Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Gm42930-201ENSMUST00000200872 3260 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Add3-203ENSMUST00000111741 4520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 1700014D04Rik-203ENSMUST00000180139 3231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm15316-201ENSMUST00000121082 421 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm12181-201ENSMUST00000121448 531 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm15096-201ENSMUST00000121918 878 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm15743-201ENSMUST00000129645 242 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 AC122263.2-201ENSMUST00000145909 586 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm10660-201ENSMUST00000148610 1203 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 A430048G15Rik-201ENSMUST00000149965 627 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm13839-201ENSMUST00000151639 506 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm25722-201ENSMUST00000157498 279 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm22728-201ENSMUST00000158087 129 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm26025-201ENSMUST00000158655 271 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Vmn1r-ps78-201ENSMUST00000178185 924 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Vmn1r-ps76-201ENSMUST00000179492 924 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm23945-201ENSMUST00000179609 92 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm27001-201ENSMUST00000182252 936 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm17750-201ENSMUST00000182477 529 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Sbp-206ENSMUST00000183155 882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm29048-201ENSMUST00000185342 615 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm29403-201ENSMUST00000185491 615 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm28234-201ENSMUST00000185657 615 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm28248-201ENSMUST00000186093 615 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm29633-202ENSMUST00000186217 615 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm28829-201ENSMUST00000186231 615 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 1700028B04Rik-201ENSMUST00000186274 555 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm28261-201ENSMUST00000186417 615 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm28815-201ENSMUST00000186751 615 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm28608-201ENSMUST00000186860 615 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm28122-201ENSMUST00000187088 615 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm28420-201ENSMUST00000187340 615 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm28106-201ENSMUST00000187640 615 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm28698-201ENSMUST00000187734 615 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm29224-201ENSMUST00000187965 615 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm29189-201ENSMUST00000188018 615 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm29476-201ENSMUST00000188397 615 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm29505-201ENSMUST00000188424 615 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm28125-201ENSMUST00000188470 615 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm29391-201ENSMUST00000188545 615 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm9114-201ENSMUST00000188558 997 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm29280-201ENSMUST00000188571 615 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm28349-201ENSMUST00000188590 615 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm29652-201ENSMUST00000188622 615 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm28819-206ENSMUST00000188816 615 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm29079-201ENSMUST00000188875 615 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm28213-201ENSMUST00000189183 615 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm21301-201ENSMUST00000189476 699 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm29382-201ENSMUST00000189549 615 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm29377-205ENSMUST00000189603 615 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm28327-201ENSMUST00000189638 615 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm28790-201ENSMUST00000189642 615 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm28907-201ENSMUST00000189700 615 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm29586-207ENSMUST00000189745 615 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm29115-201ENSMUST00000189870 615 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm28366-201ENSMUST00000190147 615 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm29212-201ENSMUST00000190384 615 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm29533-201ENSMUST00000190403 615 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm28162-201ENSMUST00000190545 615 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm29030-201ENSMUST00000190848 615 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm28742-201ENSMUST00000191001 615 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm28899-201ENSMUST00000191161 615 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm29567-201ENSMUST00000191188 615 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm28222-201ENSMUST00000191210 615 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm28776-201ENSMUST00000191282 615 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm29306-201ENSMUST00000191366 615 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm29618-201ENSMUST00000191423 615 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm28136-210ENSMUST00000191432 615 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm29251-201ENSMUST00000191480 615 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm28658-201ENSMUST00000191532 615 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm32180-201ENSMUST00000192415 615 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
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Prpf39Q8K2Z2 Gm37270-201ENSMUST00000194277 330 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
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Prpf39Q8K2Z2 Gm37148-201ENSMUST00000195097 716 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm34274-201ENSMUST00000195825 615 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Cd209d-202ENSMUST00000209176 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm45335-201ENSMUST00000210618 401 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
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Prpf39Q8K2Z2 AC131660.1-201ENSMUST00000215630 1062 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 AC150661.1-201ENSMUST00000222563 495 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm2139-201ENSMUST00000222569 1075 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Sry-201ENSMUST00000091178 1188 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Slc17a3-204ENSMUST00000166467 4336 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Sbf2-208ENSMUST00000166020 5481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Mbd4-202ENSMUST00000122816 2415 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm17203-201ENSMUST00000164379 4017 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Ddx24-201ENSMUST00000044923 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Cyp2c67-201ENSMUST00000067328 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Ranbp6-201ENSMUST00000099525 4575 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm19272-202ENSMUST00000185181 2217 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm44186-201ENSMUST00000204118 2752 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Usp14-202ENSMUST00000116669 2019 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Cxcr2-202ENSMUST00000106899 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 A130050O07Rik-201ENSMUST00000191963 3023 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Adgrf5-206ENSMUST00000226087 4954 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm28173-201ENSMUST00000191190 1496 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm45843-201ENSMUST00000212317 4597 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm37429-201ENSMUST00000193807 1799 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
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