Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Cwf19l1-201ENSMUST00000026218 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Rbmy-201ENSMUST00000100360 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Gm10256-202ENSMUST00000188114 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Gm21708-203ENSMUST00000190283 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cd28P31041 AC122769.1-201ENSMUST00000226930 1714 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Ranbp17-201ENSMUST00000037522 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Tceal1-201ENSMUST00000055104 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cd28P31041 2610203C20Rik-215ENSMUST00000212373 1574 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Fundc2-201ENSMUST00000033541 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Asxl3-201ENSMUST00000097655 11697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cd28P31041 4930544L04Rik-202ENSMUST00000211181 3204 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Slamf7-202ENSMUST00000192024 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Nsrp1-201ENSMUST00000102494 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Gm25614-201ENSMUST00000104013 133 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Fancl-202ENSMUST00000109509 1187 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Gm14755-201ENSMUST00000118037 384 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Gm12321-201ENSMUST00000121485 804 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Gm5270-201ENSMUST00000121506 1002 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Gm26023-201ENSMUST00000122722 313 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cd28P31041 4930403D09Rik-201ENSMUST00000147359 635 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Polr3g-204ENSMUST00000161920 733 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Gm8893-201ENSMUST00000172146 1242 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Gm6726-201ENSMUST00000172786 681 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Esd-203ENSMUST00000175887 809 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Pantr1-203ENSMUST00000176154 514 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Gm26528-201ENSMUST00000181965 283 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Gm28502-201ENSMUST00000189781 476 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Pdc-204ENSMUST00000191228 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Gm37678-201ENSMUST00000192908 1146 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cd28P31041 4930566N20Rik-201ENSMUST00000195173 1199 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Gm43387-201ENSMUST00000196896 1066 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Gm26413-202ENSMUST00000198972 127 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Gm43964-201ENSMUST00000203570 301 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Gm30692-201ENSMUST00000208709 801 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Gm7419-201ENSMUST00000209962 925 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cd28P31041 AC139579.1-201ENSMUST00000214560 606 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cd28P31041 AC153864.1-201ENSMUST00000218482 523 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Gm34215-201ENSMUST00000221599 355 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cd28P31041 AC117769.2-201ENSMUST00000224612 469 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cd28P31041 AC154687.1-201ENSMUST00000224875 677 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cd28P31041 1700123O20Rik-203ENSMUST00000227269 893 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Gm5341-201ENSMUST00000058881 489 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Gm28392-201ENSMUST00000077630 393 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Tial1-211ENSMUST00000165023 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Olfr904-202ENSMUST00000216724 5197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Zfp81-201ENSMUST00000054072 6639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Matr3-205ENSMUST00000186796 1854 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Akr1e1-202ENSMUST00000110691 3288 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Gpr22-203ENSMUST00000176710 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Cfap74-203ENSMUST00000105619 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Vmn1r184-203ENSMUST00000227232 8472 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Vps50-203ENSMUST00000170873 3687 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Gm38156-201ENSMUST00000194601 2260 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Trappc13-203ENSMUST00000141557 3502 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Ctage5-217ENSMUST00000176892 2784 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Cyp2j8-201ENSMUST00000124729 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Gm43029-201ENSMUST00000201829 1535 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Gm37877-201ENSMUST00000191630 2709 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Gm44215-201ENSMUST00000204910 2711 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Pcdh11x-203ENSMUST00000113364 4454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Gm9603-201ENSMUST00000165814 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Gm3542-201ENSMUST00000169362 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Gm44436-201ENSMUST00000204200 1494 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Cenpe-201ENSMUST00000062893 7910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Olfr62-202ENSMUST00000213189 2570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Vmn2r111-201ENSMUST00000092491 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Zfp976-201ENSMUST00000098503 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Tdrkh-205ENSMUST00000197495 2476 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Gm42705-201ENSMUST00000200176 2465 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Sorbs2-209ENSMUST00000132139 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Gm20749-201ENSMUST00000186319 3492 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Gm9226-201ENSMUST00000188352 3489 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Tfb1m-201ENSMUST00000041003 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Dnhd1-203ENSMUST00000145988 14536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Gm36660-201ENSMUST00000218323 3871 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Zfp2-202ENSMUST00000109129 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Gm26079-201ENSMUST00000104066 133 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Gm14645-201ENSMUST00000118597 417 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Gm8916-201ENSMUST00000119732 949 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Gm15049-201ENSMUST00000120474 463 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Gm15224-201ENSMUST00000120501 388 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Dnah2os-201ENSMUST00000124108 859 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cd28P31041 2610035D17Rik-204ENSMUST00000150712 947 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Gm25962-201ENSMUST00000157173 168 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Gm25455-201ENSMUST00000157946 325 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Spink10-205ENSMUST00000162365 1076 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Spint4-201ENSMUST00000017454 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Gm5181-201ENSMUST00000183140 971 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Gm5261-201ENSMUST00000185860 713 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Gm38256-201ENSMUST00000192097 950 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Gm43157-201ENSMUST00000198223 412 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cd28P31041 9530013L04Rik-201ENSMUST00000203393 782 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Gm44722-201ENSMUST00000206473 436 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Gm30196-201ENSMUST00000208957 160 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Gm2774-201ENSMUST00000213650 1165 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Olfr643-202ENSMUST00000217217 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cd28P31041 AC105167.1-201ENSMUST00000219966 253 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cd28P31041 AC163684.1-201ENSMUST00000223766 927 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cd28P31041 AC121542.2-201ENSMUST00000227529 400 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cd28P31041 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
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