Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Gm6300-201ENSMUST00000192393 1498 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Zfp27-206ENSMUST00000172448 2460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm44797-201ENSMUST00000208780 1837 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Slc12a8-205ENSMUST00000122314 2819 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm2108-201ENSMUST00000165058 2177 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Itih5-201ENSMUST00000026886 7900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm28112-201ENSMUST00000190898 1875 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 4921525O09Rik-201ENSMUST00000220691 3270 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Pomk-201ENSMUST00000061850 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 4930480K23Rik-201ENSMUST00000180465 3326 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm10259-201ENSMUST00000091289 1590 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Cep85-202ENSMUST00000121566 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Ints9-201ENSMUST00000043914 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Fgf10-201ENSMUST00000022246 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Ighv9-1-201ENSMUST00000103471 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Ighv9-2-201ENSMUST00000103472 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm14891-201ENSMUST00000117378 596 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm5752-201ENSMUST00000117771 594 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm15105-201ENSMUST00000117777 204 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm15040-201ENSMUST00000118561 1241 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm15484-201ENSMUST00000118871 828 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm13545-201ENSMUST00000119044 482 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm15842-201ENSMUST00000120513 618 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Halr1-201ENSMUST00000125374 391 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm2735-201ENSMUST00000136133 277 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 9630013K17Rik-201ENSMUST00000146915 1072 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm26000-201ENSMUST00000157991 107 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm5611-201ENSMUST00000164523 852 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm17149-201ENSMUST00000164712 375 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm8305-201ENSMUST00000180022 1195 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm27684-201ENSMUST00000183778 80 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm5147-201ENSMUST00000185999 794 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm8004-201ENSMUST00000187782 617 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 1700031M16Rik-205ENSMUST00000189907 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm29369-201ENSMUST00000190674 615 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm28466-201ENSMUST00000190678 659 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm38214-201ENSMUST00000192581 988 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm37993-201ENSMUST00000195301 988 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Shisa5-207ENSMUST00000197483 534 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm30735-201ENSMUST00000199488 726 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm42926-201ENSMUST00000200496 697 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Ctxn3-203ENSMUST00000209786 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm19007-201ENSMUST00000217746 874 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm2089-201ENSMUST00000218294 479 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm2398-201ENSMUST00000218347 883 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 AC160030.1-201ENSMUST00000218916 506 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 AC105167.1-201ENSMUST00000219966 253 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm21762-202ENSMUST00000225881 830 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Enkur-201ENSMUST00000027992 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Tas2r116-201ENSMUST00000032315 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Spata19-201ENSMUST00000034473 697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Olfr1387-201ENSMUST00000073824 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm2531-201ENSMUST00000075609 512 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Clec4b1-201ENSMUST00000077228 674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Klhl23-201ENSMUST00000053087 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 U2surp-201ENSMUST00000078374 3520 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Ttc9c-202ENSMUST00000096751 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 AC159476.1-201ENSMUST00000215914 1668 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Zfp934-208ENSMUST00000222429 1653 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Maml2-201ENSMUST00000034401 2098 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 5033425B01Rik-201ENSMUST00000213948 1303 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Adarb2-202ENSMUST00000123187 4002 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Klf5-202ENSMUST00000226784 2852 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Garnl3-201ENSMUST00000049618 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Cntn4-206ENSMUST00000113264 5262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Olfr399-202ENSMUST00000215915 1796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Skint7-201ENSMUST00000055014 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Erbin-202ENSMUST00000053927 6103 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Mapk10-201ENSMUST00000086854 6630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gdap1-201ENSMUST00000026879 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm19028-201ENSMUST00000189614 1873 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm7416-201ENSMUST00000117448 1487 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Prokr2-201ENSMUST00000049997 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 5530400K19Rik-201ENSMUST00000193511 1916 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Ide-201ENSMUST00000131070 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Tdrkh-205ENSMUST00000197495 2476 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Atp8b4-201ENSMUST00000040128 5693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Ptk2b-208ENSMUST00000178730 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Tm9sf4-201ENSMUST00000089027 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Amer1-201ENSMUST00000084535 8496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Fastkd1-202ENSMUST00000102706 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Hyal5-202ENSMUST00000200968 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Spam1-203ENSMUST00000202569 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Carf-206ENSMUST00000180952 2157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm19272-202ENSMUST00000185181 2217 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm25414-201ENSMUST00000101814 107 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Igkv14-126-201ENSMUST00000103310 358 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm23437-201ENSMUST00000104036 127 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Mup3-202ENSMUST00000107472 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Rhox4g-201ENSMUST00000115166 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm14904-201ENSMUST00000117067 335 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm2288-201ENSMUST00000118560 638 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm13341-201ENSMUST00000120780 672 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Zfp128-202ENSMUST00000144578 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm26487-201ENSMUST00000158022 94 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm8715-201ENSMUST00000162728 531 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm9047-201ENSMUST00000171317 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Srsx-201ENSMUST00000171714 1083 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Rhox4a2-201ENSMUST00000179915 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm27001-201ENSMUST00000182252 936 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms