Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Psg26-201ENSMUST00000094798 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
VdrP48281 AC160029.1-201ENSMUST00000219628 2678 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
VdrP48281 Psg22-202ENSMUST00000108481 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm1982-201ENSMUST00000188615 1887 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
VdrP48281 Psg22-203ENSMUST00000208221 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
VdrP48281 Psg22-201ENSMUST00000051973 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
VdrP48281 Zrsr1-201ENSMUST00000049506 3282 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
VdrP48281 Ston1-201ENSMUST00000064035 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
VdrP48281 Vmn1r196-202ENSMUST00000226245 5312 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
VdrP48281 Pdgfd-201ENSMUST00000058692 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
VdrP48281 Olfr813-202ENSMUST00000204622 2410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
VdrP48281 Zfp473-202ENSMUST00000118162 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
VdrP48281 Glb1l2-201ENSMUST00000040398 3701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm28497-201ENSMUST00000189646 3029 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
VdrP48281 Malat1-201ENSMUST00000172812 6983 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
VdrP48281 Ampd1-202ENSMUST00000155034 2913 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
VdrP48281 Zfp947-201ENSMUST00000080249 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
VdrP48281 Abraxas2-201ENSMUST00000084497 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm5715-201ENSMUST00000196854 1465 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
VdrP48281 AC159193.3-201ENSMUST00000221902 2622 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
VdrP48281 C87977-202ENSMUST00000105754 1407 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm37618-201ENSMUST00000192891 3075 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
VdrP48281 Mcm4-201ENSMUST00000023353 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
VdrP48281 Tmem30c-201ENSMUST00000023434 2973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm19028-201ENSMUST00000189614 1873 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
VdrP48281 1810046K07Rik-201ENSMUST00000039959 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
VdrP48281 Arhgap32-201ENSMUST00000168954 8703 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
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VdrP48281 Ighv1-59-201ENSMUST00000103530 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
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VdrP48281 Fgf2-203ENSMUST00000108120 526 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
VdrP48281 Smim8-203ENSMUST00000108132 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
VdrP48281 Rpl36a-201ENSMUST00000113211 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
VdrP48281 Epc1-203ENSMUST00000115870 3817 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm12460-201ENSMUST00000117147 357 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm13352-201ENSMUST00000117515 262 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm15110-201ENSMUST00000117545 881 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
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VdrP48281 Rpl5-ps1-201ENSMUST00000121367 894 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm14380-201ENSMUST00000122298 431 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm11844-201ENSMUST00000129207 459 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
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VdrP48281 Rubie-201ENSMUST00000151828 1137 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
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VdrP48281 Six3os1-213ENSMUST00000177487 537 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm29453-201ENSMUST00000186428 1279 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
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VdrP48281 AC172194.1-201ENSMUST00000214246 1020 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
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VdrP48281 Sult3a2-202ENSMUST00000223295 930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
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VdrP48281 Retnlb-201ENSMUST00000023328 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
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VdrP48281 Anxa10-202ENSMUST00000034054 1222 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
VdrP48281 Slc36a3-202ENSMUST00000069816 893 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm23104-201ENSMUST00000083722 104 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
VdrP48281 Olfr18-201ENSMUST00000086473 1156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
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VdrP48281 Aldh18a1-207ENSMUST00000176939 3427 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gal3st2c-201ENSMUST00000097632 9667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm14120-201ENSMUST00000129067 2869 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
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VdrP48281 Cast-207ENSMUST00000222588 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
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VdrP48281 Gm42636-201ENSMUST00000197174 2239 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
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VdrP48281 Ston2-201ENSMUST00000052969 9896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
VdrP48281 Ifit1bl2-201ENSMUST00000087357 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm43409-201ENSMUST00000195921 2162 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
VdrP48281 Klf10-202ENSMUST00000226363 2917 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
VdrP48281 D3Ertd751e-207ENSMUST00000146165 3574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm44022-201ENSMUST00000203708 5429 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm34653-201ENSMUST00000201786 1658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
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