Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Epgn-201ENSMUST00000041516 1760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm15093-201ENSMUST00000179021 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RxraP28700 Klra1-201ENSMUST00000032288 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
RxraP28700 Cyp2b23-201ENSMUST00000077356 2189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RxraP28700 Akr1c20-202ENSMUST00000080361 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
RxraP28700 Ttc21b-202ENSMUST00000125446 4061 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
RxraP28700 Tor1aip2-202ENSMUST00000065648 2529 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
RxraP28700 AC091783.1-201ENSMUST00000223614 1613 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm33148-201ENSMUST00000210835 7227 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm45163-201ENSMUST00000207606 3987 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
RxraP28700 Olfr1426-203ENSMUST00000217952 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
RxraP28700 Ifi44l-201ENSMUST00000046739 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
RxraP28700 Vmn2r118-201ENSMUST00000168440 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm21698-202ENSMUST00000191203 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
RxraP28700 AC156163.1-201ENSMUST00000215598 3369 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
RxraP28700 AC107232.1-201ENSMUST00000227785 1503 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
RxraP28700 CT010577.1-202ENSMUST00000226187 1903 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm10184-201ENSMUST00000086423 1939 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
RxraP28700 Arhgap15-203ENSMUST00000112824 3118 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
RxraP28700 Cped1-202ENSMUST00000115383 5690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
RxraP28700 RMST_1.1-210ENSMUST00000219606 2891 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
RxraP28700 Mir697-201ENSMUST00000102316 109 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm25083-201ENSMUST00000102319 92 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
RxraP28700 Ighv1-84-201ENSMUST00000103551 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
RxraP28700 Trdv2-2-201ENSMUST00000103678 397 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm26016-201ENSMUST00000104403 129 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
RxraP28700 Olfr1094-201ENSMUST00000105211 1147 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
RxraP28700 Eif3m-202ENSMUST00000111110 817 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm8624-201ENSMUST00000118083 432 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm16044-201ENSMUST00000118475 450 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm13486-201ENSMUST00000119910 282 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm12590-201ENSMUST00000134226 404 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm10157-201ENSMUST00000139408 343 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm22636-201ENSMUST00000158142 275 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm5656-201ENSMUST00000171020 1096 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm4956-202ENSMUST00000178869 672 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm23139-201ENSMUST00000179454 132 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm26528-201ENSMUST00000181965 283 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm5787-201ENSMUST00000183049 1038 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm5066-201ENSMUST00000188479 822 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm29369-201ENSMUST00000190674 615 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm37669-201ENSMUST00000192184 820 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm36935-201ENSMUST00000192526 292 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm18752-201ENSMUST00000192876 608 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm29999-202ENSMUST00000193554 671 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm37190-201ENSMUST00000193580 688 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm33370-201ENSMUST00000195935 489 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
RxraP28700 4930572K03Rik-201ENSMUST00000196713 931 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm42912-201ENSMUST00000197195 716 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm42938-201ENSMUST00000198414 1072 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm3511-201ENSMUST00000199823 204 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm43495-201ENSMUST00000200060 205 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm43893-201ENSMUST00000203362 437 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm44983-201ENSMUST00000208121 463 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm18860-201ENSMUST00000212029 764 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm45739-201ENSMUST00000213094 388 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
RxraP28700 D730003K21Rik-202ENSMUST00000217456 533 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
RxraP28700 AC147245.1-201ENSMUST00000223294 677 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
RxraP28700 AC159188.3-201ENSMUST00000224199 880 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
RxraP28700 AC131997.2-201ENSMUST00000227452 362 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
RxraP28700 AC125405.2-201ENSMUST00000227862 383 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
RxraP28700 AC130219.2-201ENSMUST00000228765 807 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
RxraP28700 Olfr101-201ENSMUST00000058046 1039 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
RxraP28700 Olfr1287-201ENSMUST00000075390 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm5528-201ENSMUST00000076314 480 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
RxraP28700 Olfr1360-201ENSMUST00000079135 980 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm37518-201ENSMUST00000194930 2603 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
RxraP28700 Zfp78-203ENSMUST00000207314 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
RxraP28700 Sirpb1c-202ENSMUST00000108349 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm37216-201ENSMUST00000193817 3478 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
RxraP28700 Olfr1441-203ENSMUST00000216506 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
RxraP28700 Lrp1-201ENSMUST00000049149 14888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
RxraP28700 Kif6-207ENSMUST00000162854 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
RxraP28700 Olfr1396-204ENSMUST00000215553 4237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm37945-201ENSMUST00000192536 4367 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm26645-201ENSMUST00000181076 1316 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm30931-202ENSMUST00000211698 1320 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
RxraP28700 Tank-205ENSMUST00000112502 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
RxraP28700 Etv1-203ENSMUST00000160244 2032 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
RxraP28700 Tank-201ENSMUST00000078074 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
RxraP28700 Pcbp2-201ENSMUST00000077037 2868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gpr87-203ENSMUST00000200095 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm26861-201ENSMUST00000180807 5278 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm5886-203ENSMUST00000203983 2613 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
RxraP28700 Trrap-203ENSMUST00000100467 12479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
RxraP28700 Trrap-202ENSMUST00000094120 12456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
RxraP28700 Bglap3-202ENSMUST00000107542 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
RxraP28700 Asap1-206ENSMUST00000175799 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
RxraP28700 Zfp280d-203ENSMUST00000183410 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm42885-201ENSMUST00000200763 4214 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
RxraP28700 Zfp712-201ENSMUST00000167565 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
RxraP28700 Thnsl1-203ENSMUST00000102952 1679 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm25757-201ENSMUST00000103986 123 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
RxraP28700 Uros-202ENSMUST00000106144 1045 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm14893-201ENSMUST00000117904 282 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm14745-201ENSMUST00000118480 1096 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm15538-201ENSMUST00000121410 313 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm13487-201ENSMUST00000122240 864 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm26480-201ENSMUST00000122619 297 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
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