Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Ccl20-202ENSMUST00000113437 794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Gm7091-201ENSMUST00000116438 586 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Gm12445-201ENSMUST00000117947 885 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Gm11225-201ENSMUST00000118903 1049 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Gm11850-201ENSMUST00000119679 479 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Gm5883-201ENSMUST00000120735 495 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Rpl9-ps2-201ENSMUST00000120821 577 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Gm12026-201ENSMUST00000120961 1024 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Zfp740-205ENSMUST00000121206 795 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 n-R5s201-201ENSMUST00000122622 116 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Fam229b-202ENSMUST00000124941 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Gm15345-201ENSMUST00000128240 663 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Gm15086-201ENSMUST00000143110 573 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Milr1-203ENSMUST00000147326 1234 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Gm22388-201ENSMUST00000158194 248 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Vmn1r-ps55-201ENSMUST00000174634 392 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Gm15100-201ENSMUST00000180357 573 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 B230110C06Rik-202ENSMUST00000181936 938 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Gm7734-201ENSMUST00000182832 1011 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Prl8a6-201ENSMUST00000018392 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Gm28199-201ENSMUST00000187127 619 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 4933417E11Rik-201ENSMUST00000188213 1093 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Rbp2-204ENSMUST00000189446 803 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Gm37493-201ENSMUST00000193167 433 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Lamtor3-203ENSMUST00000197064 733 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Gm43310-201ENSMUST00000198975 820 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Gm42948-201ENSMUST00000199085 578 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Gm42883-201ENSMUST00000202594 222 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 1700094M24Rik-201ENSMUST00000203771 665 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Gm44243-201ENSMUST00000204323 692 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Ceacam-ps1-201ENSMUST00000205380 794 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Gm44911-201ENSMUST00000208436 1062 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Gm45241-201ENSMUST00000211237 634 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 AC154295.1-201ENSMUST00000217210 621 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Gm32443-201ENSMUST00000217880 707 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Olfr687-202ENSMUST00000218046 1004 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Gm36172-201ENSMUST00000219852 723 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Mphosph6-201ENSMUST00000034303 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Uqcrh-201ENSMUST00000050580 402 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Uqcrh-202ENSMUST00000078676 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Nme5-201ENSMUST00000079287 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Olfr1265-201ENSMUST00000080311 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Olfr461-201ENSMUST00000089490 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Gm45179-201ENSMUST00000208452 4337 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Gm28440-201ENSMUST00000186328 1499 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Pola1-201ENSMUST00000006856 5346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Kcnip4-208ENSMUST00000176978 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Gm37769-201ENSMUST00000193753 2369 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Fam26d-202ENSMUST00000218239 3075 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Serpina9-201ENSMUST00000058464 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Prox1-202ENSMUST00000175916 7913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Gm15583-201ENSMUST00000116191 3510 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Catspere1-201ENSMUST00000194528 2949 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Tinag-201ENSMUST00000034911 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 1700007E05Rik-201ENSMUST00000186196 1513 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Krt39-201ENSMUST00000076948 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Foxp1-206ENSMUST00000113326 7029 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Pira2-201ENSMUST00000108615 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Gm15922-201ENSMUST00000118068 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Rps15a-207ENSMUST00000172457 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Wac-202ENSMUST00000092112 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 4930525G20Rik-201ENSMUST00000181912 2987 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Kcnc2-202ENSMUST00000218445 4033 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Gm38218-201ENSMUST00000193555 4689 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Clca4a-201ENSMUST00000029923 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Gm15182-201ENSMUST00000120832 1676 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Morc2b-202ENSMUST00000131954 3857 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Skint8-201ENSMUST00000106572 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Gm11976-201ENSMUST00000119236 295 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Gm11928-201ENSMUST00000119323 437 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Gm14300-201ENSMUST00000120800 946 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Pogk-201ENSMUST00000127596 769 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Gm16116-201ENSMUST00000159472 430 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Gm28041-201ENSMUST00000166080 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Anp32e-207ENSMUST00000170125 413 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Obox2-203ENSMUST00000174076 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Gm20429-202ENSMUST00000174168 820 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Vmn2r-ps86-201ENSMUST00000174812 871 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Gm22701-201ENSMUST00000175371 291 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Gm25193-201ENSMUST00000176615 97 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Gm25442-201ENSMUST00000177270 92 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Scgb2b30-201ENSMUST00000187013 336 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Gm28514-201ENSMUST00000187488 450 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Gm28807-201ENSMUST00000187799 471 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Gm29008-201ENSMUST00000189387 298 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Gm29160-201ENSMUST00000190094 699 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Scgb2b10-201ENSMUST00000191403 318 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 1700039M15Rik-201ENSMUST00000195377 1120 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Gm4410-201ENSMUST00000199349 686 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Rps4x-ps-201ENSMUST00000199852 793 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Gm44603-201ENSMUST00000206820 367 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Gm45156-201ENSMUST00000207255 439 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Gm45072-201ENSMUST00000208673 929 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Gm3776-201ENSMUST00000217203 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Gm9293-201ENSMUST00000223096 306 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 CT025538.1-201ENSMUST00000223638 369 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 AC129219.1-201ENSMUST00000224336 448 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 AC158388.1-201ENSMUST00000225441 256 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 AC154738.3-201ENSMUST00000227953 409 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms