Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Scgb2b13-ps-201ENSMUST00000190420 328 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Gm36928-201ENSMUST00000192466 694 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Gm37325-201ENSMUST00000194971 694 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Gm33370-201ENSMUST00000195935 489 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Gm43664-201ENSMUST00000196038 734 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Gm4872-201ENSMUST00000205210 1299 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Gm29759-201ENSMUST00000205860 327 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Gm30790-202ENSMUST00000208527 809 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Gm39158-201ENSMUST00000210178 856 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Gm45666-201ENSMUST00000211474 277 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 AC122428.4-201ENSMUST00000213494 589 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Gm19217-201ENSMUST00000218238 328 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 4930563J15Rik-202ENSMUST00000219752 560 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 CT009718.2-202ENSMUST00000222092 704 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 AC122251.2-201ENSMUST00000227341 603 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Gm9800-201ENSMUST00000052615 336 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Olfr424-201ENSMUST00000053941 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Gm13769-201ENSMUST00000077123 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Olfr1360-201ENSMUST00000079135 980 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Serpina1e-201ENSMUST00000085054 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 1700024B05Rik-201ENSMUST00000064162 1576 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Gm38178-201ENSMUST00000194502 2471 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Gm29123-201ENSMUST00000185808 3657 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Olfr1412-202ENSMUST00000190505 3663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Gm45163-201ENSMUST00000207606 3987 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Alpk2-201ENSMUST00000035548 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Olfr318-203ENSMUST00000214728 4552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Stat1-201ENSMUST00000070968 5151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 4930553P18Rik-201ENSMUST00000201164 1659 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r81-202ENSMUST00000227080 13256 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Nlrp5-201ENSMUST00000015866 3508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Gm5175-201ENSMUST00000218458 1703 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Olfr99-202ENSMUST00000216328 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Gm42705-201ENSMUST00000200176 2465 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r44-210ENSMUST00000227747 1811 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 AC155234.1-201ENSMUST00000225610 2823 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Mef2c-203ENSMUST00000185052 3556 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Kat6a-202ENSMUST00000110696 9041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Sin3a-204ENSMUST00000167715 4961 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Otogl-201ENSMUST00000165341 8763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Gm42930-201ENSMUST00000200872 3260 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Trp63-208ENSMUST00000115310 5366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Zfp719-201ENSMUST00000058104 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Olfr1294-202ENSMUST00000208675 1983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 AC155941.4-201ENSMUST00000219731 2705 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Gip-202ENSMUST00000103157 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Trdv2-2-201ENSMUST00000103678 397 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Wfdc15b-202ENSMUST00000109376 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Fancl-202ENSMUST00000109509 1187 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Gm17184-201ENSMUST00000111864 462 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Gm14893-201ENSMUST00000117904 282 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Gm5319-201ENSMUST00000118965 873 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Gm8421-201ENSMUST00000119439 305 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Rpl36-ps7-201ENSMUST00000119462 315 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 0610043K17Rik-201ENSMUST00000123107 614 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 1700025D23Rik-201ENSMUST00000129365 846 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 4933431E20Rik-206ENSMUST00000138472 483 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Tmbim6-203ENSMUST00000159531 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Atxn3-205ENSMUST00000161011 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Gm3208-201ENSMUST00000168281 427 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Gm22569-201ENSMUST00000175545 124 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Wfdc15b-201ENSMUST00000018355 510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
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Rpusd3Q14AI6 Lncbate1-201ENSMUST00000211953 812 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
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Rpusd3Q14AI6 Lrrc51-201ENSMUST00000078448 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Rasgrp3-201ENSMUST00000095204 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Gm37033-201ENSMUST00000193199 7350 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Agtpbp1-202ENSMUST00000109830 2879 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Gm11346-204ENSMUST00000149751 2893 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Olfr1494-202ENSMUST00000207836 2100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r188-202ENSMUST00000226680 8374 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 C030015A19Rik-201ENSMUST00000203368 2551 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Il18r1-202ENSMUST00000108044 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Tlr5-202ENSMUST00000191820 3818 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 A130050O07Rik-201ENSMUST00000191963 3023 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Gm3752-201ENSMUST00000164366 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Gm44093-201ENSMUST00000204381 1802 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 AC022775.1-201ENSMUST00000228163 2698 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Gm18310-201ENSMUST00000206494 3912 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r201-202ENSMUST00000226330 4770 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Rpp40-201ENSMUST00000171686 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Scn9a-203ENSMUST00000112354 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Zfp788-203ENSMUST00000100275 3177 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Gm16123-201ENSMUST00000118647 1517 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Gm9030-201ENSMUST00000218405 2410 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Gm9029-201ENSMUST00000219232 2410 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r6-204ENSMUST00000227188 8185 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Atp2b4-202ENSMUST00000112264 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rpusd3Q14AI6 Gm6614-203ENSMUST00000181791 2450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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