Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Rpl31-206ENSMUST00000195123 356 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm36932-201ENSMUST00000195226 929 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 S100a6-203ENSMUST00000198128 464 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 4933417G07Rik-202ENSMUST00000199732 964 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm9357-201ENSMUST00000207138 805 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm8168-201ENSMUST00000209631 948 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 AC122486.1-201ENSMUST00000221562 196 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 9230112D13Rik-201ENSMUST00000022325 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Olfr1361-201ENSMUST00000055615 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Rpl31-ps4-201ENSMUST00000079114 390 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Rpl31-ps9-201ENSMUST00000086596 378 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Tmem167-203ENSMUST00000161568 8689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Sestd1-202ENSMUST00000102660 8990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Magea5-202ENSMUST00000169540 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Hormad2-203ENSMUST00000109949 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Msantd4-202ENSMUST00000212075 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Dnah17-204ENSMUST00000132685 13612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Vmn2r63-201ENSMUST00000163803 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm7690-201ENSMUST00000190885 1399 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 E330018M18Rik-201ENSMUST00000209455 1383 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Zim3-202ENSMUST00000203365 3226 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Adgre1-202ENSMUST00000086763 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Nudt5-201ENSMUST00000026927 4764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Slc25a40-202ENSMUST00000170496 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Olfr1440-202ENSMUST00000213657 7588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm5600-202ENSMUST00000211589 2331 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Usp14-202ENSMUST00000116669 2019 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Mum1l1-201ENSMUST00000113041 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 AC105407.2-205ENSMUST00000224680 2733 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Itih5-201ENSMUST00000026886 7900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Lama2-201ENSMUST00000092639 9614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Zdhhc11-201ENSMUST00000091493 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Cd59a-203ENSMUST00000168176 1806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Fam135a-208ENSMUST00000187752 5194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Olfr1346-203ENSMUST00000215302 4525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm44895-201ENSMUST00000206670 1538 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Smc1a-201ENSMUST00000045312 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Dnah10-201ENSMUST00000058440 14038 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Il15ra-210ENSMUST00000128156 1624 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Igkv12-44-201ENSMUST00000103367 401 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Tdpx-ps1-201ENSMUST00000117372 597 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm13137-201ENSMUST00000118035 345 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Vamp7-ps-201ENSMUST00000120334 655 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm12249-201ENSMUST00000132323 719 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm12860-201ENSMUST00000148457 957 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Six3os1-204ENSMUST00000161688 567 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gml-202ENSMUST00000164026 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm24369-201ENSMUST00000175387 96 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Fam47e-207ENSMUST00000176621 746 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm27207-201ENSMUST00000184995 878 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm27782-201ENSMUST00000185059 199 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm37355-201ENSMUST00000193345 606 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 4930590H14Rik-201ENSMUST00000193999 551 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm30676-202ENSMUST00000214464 793 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 AC132384.6-201ENSMUST00000218976 1206 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm31763-203ENSMUST00000219739 1025 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 AC121569.2-201ENSMUST00000222557 574 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Olfr429-201ENSMUST00000060693 943 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm6887-201ENSMUST00000080945 482 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm22053-201ENSMUST00000083394 200 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 AC129308.2-203ENSMUST00000224109 2385 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Tph1-201ENSMUST00000049298 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Zfp934-208ENSMUST00000222429 1653 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Zfp473-204ENSMUST00000120798 3559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Kcnj15-202ENSMUST00000113854 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Rdh11-203ENSMUST00000161204 3262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm35439-201ENSMUST00000200051 4809 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Psg17-201ENSMUST00000004655 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 4930402F06Rik-202ENSMUST00000113010 1372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Itga1-201ENSMUST00000061673 10967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Klhl13-203ENSMUST00000115316 3064 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Zc3h11a-204ENSMUST00000191896 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Ikzf5-201ENSMUST00000046306 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Mapk10-201ENSMUST00000086854 6630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 AC162301.1-201ENSMUST00000228785 1542 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm42523-201ENSMUST00000199378 2872 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Dnajc18-201ENSMUST00000025208 5169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 BC053393-201ENSMUST00000050937 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Btnl10-202ENSMUST00000069941 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm14548-201ENSMUST00000070639 2128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 4930511M06Rik-203ENSMUST00000137603 2651 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Dock9-208ENSMUST00000212376 8107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 CT009696.4-202ENSMUST00000213560 2248 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm44626-201ENSMUST00000207035 2715 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 1700014D04Rik-203ENSMUST00000180139 3231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Synj2-204ENSMUST00000115785 3778 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Ighv2-7-201ENSMUST00000103456 355 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm14070-201ENSMUST00000120773 428 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 C230035I16Rik-201ENSMUST00000141543 623 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 4930412L05Rik-202ENSMUST00000146501 1241 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm26321-201ENSMUST00000157740 242 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Mir8105-201ENSMUST00000184718 89 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 1700003I22Rik-201ENSMUST00000186048 424 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm37526-201ENSMUST00000194640 619 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm34333-201ENSMUST00000200363 669 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm44548-201ENSMUST00000208929 192 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm45279-201ENSMUST00000210315 391 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms