Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Ppfibp2-202ENSMUST00000098134 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm6710-201ENSMUST00000109011 1445 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Obox3-206ENSMUST00000174443 1979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Olfr1278-203ENSMUST00000213727 6744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Akr1c20-202ENSMUST00000080361 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Hcrtr2-201ENSMUST00000063140 3761 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm26575-201ENSMUST00000181714 2232 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm29123-201ENSMUST00000185808 3657 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Klra1-201ENSMUST00000032288 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Nlrp3-202ENSMUST00000101148 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Slc17a1-201ENSMUST00000006785 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Tmem182-201ENSMUST00000114765 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 AC132465.2-201ENSMUST00000218673 2728 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Olfr521-202ENSMUST00000219663 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Olfr521-203ENSMUST00000220001 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Slco1a4-201ENSMUST00000032364 2252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Vgll1-201ENSMUST00000033465 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm14976-201ENSMUST00000117055 1394 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm45753-201ENSMUST00000116473 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm26544-201ENSMUST00000181404 2763 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Vmn1r220-203ENSMUST00000227679 7868 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Vmn1r220-206ENSMUST00000228854 7854 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Olfr446-201ENSMUST00000101461 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Cep112-202ENSMUST00000106715 1161 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm12653-201ENSMUST00000117778 561 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm13878-201ENSMUST00000117986 577 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm14729-201ENSMUST00000118373 689 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm14251-201ENSMUST00000122133 279 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm7613-201ENSMUST00000139070 487 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm16098-201ENSMUST00000141926 796 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm15265-202ENSMUST00000143287 814 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm14022-201ENSMUST00000143857 691 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 4930451E10Rik-202ENSMUST00000152292 557 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 1700057H21Rik-201ENSMUST00000152467 383 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm4613-201ENSMUST00000165488 276 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm7867-201ENSMUST00000189856 546 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm28086-201ENSMUST00000191586 317 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm42708-201ENSMUST00000196332 905 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm9240-201ENSMUST00000206527 742 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm44788-201ENSMUST00000207605 385 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm7351-201ENSMUST00000210745 580 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm35189-201ENSMUST00000219319 789 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Fsip1-201ENSMUST00000028820 1025 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 n-R5s217-201ENSMUST00000083341 116 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm24451-201ENSMUST00000083353 133 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm16020-201ENSMUST00000084281 210 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm8444-201ENSMUST00000092020 357 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Pcdh15-208ENSMUST00000125006 4863 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Pcsk1-201ENSMUST00000022075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 AC159264.1-202ENSMUST00000224856 3162 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm43189-201ENSMUST00000196040 3069 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm42820-201ENSMUST00000200084 3063 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm14762-201ENSMUST00000105109 1771 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 AC210924.1-201ENSMUST00000221183 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 AC121504.1-201ENSMUST00000221385 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 AC139758.3-201ENSMUST00000226853 2704 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Eps15-201ENSMUST00000030281 2980 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Celf2-206ENSMUST00000114934 5470 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 A830082K12Rik-207ENSMUST00000183171 4176 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Atp13a5-201ENSMUST00000075806 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Psd3-204ENSMUST00000093469 4351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Kcne4-202ENSMUST00000187432 1813 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Lrtm1-201ENSMUST00000055662 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm42630-201ENSMUST00000195908 3448 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Psd4-210ENSMUST00000166388 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm42653-201ENSMUST00000200644 2839 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Galnt15-202ENSMUST00000164208 3563 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Mak-206ENSMUST00000225084 3573 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm10466-201ENSMUST00000101450 2466 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm42668-201ENSMUST00000200747 2487 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Abca6-201ENSMUST00000044003 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Daw1-203ENSMUST00000113436 1351 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Ank3-240ENSMUST00000183169 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 AC120347.1-201ENSMUST00000223326 1639 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 5430427O19Rik-201ENSMUST00000113976 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm37530-201ENSMUST00000191759 4932 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Skiv2l2-201ENSMUST00000022281 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Olfr972-203ENSMUST00000216167 1522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Igkv4-50-201ENSMUST00000103363 352 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Rps12-ps5-201ENSMUST00000118272 389 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm8312-201ENSMUST00000119380 618 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm14603-201ENSMUST00000121275 448 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm12778-201ENSMUST00000122341 333 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm15859-201ENSMUST00000132069 710 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm25660-201ENSMUST00000158470 104 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm8185-201ENSMUST00000160999 669 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Klrc3-202ENSMUST00000170148 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm20461-201ENSMUST00000174600 305 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm24812-201ENSMUST00000175315 284 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Ly6a-204ENSMUST00000187994 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm38022-201ENSMUST00000191762 403 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 2310046K23Rik-201ENSMUST00000193521 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm35801-201ENSMUST00000193927 479 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm7019-201ENSMUST00000194122 369 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm17822-201ENSMUST00000204307 351 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm44896-201ENSMUST00000206190 772 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Smarca2-231ENSMUST00000208091 1140 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Agr2-201ENSMUST00000020898 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 AC159267.1-201ENSMUST00000226702 678 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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