Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm34121-201ENSMUST00000206188 1490 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Ncr1-201ENSMUST00000006792 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Ctage5-202ENSMUST00000069430 2869 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Pcdh15-237ENSMUST00000193361 7881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm9585-201ENSMUST00000219681 1404 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Pde1c-207ENSMUST00000168944 2126 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Pde1c-208ENSMUST00000170774 2132 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm42727-201ENSMUST00000202446 2823 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Irgm1-202ENSMUST00000097271 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm15229-201ENSMUST00000146636 1398 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 E330011O21Rik-204ENSMUST00000210839 1361 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 AC118639.1-203ENSMUST00000228425 2016 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 AC107763.1-202ENSMUST00000225021 2663 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Slc39a12-201ENSMUST00000082290 2675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Olfr930-202ENSMUST00000217208 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Unc13c-201ENSMUST00000075245 6633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Olfr1294-202ENSMUST00000208675 1983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm22671-201ENSMUST00000104420 134 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm24893-201ENSMUST00000122745 369 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm15788-201ENSMUST00000130123 613 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm15217-202ENSMUST00000141358 347 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 1700047F07Rik-202ENSMUST00000143064 463 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Cnih1-202ENSMUST00000146629 789 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm25505-201ENSMUST00000157220 246 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm25770-201ENSMUST00000158566 115 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm22206-201ENSMUST00000158612 116 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Scgb1b28-ps-201ENSMUST00000163647 290 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm24369-201ENSMUST00000175387 96 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Smarca2-204ENSMUST00000175791 946 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm27458-201ENSMUST00000185108 121 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm18254-201ENSMUST00000185699 1204 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm28142-201ENSMUST00000186899 698 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm29343-201ENSMUST00000187887 842 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm20917-202ENSMUST00000188706 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm37585-201ENSMUST00000195440 280 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm22149-202ENSMUST00000196259 137 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Rps4x-ps-201ENSMUST00000199852 793 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm8921-201ENSMUST00000204306 649 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 4933431C10Rik-201ENSMUST00000208973 1266 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Tmem156-206ENSMUST00000212640 1271 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm3428-204ENSMUST00000214488 1020 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm18601-201ENSMUST00000220831 634 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Rida-201ENSMUST00000022946 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Tas2r105-201ENSMUST00000053652 964 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Snora9-201ENSMUST00000082579 133 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm25852-201ENSMUST00000082790 130 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm23238-201ENSMUST00000083007 164 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 n-R5s60-201ENSMUST00000083299 119 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gpr15-201ENSMUST00000089318 1290 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm28874-201ENSMUST00000190917 3134 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Ugt2b38-201ENSMUST00000072818 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Kcnj1-202ENSMUST00000172015 3075 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gsdmc-201ENSMUST00000110125 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm12292-201ENSMUST00000122911 2433 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm45073-201ENSMUST00000207688 4247 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Olfr798-202ENSMUST00000204979 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Nlrp5-201ENSMUST00000015866 3508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Cdh6-201ENSMUST00000036439 8167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Ros1-202ENSMUST00000218452 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm11346-204ENSMUST00000149751 2893 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 AC161247.1-201ENSMUST00000217744 2295 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 AC155243.1-201ENSMUST00000220141 2262 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Oas2-202ENSMUST00000081491 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Sorbs2-231ENSMUST00000171337 5651 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm15731-201ENSMUST00000146887 2195 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Sis-202ENSMUST00000167334 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Olfr1412-202ENSMUST00000190505 3663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm33968-201ENSMUST00000211015 1562 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Pdzph1-201ENSMUST00000025064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Olfr1348-210ENSMUST00000214383 2582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm29220-201ENSMUST00000185862 1501 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm28966-201ENSMUST00000188951 1501 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Olfr1504-202ENSMUST00000209192 1514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 A630072L19Rik-202ENSMUST00000221309 1519 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm26945-201ENSMUST00000183191 2011 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 AU020206-202ENSMUST00000206358 3009 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm14280-201ENSMUST00000138080 1444 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Kcnj16-205ENSMUST00000178798 3678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Bnc2-201ENSMUST00000102820 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm44843-201ENSMUST00000208320 1396 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 AC153143.2-201ENSMUST00000220999 1804 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Xcr1-201ENSMUST00000182350 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Zranb1-205ENSMUST00000215716 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Fam49a-205ENSMUST00000223061 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm19368-201ENSMUST00000221258 4424 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Rfx4-202ENSMUST00000060397 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Nsun4-206ENSMUST00000165493 3920 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm43880-201ENSMUST00000203635 2162 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 AC158537.1-201ENSMUST00000224637 1711 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 AC151530.1-203ENSMUST00000223343 2591 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Ighv5-9-1-201ENSMUST00000103452 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm11880-201ENSMUST00000117612 399 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm13469-201ENSMUST00000118231 350 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm8812-201ENSMUST00000118496 412 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm5759-201ENSMUST00000119203 811 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm13362-201ENSMUST00000137186 839 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 4930405D11Rik-203ENSMUST00000142521 645 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Casp12-204ENSMUST00000151332 1065 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Fcor-201ENSMUST00000159364 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
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