Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Gm31831-201ENSMUST00000196240 684 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm45666-201ENSMUST00000211474 277 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm17950-201ENSMUST00000214617 646 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm34215-201ENSMUST00000221599 355 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 AC150661.1-201ENSMUST00000222563 495 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 AC163684.1-201ENSMUST00000223766 927 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 AC168062.1-201ENSMUST00000228048 769 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 AC131033.1-201ENSMUST00000228223 279 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Cfap126-201ENSMUST00000027959 1034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Rps27rt-201ENSMUST00000053150 374 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r73-201ENSMUST00000055070 912 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Cntn5-201ENSMUST00000074133 3297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Olfr1239-203ENSMUST00000217181 1516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Cep112it-201ENSMUST00000143781 4813 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Arhgap32-203ENSMUST00000174641 13568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Mtpap-201ENSMUST00000025077 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Deup1-202ENSMUST00000115592 2918 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Adgrl3-207ENSMUST00000118078 4871 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Zfp239-201ENSMUST00000079405 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm9573-201ENSMUST00000164502 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Mmp20-201ENSMUST00000034487 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Angptl1-202ENSMUST00000111720 1332 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Atp2b1-201ENSMUST00000020107 7130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 C030015A19Rik-201ENSMUST00000203368 2551 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 AC153729.1-201ENSMUST00000214055 2562 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Cfap54-211ENSMUST00000212902 9516 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Olfr54-202ENSMUST00000215409 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Asb4-201ENSMUST00000043294 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Nemf-201ENSMUST00000021368 4732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 BC053393-201ENSMUST00000050937 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Olfr1513-202ENSMUST00000215147 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm28965-201ENSMUST00000186015 1500 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Mir678-201ENSMUST00000102114 84 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm23437-201ENSMUST00000104036 127 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm14391-202ENSMUST00000109055 965 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Amelx-202ENSMUST00000112118 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Fam107b-204ENSMUST00000115054 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm15105-201ENSMUST00000117777 204 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Prkd3-203ENSMUST00000118991 1265 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm14728-201ENSMUST00000122196 492 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 BC064078-201ENSMUST00000122939 570 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm12720-201ENSMUST00000123834 472 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm13179-202ENSMUST00000151994 978 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm14419-203ENSMUST00000156844 752 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm16006-201ENSMUST00000160938 566 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Obox3-204ENSMUST00000173912 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm5039-201ENSMUST00000177747 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm23018-201ENSMUST00000177928 109 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm8332-201ENSMUST00000179468 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm2035-201ENSMUST00000180053 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm8245-201ENSMUST00000182434 987 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Mir8120-201ENSMUST00000185035 139 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm37152-201ENSMUST00000193369 1175 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm37294-201ENSMUST00000193461 494 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Trbv9-201ENSMUST00000194494 290 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm43160-201ENSMUST00000196453 421 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm34144-201ENSMUST00000197039 259 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm44861-201ENSMUST00000208325 1220 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm45100-201ENSMUST00000209153 391 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Olfr738-202ENSMUST00000214320 2114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm21936-201ENSMUST00000221442 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm46424-201ENSMUST00000221567 168 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 CT009711.2-202ENSMUST00000224538 973 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm21762-202ENSMUST00000225881 830 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Olfr424-201ENSMUST00000053941 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm6887-201ENSMUST00000080945 482 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Olfr1085-201ENSMUST00000099879 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 AC122024.1-201ENSMUST00000219276 4850 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Pole2-202ENSMUST00000221411 1641 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Nlrp1a-202ENSMUST00000108518 3767 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Kif9-203ENSMUST00000197248 3184 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Lhfpl3-201ENSMUST00000196406 2589 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Itch-202ENSMUST00000109685 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 4930402F06Rik-202ENSMUST00000113010 1372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Rsrc2-201ENSMUST00000050827 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Phf6-202ENSMUST00000101587 3639 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 St18-204ENSMUST00000131494 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm20749-201ENSMUST00000186319 3492 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Add3-203ENSMUST00000111741 4520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm43279-201ENSMUST00000202376 2512 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 AC165260.6-206ENSMUST00000223884 3698 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Elmo1-202ENSMUST00000180626 2020 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm44231-201ENSMUST00000204106 4075 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Olfr1346-203ENSMUST00000215302 4525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Vmn2r-ps133-201ENSMUST00000176979 2569 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Vmn2r84-201ENSMUST00000094502 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Slc16a4-201ENSMUST00000029502 2248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Tmem68-201ENSMUST00000029891 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Dlg1-206ENSMUST00000115205 4364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Dnah10-203ENSMUST00000141137 13862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Olfr1122-202ENSMUST00000215371 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Olfr1238-202ENSMUST00000217226 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Sh2d1b2-202ENSMUST00000162752 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 4930548H24Rik-201ENSMUST00000031020 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 4933400F21Rik-203ENSMUST00000187295 2633 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.8 ms