm14847-201ENSMUST00000121978 519 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Gm16248-201ENSMUST00000124238 243 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Gm12205-201ENSMUST00000133940 575 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Gm13389-201ENSMUST00000142774 639 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Gm13485-201ENSMUST00000146690 659 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Gm16006-201ENSMUST00000160938 566 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Vmn1r-ps28-201ENSMUST00000174767 942 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Mir5617-201ENSMUST00000176786 57 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Gm2058-201ENSMUST00000178791 560 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Gm9167-201ENSMUST00000182469 962 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 0610031O16Rik-204ENSMUST00000185122 825 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Gm28564-201ENSMUST00000190864 240 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Gm36935-201ENSMUST00000192526 292 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 1700102P08Rik-202ENSMUST00000192995 658 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Gm18692-201ENSMUST00000193047 511 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 4930568G15Rik-202ENSMUST00000195635 996 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Trdv3-201ENSMUST00000198551 309 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Gm45078-201ENSMUST00000205343 546 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Olfr587-ps1-202ENSMUST00000209201 477 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 F930017D23Rik-202ENSMUST00000213342 2141 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Gm18329-201ENSMUST00000215832 589 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Gm21089-201ENSMUST00000215843 325 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 AL713985.1-201ENSMUST00000219030 420 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 AC153821.2-201ENSMUST00000220253 468 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 CT030657.2-201ENSMUST00000220710 792 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 AC163684.1-201ENSMUST00000223766 927 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 AC160962.1-202ENSMUST00000225859 1116 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Olfr1386-201ENSMUST00000071905 1128 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Olfr1537-201ENSMUST00000073248 945 ntAPPRIS P2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Olfr1510-201ENSMUST00000079459 1014 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Olfr492-201ENSMUST00000079865 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Olfr1129-201ENSMUST00000081034 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Gm42898-201ENSMUST00000200370 3073 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Golph3l-202ENSMUST00000098861 2221 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Olfr62-202ENSMUST00000213189 2570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Trim43c-201ENSMUST00000163255 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Prkg2-204ENSMUST00000162147 1389 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Gm38325-201ENSMUST00000194507 1377 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Trdc-201ENSMUST00000196323 3865 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Zscan18-201ENSMUST00000046245 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Gm11590-201ENSMUST00000118999 1455 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Gm29398-201ENSMUST00000186355 1491 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Gm5361-201ENSMUST00000211041 1498 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Zfp397-201ENSMUST00000060762 5472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Sorbs2-220ENSMUST00000139869 4275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Ap1g1-201ENSMUST00000034171 3692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Clasp1-212ENSMUST00000189262 6918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Olfr1426-203ENSMUST00000217952 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 C330024D21Rik-202ENSMUST00000202634 2020 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Ston2-201ENSMUST00000052969 9896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Gm45163-201ENSMUST00000207606 3987 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Kcnj15-204ENSMUST00000113856 5129 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Fmo9-202ENSMUST00000148677 2462 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Mtrr-201ENSMUST00000045827 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 A630072L19Rik-201ENSMUST00000180617 3405 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 AW146154-201ENSMUST00000098509 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Vmn1r22-201ENSMUST00000227342 3057 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Vmn1r22-204ENSMUST00000228257 3079 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Mkl2-204ENSMUST00000149359 8295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Med12-201ENSMUST00000087948 6809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Gm13141-201ENSMUST00000117417 456 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Apc-ps1-201ENSMUST00000119356 470 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Gm11553-201ENSMUST00000120682 240 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Olfr1017-ps1-201ENSMUST00000121263 664 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.9 ms