Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 4933413J09Rik-201ENSMUST00000022427 899 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 AC138765.3-201ENSMUST00000227981 423 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Tmed6-201ENSMUST00000034393 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Cetn1-201ENSMUST00000062769 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Snora21-201ENSMUST00000082967 137 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Olfr1338-201ENSMUST00000084315 942 ntAPPRIS P2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Vmn1r198-201ENSMUST00000091733 903 ntAPPRIS P2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Gm10283-201ENSMUST00000093494 354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Zim1-202ENSMUST00000122432 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Cntn4-202ENSMUST00000089208 5179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Plekhg1-201ENSMUST00000042438 7190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Tmem56-201ENSMUST00000029777 6248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 4933431G14Rik-201ENSMUST00000205571 1670 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Gm6356-201ENSMUST00000166618 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Zfp37-205ENSMUST00000221329 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Ppip5k2-205ENSMUST00000171129 3425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Cx3cr1-202ENSMUST00000177637 3156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Gm38128-201ENSMUST00000192085 3250 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Csn2-206ENSMUST00000197422 1329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 1810018F18Rik-202ENSMUST00000189546 1447 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Vmn1r220-205ENSMUST00000228239 7849 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Gm37079-201ENSMUST00000194114 2135 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Gm43088-201ENSMUST00000197530 2347 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Gm32717-201ENSMUST00000219147 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Gm32802-201ENSMUST00000219565 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 AC155634.1-201ENSMUST00000221687 2706 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Nmur2-201ENSMUST00000037682 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 AC153501.1-201ENSMUST00000218156 1860 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Gm28311-201ENSMUST00000185236 1497 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Gm28549-202ENSMUST00000191354 1497 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Olfr1336-202ENSMUST00000214301 6882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Gm1587-201ENSMUST00000100372 372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Tcrg-V1-201ENSMUST00000103564 374 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Mgst1-202ENSMUST00000118091 1030 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Gm12740-201ENSMUST00000118794 308 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Mgst1-203ENSMUST00000120230 1027 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Gm11809-201ENSMUST00000120923 950 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Gm12152-201ENSMUST00000122465 684 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Cnih1-202ENSMUST00000146629 789 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 4933427D06Rik-202ENSMUST00000153517 522 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Gm8895-201ENSMUST00000172300 1223 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Gm7031-201ENSMUST00000173709 919 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Tnfsf10-202ENSMUST00000174840 989 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Gm26595-201ENSMUST00000181585 484 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 4930467D21Rik-202ENSMUST00000181724 570 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Gm28782-201ENSMUST00000185980 414 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Gm37392-201ENSMUST00000192098 516 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 9530018H14Rik-201ENSMUST00000192253 1243 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Gm8925-201ENSMUST00000197212 763 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Gm8182-201ENSMUST00000197863 769 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Gm17768-201ENSMUST00000201257 378 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Gm43263-201ENSMUST00000201619 560 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Gm39059-201ENSMUST00000209160 424 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 AC132384.10-201ENSMUST00000217862 1204 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 RMST_1.1-213ENSMUST00000220288 792 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Scn8a-202ENSMUST00000096198 1072 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Rhox4b-201ENSMUST00000096458 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Rpl27-ps3-201ENSMUST00000097682 475 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Olfr703-201ENSMUST00000098142 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Tead1-202ENSMUST00000069256 9480 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Txndc16-207ENSMUST00000147853 2816 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Tmprss11b-201ENSMUST00000038448 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Siae-202ENSMUST00000213126 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Rapgef6-204ENSMUST00000108894 3475 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Pum2-203ENSMUST00000111123 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Gm10310-202ENSMUST00000213667 4661 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Stc1-201ENSMUST00000014957 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Rnf24-201ENSMUST00000059372 5978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Kcnma1-202ENSMUST00000074983 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Akr1c20-202ENSMUST00000080361 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Ptprd-218ENSMUST00000174180 5694 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Olfr1294-202ENSMUST00000208675 1983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Psg20-202ENSMUST00000108482 1871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 4930553P18Rik-201ENSMUST00000201164 1659 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Ryr3-201ENSMUST00000080673 15422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Vmn2r25-201ENSMUST00000162046 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Vmn1r171-212ENSMUST00000228674 2488 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Gm5087-201ENSMUST00000060526 1921 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Mir760-201ENSMUST00000103257 119 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Gm25608-201ENSMUST00000104021 132 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Gm11928-201ENSMUST00000119323 437 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Zfp740-205ENSMUST00000121206 795 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Gm12976-201ENSMUST00000150171 459 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Vmn2r-ps31-201ENSMUST00000176474 760 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Gm21430-201ENSMUST00000182998 998 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 1810053B23Rik-202ENSMUST00000185364 590 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 4933417E11Rik-201ENSMUST00000188213 1093 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Gm36448-201ENSMUST00000199916 438 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Gm45196-201ENSMUST00000206751 825 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Gm45446-201ENSMUST00000209348 216 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Gm31374-202ENSMUST00000214913 914 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 1700066J03Rik-202ENSMUST00000224280 516 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 AC124686.1-201ENSMUST00000225546 522 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 AC117949.1-201ENSMUST00000225547 419 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 AC136376.1-201ENSMUST00000228496 950 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Olfr384-201ENSMUST00000072993 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Olfr1383-201ENSMUST00000077143 940 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Gm23238-201ENSMUST00000083007 164 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Yipf3Q3UDR8 Gpr15-201ENSMUST00000089318 1290 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms