Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Soat1-207ENSMUST00000189661 8371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Gm15930-201ENSMUST00000156603 2037 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Elmo1-202ENSMUST00000180626 2020 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Nlrp3-202ENSMUST00000101148 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Gm28818-201ENSMUST00000187553 2989 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Aph1c-202ENSMUST00000169282 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Slc15a2-208ENSMUST00000165531 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 AC163660.4-201ENSMUST00000224983 2171 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Gm3752-201ENSMUST00000164366 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Smarca2-246ENSMUST00000209085 1841 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Cd44-207ENSMUST00000111194 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Aass-201ENSMUST00000031707 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Csmd1-201ENSMUST00000082104 14182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Gm4847-201ENSMUST00000046662 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Gm20754-202ENSMUST00000192642 1357 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Fam49a-202ENSMUST00000069066 9452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Gm31562-201ENSMUST00000213973 2747 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Gm20877-201ENSMUST00000100105 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Gm22781-201ENSMUST00000104083 137 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Gm25498-201ENSMUST00000104424 129 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Gm13156-201ENSMUST00000118348 321 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Tm6sf1-202ENSMUST00000119543 1066 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Gm6142-201ENSMUST00000120290 325 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Gm13940-201ENSMUST00000121023 301 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Gm16093-201ENSMUST00000141455 392 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Gm15265-202ENSMUST00000143287 814 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Gm12227-201ENSMUST00000147847 563 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 1700086P04Rik-201ENSMUST00000149472 1009 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Erich2os-201ENSMUST00000150702 608 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Gm12526-201ENSMUST00000154462 615 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Gm22642-201ENSMUST00000175352 252 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Gm25617-201ENSMUST00000179548 133 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Gm20917-201ENSMUST00000179922 990 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Gm28289-201ENSMUST00000189331 315 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Gm25617-202ENSMUST00000198387 132 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Gm44176-201ENSMUST00000204336 276 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Gm30694-201ENSMUST00000209278 1230 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 4930471E15Rik-201ENSMUST00000221147 626 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Gm10126-201ENSMUST00000221732 168 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 AC132239.1-201ENSMUST00000223157 773 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 CT030238.3-201ENSMUST00000227352 875 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Cxcl13-201ENSMUST00000023840 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Nr3c2-201ENSMUST00000034031 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Olfr922-201ENSMUST00000051004 1132 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Pla2g12a-202ENSMUST00000061165 476 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Gm37535-201ENSMUST00000194442 2365 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Dzank1-204ENSMUST00000163701 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Vps8-207ENSMUST00000122235 2521 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Tex28-202ENSMUST00000114328 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Gm37621-201ENSMUST00000194716 5531 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Mndal-201ENSMUST00000111210 1907 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Zfp280d-203ENSMUST00000183410 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 AC135083.2-201ENSMUST00000228599 1456 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Pde1c-207ENSMUST00000168944 2126 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Ranbp6-201ENSMUST00000099525 4575 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Oxsm-203ENSMUST00000112625 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Gm10568-201ENSMUST00000193244 1634 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Vmn1r90-209ENSMUST00000227855 7362 ntAPPRIS P2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Ms4a1-201ENSMUST00000169159 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Gm15229-201ENSMUST00000146636 1398 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Gm3072-201ENSMUST00000167712 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 AC107742.1-201ENSMUST00000227769 1390 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Rnase4-201ENSMUST00000022428 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Gm15448-205ENSMUST00000189095 1905 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Ampd1-201ENSMUST00000090715 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Olfr1278-203ENSMUST00000213727 6744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Pcdh15-234ENSMUST00000191854 9104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Gm38070-201ENSMUST00000191850 6480 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Olfr1513-202ENSMUST00000215147 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Psg21-202ENSMUST00000182128 2066 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Psg21-201ENSMUST00000094793 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Chil6-201ENSMUST00000029510 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Gm13137-201ENSMUST00000118035 345 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Gm14485-201ENSMUST00000119489 493 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Gm24057-201ENSMUST00000158616 302 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Gm21970-201ENSMUST00000160764 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Gm17212-201ENSMUST00000166666 259 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Gm19480-201ENSMUST00000185547 667 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 4930556G22Rik-201ENSMUST00000185689 741 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 4930568A12Rik-202ENSMUST00000188292 926 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Gm28952-201ENSMUST00000189285 681 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 1700123O21Rik-201ENSMUST00000190515 677 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Platr10-201ENSMUST00000190602 1026 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Fcer1a-202ENSMUST00000193017 826 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Gm37152-201ENSMUST00000193369 1175 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Fcer1g-203ENSMUST00000193973 683 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Gm8924-201ENSMUST00000197405 1132 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Gm43656-201ENSMUST00000197882 434 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Gm21040-201ENSMUST00000199493 1132 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Gm42581-201ENSMUST00000201774 966 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Gm29154-205ENSMUST00000213325 1112 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Gm18591-201ENSMUST00000220568 763 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 AC187103.4-201ENSMUST00000225399 300 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Cst8-201ENSMUST00000028931 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Olfr862-201ENSMUST00000073765 1035 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Tcl1b2-201ENSMUST00000081379 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 n-R5s169-201ENSMUST00000083110 120 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Sfrp1Q8C4U3 Gm16020-201ENSMUST00000084281 210 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 338.3 ms