Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

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Length 1,640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Gm21256-202ENSMUST00000188881 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Gm28891-202ENSMUST00000189333 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Gm21094-202ENSMUST00000189577 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Gm20792-201ENSMUST00000189765 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Gm28919-201ENSMUST00000190026 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Gm21861-202ENSMUST00000190806 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Gm20819-201ENSMUST00000191091 925 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Gm20871-201ENSMUST00000191322 931 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Gm21865-202ENSMUST00000191443 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Gm30737-201ENSMUST00000192683 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Gm35134-201ENSMUST00000194086 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 AC164618.3-201ENSMUST00000224863 681 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Olfr1509-201ENSMUST00000045066 1010 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Olfr734-201ENSMUST00000050928 1033 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Tas2r119-201ENSMUST00000057633 1006 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Gm13856-201ENSMUST00000126498 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Zfp882-201ENSMUST00000110002 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Frmd4a-219ENSMUST00000177457 6538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Psg22-202ENSMUST00000108481 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Psg22-203ENSMUST00000208221 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Psg22-201ENSMUST00000051973 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Gm43323-201ENSMUST00000202328 4258 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Vmn1r84-204ENSMUST00000227427 2880 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Pcyt1b-202ENSMUST00000113933 4867 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Pcyt1b-201ENSMUST00000045898 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Gm31805-201ENSMUST00000211921 4031 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Olfr1508-202ENSMUST00000206520 5791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Ccdc14-201ENSMUST00000023532 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Tns1-208ENSMUST00000187584 9916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Igkv9-120-201ENSMUST00000103316 353 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Gm25917-201ENSMUST00000104267 130 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Gm13428-201ENSMUST00000117540 365 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Gm7058-201ENSMUST00000119209 902 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Gm12768-201ENSMUST00000120055 759 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Gm14237-201ENSMUST00000122080 430 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Gm12569-202ENSMUST00000126189 796 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Gm16144-201ENSMUST00000131093 827 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Gm11731-201ENSMUST00000139704 670 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Gm15217-202ENSMUST00000141358 347 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Gm5692-201ENSMUST00000187254 1057 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 4930500F04Rik-202ENSMUST00000202156 251 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Gml-201ENSMUST00000096400 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Gm37518-201ENSMUST00000194930 2603 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Usp29-201ENSMUST00000054055 2610 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Kif5a-202ENSMUST00000217895 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Aadac-201ENSMUST00000029325 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Cntnap4-202ENSMUST00000118171 4860 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Gm38036-201ENSMUST00000194586 3564 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Polr2a-201ENSMUST00000058470 6740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Tirap-201ENSMUST00000175765 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Setd7-201ENSMUST00000037141 7411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Tgfbr1-203ENSMUST00000107725 1713 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Zc3h11a-201ENSMUST00000027736 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Gm10744-201ENSMUST00000220184 2706 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Iqch-202ENSMUST00000080527 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Lnpep-201ENSMUST00000041047 5181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Marf1-201ENSMUST00000090300 7765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Gm26079-201ENSMUST00000104066 133 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
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Rnf17Q99MV7 S100g-201ENSMUST00000038769 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Rnf17Q99MV7 C030029H02Rik-202ENSMUST00000210356 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Rnf17Q99MV7 Rbpj-208ENSMUST00000201912 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Dsg1b-201ENSMUST00000076737 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Ddr2-202ENSMUST00000170800 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Bglap3-202ENSMUST00000107542 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Olfr1247-203ENSMUST00000216424 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Olfr63-203ENSMUST00000217023 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 AC121793.2-201ENSMUST00000217127 2728 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 AC122356.1-202ENSMUST00000227328 2758 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Mup19-202ENSMUST00000107477 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Gm21103-201ENSMUST00000112737 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Gm13114-201ENSMUST00000117605 106 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Anapc1-201ENSMUST00000014499 8942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Gm13619-201ENSMUST00000155722 2138 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Gm16164-201ENSMUST00000160078 468 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Gm3047-201ENSMUST00000164069 822 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Gm3029-201ENSMUST00000168306 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Vmn2r85-201ENSMUST00000171811 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Gm22548-201ENSMUST00000174899 78 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Gm19560-201ENSMUST00000177510 514 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Gm27972-201ENSMUST00000184720 137 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Ighv5-19-201ENSMUST00000193466 297 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Gm37068-201ENSMUST00000195168 640 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Ghrl-202ENSMUST00000203363 400 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Olfr1532-ps1-202ENSMUST00000207492 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Olfr452-203ENSMUST00000215719 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Mnd1-ps-202ENSMUST00000224435 2574 ntBASIC10□□□□□ -0.81
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