Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 1700003P14Rik-201ENSMUST00000185602 1078 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm21292-202ENSMUST00000190329 1225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm6679-201ENSMUST00000191467 1869 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm37518-201ENSMUST00000194930 2603 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm42782-201ENSMUST00000197286 522 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 1700094M23Rik-202ENSMUST00000198047 675 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 AC099934.1-201ENSMUST00000200493 79 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm17822-201ENSMUST00000204307 351 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm44823-201ENSMUST00000204775 1107 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm45122-201ENSMUST00000206376 784 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Cd209d-202ENSMUST00000209176 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 AC124184.1-201ENSMUST00000218167 283 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 AC155709.1-201ENSMUST00000218794 162 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 AC154816.1-201ENSMUST00000222688 634 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 AC168062.1-201ENSMUST00000228048 769 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Cst8-201ENSMUST00000028931 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Sprr2b-201ENSMUST00000061038 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Olfr461-201ENSMUST00000089490 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Pde1c-208ENSMUST00000170774 2132 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Oxgr1-201ENSMUST00000058213 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 AC139941.2-201ENSMUST00000221565 1824 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm40893-201ENSMUST00000220507 1508 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm7690-201ENSMUST00000190885 1399 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm44231-201ENSMUST00000204106 4075 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm6493-201ENSMUST00000159889 1786 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm37372-201ENSMUST00000193577 3311 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 AC158115.1-201ENSMUST00000222830 3182 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm28407-201ENSMUST00000185630 1497 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm28108-201ENSMUST00000186747 1497 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm28218-202ENSMUST00000186782 1498 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm29511-201ENSMUST00000187580 1497 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm28367-201ENSMUST00000187942 1496 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm29549-202ENSMUST00000189569 1497 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Otub2-205ENSMUST00000179684 2890 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 AC121504.1-201ENSMUST00000221385 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Ctnna2-206ENSMUST00000162273 3277 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm20775-201ENSMUST00000100115 1851 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Nek7-203ENSMUST00000187407 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Atp13a5-201ENSMUST00000075806 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Fbln5-203ENSMUST00000222587 2371 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Acp2-201ENSMUST00000002172 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Arl5b-201ENSMUST00000017562 6933 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm25916-201ENSMUST00000104263 131 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm8534-201ENSMUST00000118553 766 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm12447-201ENSMUST00000119110 470 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm14070-201ENSMUST00000120773 428 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm11882-201ENSMUST00000121463 506 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm8577-201ENSMUST00000122420 986 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 A330102I10Rik-201ENSMUST00000130109 501 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Nol12-205ENSMUST00000149580 646 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Csnk2b-209ENSMUST00000174779 632 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm22132-201ENSMUST00000175316 100 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm20738-201ENSMUST00000177666 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm26654-201ENSMUST00000180455 256 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm27042-201ENSMUST00000181109 1097 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 4930471M09Rik-201ENSMUST00000181849 1112 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm28739-201ENSMUST00000185415 696 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm28219-201ENSMUST00000185452 696 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm28542-201ENSMUST00000185545 696 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm28303-201ENSMUST00000185642 747 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm29049-201ENSMUST00000185705 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm29244-201ENSMUST00000185825 696 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm29437-201ENSMUST00000185865 696 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm29412-201ENSMUST00000185869 696 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm28910-201ENSMUST00000185921 696 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
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Rnf6Q9DBU5 Gm28636-201ENSMUST00000186353 696 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
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Rnf6Q9DBU5 Gm28185-201ENSMUST00000186815 694 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
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Rnf6Q9DBU5 Gm28796-201ENSMUST00000186905 696 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm29659-201ENSMUST00000187063 696 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm28473-201ENSMUST00000187325 696 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm28558-201ENSMUST00000187373 696 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm28682-201ENSMUST00000187430 696 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm28738-201ENSMUST00000187480 696 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Krtdap-203ENSMUST00000187493 420 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm28949-201ENSMUST00000187805 696 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm20816-202ENSMUST00000187846 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm28773-201ENSMUST00000187925 696 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm20809-202ENSMUST00000187943 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm29319-201ENSMUST00000188060 696 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
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Rnf6Q9DBU5 Gm28787-201ENSMUST00000188357 696 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
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Rnf6Q9DBU5 Gm21889-201ENSMUST00000188487 695 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm9114-201ENSMUST00000188558 997 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm29312-201ENSMUST00000188724 696 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm29451-201ENSMUST00000188862 696 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm29637-201ENSMUST00000188877 696 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm29033-201ENSMUST00000189114 696 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
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