Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm12713-201ENSMUST00000118404 764 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Mgst1-203ENSMUST00000120230 1027 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 4930455G09Rik-201ENSMUST00000126231 630 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm15520-201ENSMUST00000132097 1203 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Glrx2-206ENSMUST00000145969 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Cnih1-202ENSMUST00000146629 789 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm13629-202ENSMUST00000152740 645 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Zfp652os-201ENSMUST00000155531 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm14061-201ENSMUST00000155923 1007 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm22687-201ENSMUST00000158301 105 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm17511-201ENSMUST00000172206 342 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Mir3100-201ENSMUST00000174918 65 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Cyp2c53-ps-201ENSMUST00000175649 897 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm27209-201ENSMUST00000183834 898 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Ighv1-10-201ENSMUST00000194372 355 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm42744-201ENSMUST00000196517 2147 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm44306-201ENSMUST00000203058 203 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 4930557K07Rik-201ENSMUST00000205110 363 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm8952-201ENSMUST00000206828 1102 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 AC166052.1-201ENSMUST00000217028 397 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 AC113125.2-201ENSMUST00000226837 362 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 AC168062.1-201ENSMUST00000228048 769 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Npm2-201ENSMUST00000062629 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm9761-201ENSMUST00000075650 492 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1383-201ENSMUST00000077143 940 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm10165-201ENSMUST00000217666 2380 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm45117-201ENSMUST00000207250 1774 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm10723-201ENSMUST00000195366 6918 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Ckap5-203ENSMUST00000111337 6384 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm7982-201ENSMUST00000101011 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm6351-201ENSMUST00000101021 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm7682-201ENSMUST00000098289 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm43637-201ENSMUST00000202206 2926 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Ifi207-201ENSMUST00000042610 3422 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Txndc16-207ENSMUST00000147853 2816 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Siae-202ENSMUST00000213126 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 9230020A06Rik-201ENSMUST00000151841 2051 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r-ps54-202ENSMUST00000150147 2952 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 AA792892-202ENSMUST00000202253 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Olfr281-202ENSMUST00000217517 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 AC122828.2-201ENSMUST00000222511 2880 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Cct8-203ENSMUST00000175977 1470 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm11290-204ENSMUST00000224688 3042 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm37342-201ENSMUST00000194588 4965 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Lgi1-209ENSMUST00000199812 2262 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Foxp2-209ENSMUST00000131414 1381 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm43788-201ENSMUST00000201539 2417 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Wdr66-206ENSMUST00000163092 4009 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm10220-201ENSMUST00000088236 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm3286-203ENSMUST00000201629 1945 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1366-203ENSMUST00000205976 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Zfp933-201ENSMUST00000105718 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Mir711-201ENSMUST00000102188 82 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm23192-201ENSMUST00000102434 96 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Hist1h4f-201ENSMUST00000102971 391 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Hist1h4h-201ENSMUST00000102972 470 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm23323-201ENSMUST00000104471 133 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Zfp966-202ENSMUST00000109018 733 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Zfp968-202ENSMUST00000109048 733 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm7785-201ENSMUST00000117121 892 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm12875-201ENSMUST00000118745 344 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm13858-201ENSMUST00000118862 671 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm13521-201ENSMUST00000118922 866 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm15836-201ENSMUST00000119952 793 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm15644-201ENSMUST00000121764 387 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm15857-201ENSMUST00000133476 789 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gad1os-201ENSMUST00000151851 889 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm28041-201ENSMUST00000166080 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Commd3-212ENSMUST00000171845 938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm5205-201ENSMUST00000182253 1003 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm20587-201ENSMUST00000186367 1186 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm29561-201ENSMUST00000187838 631 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 A930005N03Rik-201ENSMUST00000194920 1247 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm43310-201ENSMUST00000198975 820 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm45196-201ENSMUST00000206751 825 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1295-201ENSMUST00000207283 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm45478-201ENSMUST00000209472 211 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm5791-201ENSMUST00000220840 489 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 CT009742.1-201ENSMUST00000222507 702 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm8075-202ENSMUST00000223088 682 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 CT030705.2-201ENSMUST00000225301 556 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 AC116487.1-201ENSMUST00000227033 339 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Olfr530-201ENSMUST00000074177 1080 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm28392-201ENSMUST00000077630 393 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1131-201ENSMUST00000090712 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Trpm3-203ENSMUST00000087576 6740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Zc3h12c-202ENSMUST00000213645 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Enpp2-202ENSMUST00000167541 2664 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Dock2-203ENSMUST00000101365 3785 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Lifr-204ENSMUST00000226471 3392 ntAPPRIS P3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 AC121997.2-201ENSMUST00000228095 2294 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm3896-201ENSMUST00000176020 4094 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Mrpl1-201ENSMUST00000036437 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r203-203ENSMUST00000228889 8213 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Herc2-203ENSMUST00000205303 14403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm45548-201ENSMUST00000210076 3167 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Tnfaip3-202ENSMUST00000105527 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Epha4-204ENSMUST00000188797 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
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