Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Mir7212-201ENSMUST00000184098 61 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Gm28294-201ENSMUST00000191154 386 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Gm38030-201ENSMUST00000192376 475 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Gm38068-201ENSMUST00000192546 540 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Gm17895-201ENSMUST00000194028 874 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Ighv1-29-201ENSMUST00000194116 342 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Gm31925-202ENSMUST00000194266 537 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Gm42443-201ENSMUST00000198084 1155 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Gm34368-201ENSMUST00000209512 1111 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Gm19154-201ENSMUST00000223330 940 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 AC091237.1-201ENSMUST00000224911 637 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Cxcl13-201ENSMUST00000023840 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Olfr691-201ENSMUST00000057528 969 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Nsun4-202ENSMUST00000030475 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Psg29-201ENSMUST00000075934 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Cntrl-203ENSMUST00000113032 7085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Cd59a-203ENSMUST00000168176 1806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Gdi2-209ENSMUST00000223396 4303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Gm44626-201ENSMUST00000207035 2715 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Pik3c2g-215ENSMUST00000218528 2712 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Zfp317-203ENSMUST00000213725 2354 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Exoc1-201ENSMUST00000049469 3272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Gm10735-201ENSMUST00000099162 2943 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Gja10-201ENSMUST00000056517 2117 ntAPPRIS P2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Mroh4-201ENSMUST00000023271 3583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Gm26659-201ENSMUST00000181816 3655 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Kmo-202ENSMUST00000097458 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Gm4876-203ENSMUST00000139701 2225 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Ogfod1-201ENSMUST00000060632 5214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Gm44185-201ENSMUST00000204539 3307 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Olfr97-205ENSMUST00000214848 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Bbs12-201ENSMUST00000057975 2433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Gm44777-201ENSMUST00000205941 4052 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Npy2r-201ENSMUST00000029633 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Myof-211ENSMUST00000226068 6633 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Gm9226-201ENSMUST00000188352 3489 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Gm21152-201ENSMUST00000190271 3483 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Gm43789-201ENSMUST00000199275 2472 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Icos-202ENSMUST00000102827 3241 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Olfr1339-202ENSMUST00000217522 2559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Cep85l-201ENSMUST00000095691 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Ddb1-201ENSMUST00000025649 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Zwint-202ENSMUST00000105431 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Itga2-201ENSMUST00000056117 7108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Igkv5-43-201ENSMUST00000103368 379 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Gm25877-201ENSMUST00000104326 129 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 n-R5s172-201ENSMUST00000104508 114 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Ap3s1-ps1-201ENSMUST00000117113 579 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Gm13137-201ENSMUST00000118035 345 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Gm5578-201ENSMUST00000121490 1236 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Gm13746-201ENSMUST00000133981 605 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Gm23756-201ENSMUST00000157582 114 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Ap3s1-ps2-201ENSMUST00000178107 579 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 6030442E23Rik-201ENSMUST00000186618 642 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Gm7270-201ENSMUST00000195818 1128 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Gm6077-201ENSMUST00000196008 499 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Gm9504-201ENSMUST00000196322 468 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Gm34144-201ENSMUST00000197039 259 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Gm30646-201ENSMUST00000207662 180 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Gm34623-201ENSMUST00000210900 977 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Tecr-214ENSMUST00000212990 648 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 AC122273.1-202ENSMUST00000213884 695 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Gm5080-201ENSMUST00000220341 743 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 AC122327.2-201ENSMUST00000220883 120 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 AC122327.3-201ENSMUST00000221852 120 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Mylf-ps-201ENSMUST00000222174 421 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 AC166341.1-201ENSMUST00000223360 105 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 AC154573.2-201ENSMUST00000224174 378 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 CT009527.2-201ENSMUST00000225386 606 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Kcne3-201ENSMUST00000049333 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Klre1-201ENSMUST00000053708 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Rpl37a-201ENSMUST00000059980 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Itgae-201ENSMUST00000006101 3845 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Mir7b-201ENSMUST00000083557 111 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Gm5600-202ENSMUST00000211589 2331 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Zfp397-201ENSMUST00000060762 5472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Apol10a-201ENSMUST00000060551 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Tbc1d24-205ENSMUST00000168378 4350 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Asap1-215ENSMUST00000177035 3228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Cyp4a10-202ENSMUST00000094886 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Kcnip4-208ENSMUST00000176978 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 RMST_1.1-210ENSMUST00000219606 2891 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Gm31049-201ENSMUST00000201516 1302 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Dnase1l1-202ENSMUST00000075821 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Gm15930-201ENSMUST00000156603 2037 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Gm36527-201ENSMUST00000195500 3029 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxc13P50207 Pomk-201ENSMUST00000061850 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxc13P50207 Sim1-201ENSMUST00000020071 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxc13P50207 Slc5a7-201ENSMUST00000095712 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxc13P50207 Oas2-201ENSMUST00000053909 3869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxc13P50207 Alg6-201ENSMUST00000097961 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxc13P50207 Itih4-201ENSMUST00000006703 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxc13P50207 Itih4-202ENSMUST00000078490 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxc13P50207 9330199G10Rik-201ENSMUST00000221601 2072 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxc13P50207 Atp2b4-201ENSMUST00000048953 8292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxc13P50207 Usp7-207ENSMUST00000160405 4745 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxc13P50207 Foxp2-209ENSMUST00000131414 1381 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxc13P50207 Gm44843-201ENSMUST00000208320 1396 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxc13P50207 Gm20275-201ENSMUST00000215963 1387 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
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