Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Gm28358-201ENSMUST00000187860 636 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Gm28985-201ENSMUST00000189261 356 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Gm37068-201ENSMUST00000195168 640 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Gm33312-201ENSMUST00000222443 332 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Gm25515-201ENSMUST00000083858 157 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Il1b-201ENSMUST00000028881 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Chil4-201ENSMUST00000082219 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Psg20-202ENSMUST00000108482 1871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Psg17-201ENSMUST00000004655 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Fam60a-209ENSMUST00000203164 2442 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Zkscan8-201ENSMUST00000045228 8805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Ccdc170-202ENSMUST00000138112 3350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Wdfy4-202ENSMUST00000130509 10158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Itk-201ENSMUST00000020664 4272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Ddb1-201ENSMUST00000025649 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Gprasp2-201ENSMUST00000113136 3736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Slc15a1-201ENSMUST00000088386 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Pgbd1-204ENSMUST00000148071 2600 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Akap2-205ENSMUST00000102903 6650 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Ctnnd1-222ENSMUST00000111696 6281 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Gpm6b-202ENSMUST00000112223 4764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Gm13772-201ENSMUST00000118431 317 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Dnah2os-201ENSMUST00000124108 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Gm14950-201ENSMUST00000149500 1155 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Mir199b-201ENSMUST00000175066 110 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Gm29586-201ENSMUST00000185225 1104 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Gm28253-201ENSMUST00000186071 712 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Gm29178-203ENSMUST00000186312 1104 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Gm8241-201ENSMUST00000189286 816 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Gm29624-202ENSMUST00000190185 1104 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Gm29179-209ENSMUST00000190621 1100 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Gm7492-201ENSMUST00000201745 725 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Fkbp1a-ps2-201ENSMUST00000219474 311 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cux1P53564 AC161252.1-201ENSMUST00000225536 467 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cux1P53564 AC164426.1-201ENSMUST00000225745 929 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Clec2g-202ENSMUST00000075789 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Olfr23-201ENSMUST00000092917 978 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cux1P53564 n-R5s58-201ENSMUST00000093682 119 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Rgs8-202ENSMUST00000111810 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Fmn1-209ENSMUST00000161731 4262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Gbp7-202ENSMUST00000171263 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Olfr1351-202ENSMUST00000216030 2489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Gm13490-201ENSMUST00000143870 2409 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Mageb18-202ENSMUST00000113955 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Cldn12-202ENSMUST00000115445 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Gm17751-201ENSMUST00000189132 2004 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Slco1c1-201ENSMUST00000032362 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Smarca2-242ENSMUST00000208751 1846 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Gm5177-202ENSMUST00000183337 3785 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Gm37518-201ENSMUST00000194930 2603 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Slc12a1-203ENSMUST00000110495 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Osbpl9-216ENSMUST00000161363 2356 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Gm5600-202ENSMUST00000211589 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Olfr524-202ENSMUST00000215815 5044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Golph3l-202ENSMUST00000098861 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Ptk2b-208ENSMUST00000178730 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Gm22370-201ENSMUST00000102422 83 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Rpl5-ps2-201ENSMUST00000119057 891 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cux1P53564 2610528A11Rik-201ENSMUST00000179488 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Gm2040-201ENSMUST00000202979 289 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Asf1a-204ENSMUST00000219271 725 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cux1P53564 AC131795.1-201ENSMUST00000219632 426 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cux1P53564 4933433N18Rik-201ENSMUST00000222134 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Arhgdib-201ENSMUST00000032344 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Olfr691-201ENSMUST00000057528 969 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Gm6436-201ENSMUST00000077163 451 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Pum1-205ENSMUST00000105992 5058 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Mettl14-202ENSMUST00000090371 7197 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Tmcc3-203ENSMUST00000117929 3317 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Klf8-202ENSMUST00000112574 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Slc16a14-201ENSMUST00000027422 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Dapp1-203ENSMUST00000136613 2950 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Adam22-206ENSMUST00000115386 9056 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Zfp78-202ENSMUST00000108559 1539 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Gm14635-202ENSMUST00000146535 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Gm7961-201ENSMUST00000201338 1436 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Gm21056-201ENSMUST00000221636 4635 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Igkv9-120-201ENSMUST00000103316 353 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Gm12643-201ENSMUST00000116078 374 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Gm2800-201ENSMUST00000122988 641 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Gm16346-201ENSMUST00000129158 937 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Gm14640-201ENSMUST00000145800 437 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Gm23674-201ENSMUST00000157473 131 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cux1P53564 B230118H07Rik-209ENSMUST00000160722 931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Gm16333-201ENSMUST00000161416 318 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Gm6401-202ENSMUST00000164232 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Gm17079-201ENSMUST00000167231 666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Mir3473g-201ENSMUST00000183494 136 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cux1P53564 4930590H14Rik-201ENSMUST00000193999 551 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Olfr267-201ENSMUST00000059608 944 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cux1P53564 1700109H08Rik-201ENSMUST00000008451 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Olfr519-201ENSMUST00000084752 960 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Daam1-202ENSMUST00000221317 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Olfr1391-202ENSMUST00000215671 3235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Myo15-201ENSMUST00000071880 11769 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Gm37663-201ENSMUST00000191887 2299 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Strada-203ENSMUST00000106867 3386 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cux1P53564 Gm15509-201ENSMUST00000162615 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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